EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-08117 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr21:3485276-3487083 
TF binding sites/motifs
Number: 106             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr21:3486698-3486715ATTAATTAATTAATGGA-6.01
Alx1MA0854.1chr21:3486695-3486712TGAATTAATTAATTAAT+7.27
ArxMA0874.1chr21:3486694-3486711ATGAATTAATTAATTAA+6.04
ArxMA0874.1chr21:3485896-3485913TTAATTAATTAATGAAA-6.05
ArxMA0874.1chr21:3485895-3485912ATTAATTAATTAATGAA+6.09
ArxMA0874.1chr21:3485888-3485905TAAATTAATTAATTAAT-6.19
ArxMA0874.1chr21:3486695-3486712TGAATTAATTAATTAAT-6.7
ArxMA0874.1chr21:3486699-3486716TTAATTAATTAATGGAT-6.95
ArxMA0874.1chr21:3486698-3486715ATTAATTAATTAATGGA+7.17
ArxMA0874.1chr21:3486835-3486852ATGAATTAATTAATGGA+7.58
ArxMA0874.1chr21:3486836-3486853TGAATTAATTAATGGAC-9.08
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3486499-3486517GGAAGGAAGGAAGGAAGA+10.05
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3485504-3485522GGAAGGAAGGAAGGAAGG+10.83
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3485508-3485526GGAAGGAAGGAAGGAAGG+10.83
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3485512-3485530GGAAGGAAGGAAGGAAGG+10.83
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3486495-3486513GGAAGGAAGGAAGGAAGG+10.83
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3486115-3486133TGAATGAAGGAAGGAATC+6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3485621-3485639GGATGGAAGGATGGATGG+6.57
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3486503-3486521GGAAGGAAGGAAGAAATC+7.36
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3486463-3486481TGAATGAAGGAAGGAAGG+7.69
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3486483-3486501GGTAGGAAGAAAGGAAGG+7.74
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3486479-3486497GGAAGGTAGGAAGAAAGG+7.78
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3486475-3486493GGAAGGAAGGTAGGAAGA+8.31
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3485500-3485518TGAAGGAAGGAAGGAAGG+9.09
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3486467-3486485TGAAGGAAGGAAGGAAGG+9.09
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3486491-3486509GAAAGGAAGGAAGGAAGG+9.6
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3486487-3486505GGAAGAAAGGAAGGAAGG+9.72
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3486471-3486489GGAAGGAAGGAAGGTAGG+9.79
EWSR1-FLI1MA0149.1chr21:3485516-3485534GGAAGGAAGGAAGGAAGT+9.88
Lhx3MA0135.1chr21:3486696-3486709GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr21:3485897-3485910TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr21:3486700-3486713TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr21:3485893-3485906TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr21:3485890-3485903AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr21:3485894-3485907AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr21:3486697-3486710AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr21:3485889-3485902AAATTAATTAATT+6.92
POU6F1MA0628.1chr21:3485891-3485901ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr21:3485895-3485905ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr21:3485899-3485909ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr21:3486698-3486708ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr21:3486702-3486712ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr21:3486839-3486849ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr21:3485891-3485901ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr21:3485895-3485905ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr21:3485899-3485909ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr21:3486698-3486708ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr21:3486702-3486712ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr21:3486839-3486849ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr21:3486016-3486029GGGTGAATGAATG-6.03
ZNF24MA1124.1chr21:3486288-3486301GGGTGAATGAATG-6.03
ZNF24MA1124.1chr21:3486933-3486946AAATGAATGAATC-6.04
ZNF24MA1124.1chr21:3486316-3486329TGATGAATGAATG-6.11
ZNF24MA1124.1chr21:3486340-3486353TGATGAATGAATG-6.11
ZNF24MA1124.1chr21:3486112-3486125AAATGAATGAAGG-6.18
ZNF24MA1124.1chr21:3486304-3486317AAATGAATGAATT-6.32
ZNF24MA1124.1chr21:3486092-3486105GGATGAATGAATA-6.33
ZNF24MA1124.1chr21:3486554-3486567GAATGAATGAACA-6.3
ZNF24MA1124.1chr21:3485594-3485607GAATGAACGAATG-6.41
ZNF24MA1124.1chr21:3486436-3486449GAATGAATGGATG-6.44
ZNF24MA1124.1chr21:3485598-3485611GAACGAATGAATG-6.46
ZNF24MA1124.1chr21:3486296-3486309GAATGAATAAATG-6.48
ZNF24MA1124.1chr21:3486925-3486938GAATGAATAAATG-6.48
ZNF24MA1124.1chr21:3486300-3486313GAATAAATGAATG-6.5
ZNF24MA1124.1chr21:3486929-3486942GAATAAATGAATG-6.5
ZNF24MA1124.1chr21:3486240-3486253GTATGAATGAATG-6.64
ZNF24MA1124.1chr21:3485677-3485690GAATGAATGAAAG-6.78
ZNF24MA1124.1chr21:3485815-3485828GAATGAATGAAGG-6.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486550-3486563GAGTGAATGAATG-6.87
ZNF24MA1124.1chr21:3485590-3485603GAATGAATGAACG-6.98
ZNF24MA1124.1chr21:3486268-3486281GAATGAATGAACG-6.98
ZNF24MA1124.1chr21:3485996-3486009GGATGAATGAAGG-6
ZNF24MA1124.1chr21:3486460-3486473GGATGAATGAAGG-6
ZNF24MA1124.1chr21:3485669-3485682GGATGAATGAATG-7.04
ZNF24MA1124.1chr21:3486775-3486788GGATGAATGAATG-7.04
ZNF24MA1124.1chr21:3486024-3486037GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr21:3486344-3486357GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr21:3486688-3486701GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr21:3486829-3486842GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr21:3485799-3485812AAATGAATGAATG-7.34
ZNF24MA1124.1chr21:3486292-3486305GAATGAATGAATA-7.52
ZNF24MA1124.1chr21:3485673-3485686GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3485803-3485816GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3485807-3485820GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3485811-3485824GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486020-3486033GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486244-3486257GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486248-3486261GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486252-3486265GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486256-3486269GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486260-3486273GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486264-3486277GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486416-3486429GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486420-3486433GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486424-3486437GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486428-3486441GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486432-3486445GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486779-3486792GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486783-3486796GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr21:3486787-3486800GAATGAATGAATG-7.82
ZNF263MA0528.1chr21:3486492-3486513AAAGGAAGGAAGGAAGGAAGG+6.16
ZNF263MA0528.1chr21:3485501-3485522GAAGGAAGGAAGGAAGGAAGG+6.94
ZNF263MA0528.1chr21:3485505-3485526GAAGGAAGGAAGGAAGGAAGG+6.94
ZNF263MA0528.1chr21:3485509-3485530GAAGGAAGGAAGGAAGGAAGG+6.94
ZNF263MA0528.1chr21:3485513-3485534GAAGGAAGGAAGGAAGGAAGT+6
ZNF263MA0528.1chr21:3486496-3486517GAAGGAAGGAAGGAAGGAAGA+7.03
Enhancer Sequence
ACTCCTTCTG CTTCTTGTTT CGGCTCTGCG GGTCAGTGCG TCTCTGAGTC TGTCTGTTCC 60
TCAGCTGAAC ACTGACAGAG AAAGAGGTGA AACAACTGTA TTTAACTTCA TTTTAGTCTA 120
TTTACCTATC ATGCAAAATC AACTTTTGGA AGCTGTTTGG GCAGAAATAT CACTTCAGTT 180
CCGGTTTGTG GATGTTAAAT CATACAGTAA ATCACGTATG ATCATGAAGG AAGGAAGGAA 240
GGAAGGAAGG AAGGAAGTGG ATACAGTGGA TGGATGGAGG GATGGATGAA GAAATCAATA 300
TATGGATAAG TTATGAATGA ATGAACGAAT GAATGTCAAT GAAGTGGATG GAAGGATGGA 360
TGGATGACGA AATCAATGGA TGAATGCATG GATGGATGAA TGAATGAATG AAAGGATGGG 420
AGGCATGGAT GAACGGAAGG AGGAATGGAG GAATAAATGA AGAAATCAAT GAAGAGATGG 480
ACGGATGAAG AAATCAATGG ATGGATGGTT GGATGAATTA AAAAAATGAA TGAATGAATG 540
AATGAATGAA GGAAGAAATC AATATATATT TATGAATGGA TGAACAGATA AATGAGTGAA 600
GGAATAAATA AATAAATTAA TTAATTAATT AATGAAAAGA TGAATGATGG ATGGAGGATG 660
AAATTAATGA ATGACTGAAA GAATAGATAG ATGGATGGAG GGATGGGTGA ATAAATGGAT 720
GGATGAATGA AGGATTGAAC GGGTGAATGA ATGAATGAAT TAATTGATAA ATCTATGAAT 780
GAGTGAGTGA ATAGATGGGT GAATTGATAA ATCAATGGAT GAATGAATAG ATGGATAAAT 840
GAATGAAGGA AGGAATCGAT GGATCAATGA ATGGATGATA ATAAGTGATA AATGAGTGAA 900
TGACTGAATA AAGAGATGAA TCATGGATGG ATGAATGGGG TATAGAATGA ATGGATAGAT 960
GTATGTATGA ATGAATGAAT GAATGAATGA ATGAATGAAT GAACGATTGA ACGGGTGAAT 1020
GAATGAATAA ATGAATGAAT TGATGAATGA ATGGACGGAT AAATTGATGA ATGAATGAAT 1080
TAATCAATCA ATGGATGAAT AAATGGATAA ATCAATGAAT GAGTGAGAGA ATAGATGGGC 1140
GAATGAATGA ATGAATGAAT GAATGAATGG ATGGATGGAT GGATGGATGA ATGAAGGAAG 1200
GAAGGAAGGT AGGAAGAAAG GAAGGAAGGA AGGAAGGAAG AAATCAATGG ATCAATGAAT 1260
GTATGAACAT AAATGAGTGA ATGAATGAAC AAACAGATGA ATGATGGATG GAGGATGAAA 1320
TTAATGAATG ACTGAAAGAA TAGATGGATG GATGGATGGA TAGGTGAACG AATGATGGAC 1380
AAATGGGTGG ATGGATGGAT AAATGGAGGA TAGAATGAAT GAATTAATTA ATTAATGGAT 1440
GAATAAATTG ATGAATGATG AATGAAAAAA TTCAACGGAT GAAAAAAGAC AGAATAGATG 1500
GATGAATGAA TGAATGAATG AATGATGGAT CATGAATGGA TGGATACAGG ATGGAATGAA 1560
TGAATTAATT AATGGACGAA TGAATGGAAG AATTCATGAA TGGATAAATA AAGAAAATCA 1620
ATGAATAAAT ATATAGATGA ATGAACGGGG AATGAATAAA TGAATGAATC ATACTTGACG 1680
TCTTCTCCAT AGTGGATCTT CATGTCGTCT GTCAGCAGCT GACAGGAGTA GCCGATGTTC 1740
TCCGCTGTTT CTAAACACAT AAAAACACAA TTAACGTTAA TAAAAATCCA TCTGCTGTAA 1800
AATACAT 1807