EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-08122 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr21:3881921-3883194 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxa2MA0047.2chr21:3882261-3882273TGTTTACATTGT+6.04
IRF4MA1419.1chr21:3882140-3882155TGGTTTCGGTTTTGG-6.78
IRF5MA1420.1chr21:3882141-3882155GGTTTCGGTTTTGG-6.2
IRF9MA0653.1chr21:3882141-3882156GGTTTCGGTTTTGGT-6.66
Enhancer Sequence
CTTGTTTTGG TGGCAGATCT CGGACACTAC CCGTGTCTGG TCCTGTTTCT GTCTCTGTGT 60
GCGCGCGCGC TGTCGTGGGT GTACGTAGAG TGTGCGCGCT CCTGCTTGAC GCGGCCGCGC 120
GCGCGCTCTG CGCCCCTCAG ACGCGTGCGC TCTTGTACTC GTGTTTGTGT TTTCGTCTGT 180
CAGCAGCGTG GTGTTTCATT CCCAGCGTCT CAGTCTTGTT GGTTTCGGTT TTGGTCGGCG 240
CTGGGATGAA GCATGCATGC TGCATGTGTG AGCGCATGGT GAGTGTTTTC ATTCATCGTG 300
TGCTCGTGTC TTGCGTCTTT TGTCAAAGCA CGTGGCTCGG TGTTTACATT GTGGTCACGT 360
GTTTTTGTCG TGTGCTTCAG TGTTGTGTTA TGTGAGCGCA TGGCTTGTAT TGTCTCTCTG 420
TGTCATGCGC TCTCCCGTCT ATTGTCTAGT CCCACCCTTC TTGTTAACCC ATTATTAGTT 480
AATTGTGTTC ACCTGTGTGT CAATTTACTT TTTGCTTTAT AATCCCCCTC ATGTTTTCAG 540
TCCTTTGCCA GTTCGTTGTC TACACTCCCC GTGTTCCAGC TCCAGTCTTG CCTTGTCCTG 600
TCAGTCCAGC TAAGTTTGTG TGTTTTGTTA ATGTTTTCCC CCTCGGGGTA GTTTGTTTTG 660
CCTTTTTGTT TTATTTGTAC TTTATTATTA ATAAAACCCA ATTATTGTTT GCACTTGAGT 720
CCTCGCTCCT TTTTCCCCTC ACCGACCCTG ACACTACGTC GCCTCCTACA ATACATCCAA 780
GATTTAAATT TAAACTTAAA CACCACTAGC TTCAGCAACA AGACTCTTCA CTTAACTCAG 840
TGATCTATCT CAATAATCAT AATCACACTG TTCTGCTTTG ACCATTATTT TTCCTGCATT 900
CTCCTTCCCC AAAAAATCAA TCCTACATTC TCAGTGCAGC CACTGCTTTT CACACTCTCT 960
AAACTCTGTG TGTGCGTAAG TGTGTGTGGT TTGCTCTTCA GTCACACTTC AGTGAGAGTG 1020
TTTTCCCTCT GCGATTCCCT CATTCAGACT CCACACACAC ACCAACACCA ACACACACTT 1080
CACATCTCCC CATCTGTCCA TACGCACACT TATTTCACCA TCACCAGCTT AGTCAAAATA 1140
AAAGTTTTTT TGCGTGTCCG CGCGAATATA TAAAGTCCAG AGATCATCTA TAAGTGTGCT 1200
TCAAATCAAA GACAAAATCC ACATGTAGGA GAGACTGCAC CAATTTGACC CAACAATTTT 1260
GTTGACATCA TTA 1273