EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-08187 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr21:8579586-8580695 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr21:8579717-8579728GCCAATAAAAC+6.14
HOXB13MA0901.2chr21:8579717-8579728GCCAATAAAAC+6.14
HOXD13MA0909.2chr21:8579717-8579728GCCAATAAAAC+6.14
KLF13MA0657.1chr21:8580450-8580468CAGGAGTGGGCGTGGCCA-6.05
KLF14MA0740.1chr21:8580453-8580467GAGTGGGCGTGGCC-7.19
Klf12MA0742.1chr21:8580452-8580467GGAGTGGGCGTGGCC-6.25
POU1F1MA0784.1chr21:8580124-8580138TTAATTAACATAAT-6.24
POU3F1MA0786.1chr21:8580125-8580137TAATTAACATAA-6.04
POU3F2MA0787.1chr21:8580125-8580137TAATTAACATAA-6.07
POU3F3MA0788.1chr21:8580125-8580138TAATTAACATAAT-6.62
POU4F1MA0790.1chr21:8580411-8580425ATGAATGATTAATG+6.11
SP1MA0079.4chr21:8580454-8580469AGTGGGCGTGGCCAG-7.29
SP3MA0746.2chr21:8580454-8580467AGTGGGCGTGGCC-6.92
SP4MA0685.1chr21:8580452-8580469GGAGTGGGCGTGGCCAG-7.78
SP8MA0747.1chr21:8580454-8580466AGTGGGCGTGGC-7.22
Enhancer Sequence
TAAGTTAATT TACTCTCAGT GCTAATTAAG TAATTGATGG TTCATTCTGC TGTTGCGACC 60
ACTGATAAAT CAGAAACTAA GCCAAAGTGA GCAAGTAAGT GTGTGTTGTC TTCTCAATAG 120
GAAATTTTGT GGCCAATAAA ACACTGCCTA GGGGCGTTCA TATTAATGAG CCCATCTAGA 180
ATCTCACAGC CGGTGCTTTA TTCCAATTGA CCTTTTTTCA CTGGGATTTT ACACTCATGG 240
GAGGTGTTAT GTTTGGTGTT TTTTTTTTTG TCTATTTATT TTTCACCCTC TCCACTTGCT 300
CAGCCCTTAG GTTTCTTATT GGTTTACCAT TCTGTCCATC ATTATGACAG TGTCAGTTCC 360
ACCAATCCCC GGACGAGCCG CAAGGATTTA AAGCCTTAAT CGACCAGTGT GTGGTGTGCG 420
CTCTGCCTCG GCATGCTACT TGTGCTCCAT GCAATTTGTG CTATGCTTCA ACTGTTTAGT 480
GATTTATTAT GTCAGTTTAC TGTGGTAATT CGAGTTTGCT TGTTGAACTT CGTTAGCTTT 540
AATTAACATA ATGTGATGGT TGTTGTGTGA TTCTAAACTA TTGTGATTCT ATAGCTTTGA 600
CCATCTTATC CGGTTTGTTT AAGTTTAGAT TGATGTTTTG TTAGATTAGT TTAAGTGTCT 660
TGCCACCTGT GTATTTTGAG TTTTGTAGTT TAACTAGTTC GGTTGTCATG TACACCGAAG 720
ATCTCGATTT TTATTTGTAT TTCTTTTTGA TGCCTAGTTT AGACTTTAAA GGGCCATGAC 780
ACCCCCCTCT TTCGGTTAAA GTCTACTTCA GAATTTTTTC AAAAGATGAA TGATTAATGG 840
GCGTGGAGCT CCGCGAGCAT CGGGCAGGAG TGGGCGTGGC CAGCAGGGGA GAAGGGGAGC 900
GAATAACTGC TGTTGTCAGT TAGCTCACAA AATGAGACAC AAAGAGGAGA CGCATGAGTT 960
TATAGTTTAC AAAGTTAAAA TGCAAAGAAA TGAACAGTGA TTTAATGCCC TGCTACATTT 1020
GTTATTCGTA ATTTCATATA CAGACAACCA CAATTTATAT CATTATAAAG ATAAGTGTGT 1080
TCGTGTAAAC TATAAATGAG GAATTCTCC 1109