EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-08115 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr21:3465716-3467727 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr21:3467603-3467614TCTGATTGGCT-6.32
RREB1MA0073.1chr21:3466049-3466069ACACAAAACAAACACACACG+6.09
SP2MA0516.2chr21:3467568-3467585GTTAGTCCCGCCCCTCT+6.47
SPICMA0687.1chr21:3467524-3467538TACTTCCCCTTTAA-6.17
Enhancer Sequence
GACTTGAGTA AATGAATATT GAATGGTAAT TGTTTGGTTT TGAGGATGGA TTTGATCATA 60
TAATTGTGTG TTTTGTACTT TAGGCATGAA CGGGAACATG TAGAGATCTA TAAATGTGGA 120
CGATTTGCTA TTTCTAATGT GGGAACAAGA CTAAATACAC TTGGAAAATA TGTTTTGCGG 180
TGTAGAAATA AGGAAGATTT TAATATTTGG TGAGATTAGA AACATTCAAA CACACACAGA 240
CATAAACATA CATGCAAACA TACACACTTT ACACTTTAAT TGTTGTTGAA ATTAGAAACA 300
CATTCAGTCA GACACACACA CACACACACA CACACACAAA ACAAACACAC ACGCAAACAT 360
ACACACTTTA CTTGTTGGTG AGATTACAAA CACATTTAGA GACACACACA TGCACGCACG 420
CACACAAACA TATACACTTT ACATTTTAAT TGTGGGTGGA ATAACAAACA CACACACACA 480
CACACACACA CACAGACACA CACACACACA CACACACACT GTTGGTGAGA TTACAAACAC 540
ACACACACAC ACATACATAC ATACACACAC ACACTTTACA TTTTAATTGT TGGTGAGATA 600
ACAAACACAT TCAGACACAC ACACACAAAC TCACACACTC ACGCACGCGC CCACACACAC 660
GCACACACAA ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 720
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACTTTA 780
CATTTTAATT GTTGGTGAGA TTACAAACAC ATTCAGACAC ACACACACTC ACACACTCAC 840
CCACGCACAC ACACACACTT TACATTTTAA TTGTTGATGG AATTACAAAC ACAAACACAC 900
ACACATACAG GCACCCATAC ACACTTTAGT AGTTTGTGAG ATTATAAACA CATTCAGACA 960
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CTGTTGGTGA 1020
GATTACAACA CACACACACA CATACATACA TACATACATA CACACACACA CTTTACATTT 1080
TAATTGTTGG TGAGATAACA AACACATTCA GACACACACA CACAAACTCA CACACTGACG 1140
CACGCGCCCA CACACACGCA CACACAAACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 1200
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACTTTAC 1260
ATTTTAATTG TTGGTGAGAT TACAAACACA TTCAGACACA CACACACTCA CACACTCACC 1320
CACGCACACA CACACACTTT ACATTTTAAT TGTTGATGGA ATTACAAACA CAAACACACA 1380
CACATACAGG CACCCATACA CACTTTAGTA GTTTGTGAGA TTATAAACAC ATTCAGACAC 1440
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC AAACACGCAC GCAAACATAC 1500
ACATACACAA CACATTTTAA TTTGGTGGTG AAATTACATA CACACAACAC ACACAAACAT 1560
ACACACTTTA CAATTCAATA GAAGGTAAAA TTACAAAAAC ATTTAAACAC ACACACACAC 1620
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACTT TCTCTCCCTA TTGAATTAAA TTGGAATTTT 1680
CTGAATAAAG AAAAGGAAAC AAACACATGA CTCAGAAATA AAAGACACAG AATCAGAACC 1740
TGAGATGAAG GCTGTGTTGT ACACCGTGCT CACCGTTAAA ACCAGCTCAG ATCTTCAGTG 1800
TTTACTAGTA CTTCCCCTTT AAGCCCATTA CCCATTCCCC ATTGGCTCAT TGGTTAGTCC 1860
CGCCCCTCTA AATGACACAT GGCCTCCTCT GATTGGCTGT GCTGAGGGTG TAAAGGCACG 1920
ATCGGCGTGT GTGTTAGTGA CAGTTTCAGA TGTTTTCAGC GTGAGGAACT TCTCTAATGC 1980
TGTCTCTTAG CTCGGGTCGG ACCCGCGGCC G 2011