EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-08124 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr21:3889772-3891398 
TF binding sites/motifs
Number: 26             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr21:3890629-3890646ATTAATTAATTAATGGA-6.01
Alx1MA0854.1chr21:3890626-3890643TGAATTAATTAATTAAT+7.27
ArxMA0874.1chr21:3890625-3890642ATGAATTAATTAATTAA+6.04
ArxMA0874.1chr21:3890626-3890643TGAATTAATTAATTAAT-6.7
ArxMA0874.1chr21:3890630-3890647TTAATTAATTAATGGAT-6.95
ArxMA0874.1chr21:3890629-3890646ATTAATTAATTAATGGA+7.17
Lhx3MA0135.1chr21:3890627-3890640GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr21:3890631-3890644TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr21:3890628-3890641AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr21:3890629-3890639ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr21:3890633-3890643ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr21:3890629-3890639ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr21:3890633-3890643ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr21:3889787-3889807GGTTTAGGGTTGGGGTGGGG-6.06
ZNF24MA1124.1chr21:3890219-3890232TAATGAATGAATT-6.17
ZNF24MA1124.1chr21:3890939-3890952CATTCATTCATCT+6.25
ZNF24MA1124.1chr21:3890184-3890197GAATTAATGAATG-6.27
ZNF24MA1124.1chr21:3890557-3890570GAATGAATTAATG-6.2
ZNF24MA1124.1chr21:3890686-3890699GAATGAATGAACA-6.3
ZNF24MA1124.1chr21:3890533-3890546GAATGAATGGATG-6.44
ZNF24MA1124.1chr21:3890647-3890660GAATGAATGGATG-6.44
ZNF24MA1124.1chr21:3890329-3890342GAACGAATGAATG-6.46
ZNF24MA1124.1chr21:3890935-3890948CAGTCATTCATTC+6.52
ZNF24MA1124.1chr21:3890643-3890656GGATGAATGAATG-7.04
ZNF24MA1124.1chr21:3890553-3890566GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr21:3889951-3889964GAATGAATGAATA-7.52
Enhancer Sequence
TTACTGTGAC GGTTGGGTTT AGGGTTGGGG TGGGGCTAGA CGTTAATAAA ATACAACAAA 60
TATGAAATTT AATAAATAAT AGAAATATTT CTGGTTAACT TCCGGCCGCA AACGTATCCG 120
CTCTAGCAAC AACCCTGGGA TAGATGTATT GGACTGATGG ATAGACTTGA TGGATGGTTG 180
AATGAATGAA TAAAGGGGCT GATGGATAAA TAGATTGGTT TCTGGGGGAA TAAATGGATA 240
GATGGGTTTC TGGATGAACA GATGAAGGAA TGAATAAGCG AACGAACAAA TGAGCGGATG 300
AATGAGCGAG CAATGAAATA ATGAATGATT AAATGGACAA TGGATAGATA AACTGATGAA 360
TGAAAGGATG ATGAATAGAT GTATGGACAG ATCGACTGAT GGATGGATGG ATGAATTAAT 420
GAATGAGGAA TGGATTGAGC AATGAAATAA TGAATGAATT ATTGAATGGA CAATGGATTG 480
ATAGATGAAC TGATTGATGG AAGGATGATT AAAAGATGGA TGGCGTGATT GACTGCTGGA 540
TAGATGAACG AATGAAGGAA CGAATGAATG GATTGAGCAA TGAAATAATA AATAAATGAT 600
TAAATACACA ATGGATAGAT AGATGAACTG AGGGATGAAA GGATGATGAA TAGATGGATG 660
GACAGGTTGA CTGTTGGAGA AATGAATGGA TGGATGAAAA GATGAACAAA TTAATGGTTG 720
AATGGACTTG ATGGATGGAA AGATTGACTG AGATGAGCGA TGAATGAATG GATGGATTCA 780
TGAATGAATG AATTAATGGT TGGATGGACT TGATGGATAG ATAGATGGAC TGATGGATGG 840
ATGAATAGTT GGAATGAATT AATTAATTAA TGGATGAATG AATGGATGAT GGATAGAGAG 900
ATGGGTTTCT ATATGAATGA ATGAACAATG AAAGGATGGA TAGATAACCT CATGGATGGA 960
AGGATGACGA ATAAATGAAA TGAGAGATGG ATGAACAGAT GAATGGACCA ATTGATAGAA 1020
TGATGGGTTT CAAGATGAAC GATGAATGAA CATTGATGAA TGAACAGATG AATGCACATA 1080
CATCCATCTC TCTCTTCATC AGTCCATCCA CCTATACATC ATCCTTCCAT CCATCAGATC 1140
ATCTATCCAT CCATTATTTA ATCCAGTCAT TCATTCATCT GTCAATCCAG AAACACATCT 1200
ATCCATTCGT TAAGTTCATC TATTTATCCG TCCATCCATC CAAAGTTTAG TGCAACTATT 1260
TATCTGTCAT TGGATGGATG GATGGATGTA TGGATGGATA GTTGAACTGA TGCATGTAAG 1320
GATGAGATAG ATGCATGGTA AGATGGACTG ATGGAGATAG ATAATGTATG CATATTCTGA 1380
TTGTGCTCAT CATGTGATCT GCAGTGAGTG TTTATAGTAA CAGACGTAAA GCACCAGCAC 1440
AGAAATATGC TACAGAAGAG TGTGAAAGCT TTAAGTATGT TAATGTTTTA GCGTCTGCGA 1500
ACACAGACTC TTCCAAGGAC ACCCTCACAC CTTCCTTCCC TCTCTCTTTC TCACTCTCAC 1560
TCTCACTCTC TCTCTCTCTC TAAGTGGCTC TCTTGAGAAA TAAACCGAGT AAATGTGGGG 1620
ATTGCT 1626