EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-08011 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr20:54881797-54884055 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr20:54883165-54883180AGAGGTCAGAGGTCA+8.73
Nr2f6MA0677.1chr20:54883166-54883180GAGGTCAGAGGTCA+7.42
RARA(var.2)MA0730.1chr20:54883174-54883191AGGTCAGACGGAGGTCA+6.96
RARA(var.2)MA0730.1chr20:54883185-54883202AGGTCAGACAGAGGTCA+7.54
RARA(var.2)MA0730.1chr20:54883196-54883213AGGTCAGTCAGAGGTCA+7.56
RXRBMA0855.1chr20:54883166-54883180GAGGTCAGAGGTCA+6.84
RXRGMA0856.1chr20:54883166-54883180GAGGTCAGAGGTCA+6.91
Rarb(var.2)MA0858.1chr20:54883174-54883191AGGTCAGACGGAGGTCA+6.88
Rarb(var.2)MA0858.1chr20:54883196-54883213AGGTCAGTCAGAGGTCA+7.32
Rarb(var.2)MA0858.1chr20:54883185-54883202AGGTCAGACAGAGGTCA+7.79
RxraMA0512.2chr20:54883166-54883180GAGGTCAGAGGTCA+6.88
SP1MA0079.4chr20:54883851-54883866AGTGGGCGGGGCTTT-6.69
SP2MA0516.2chr20:54883850-54883867AAGTGGGCGGGGCTTTC-7.42
SP4MA0685.1chr20:54883849-54883866TAAGTGGGCGGGGCTTT-7.21
Enhancer Sequence
GCCTCGGCAT TACTCATTAT CAAGCTGTTG ATGATTCTAT CCTGTATTTA TGGTCATATT 60
TCTGTCTGGT TTATGGGTCC AGCTCACCAA ACGAACTGCT TAATATTTAT TTACAAACAA 120
ATATATTTCC CCTGCACAGA ACTGAGTGAA ACCCTGTGCT CTTACACACC GCTGATGCAC 180
GGCAGCCATT ACTGAAGGAG CAGAGCTGCT GCTGACACTA TTACACTCAC ACACACACAC 240
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC AGGCAAACAT 300
GCGCGCACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 360
ACACACAGAG ACACACACAC ACAGGCACAC ATGTGCGCAC ACACACACAC ACAAACACAC 420
ACACACACAT ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC AGACACACAC ACACAGGCAC 480
ACATGCGCAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACAGAC ACACACACAC ACAAACAGGC 540
ACACATGCGC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACATACACAC ACACACACAC 600
ACACACACAC ACACACAGAC ACACACACAC ACACACAGAC ACACACACAC ACACGGGCAC 660
ACATGCGCAC ACACACACAA AAACACACAC ACACACGCAC AAAGAGGCAC ACATGCGCAC 720
ACACACACAC ACGACACACA CACACACAGA CACACACACA CACACAGAGA CACACACACA 780
CACACACACA CAGACACACA CATAGACACA CACACACACA CATGCGCAAA CACACACATA 840
CACACAGGCA CACATGCGCA CACACACACA CAAACACACA CATACACACA CACACACACA 900
CATACGCAGA CACACACACA CAGACACATA CTCACAGACA CACACTCACA AACACACACA 960
CACACAAAGA TACACACATG CAGACACACA CACAGACAGA CACACACAAA GACACATACT 1020
CACAGACACA CACTCACAAA CACACAAACA CACACACACA CACACACACT GCATACTTTA 1080
AAGAAGTACT GTGATTTGGG CGAGACTTAC CTCTGCAGTG AGCGACACGC CTGACTCCTG 1140
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA AACACACACA CACGCATACA 1200
CACACACACA CACACACAGA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACAAAAGCA 1260
GCTCTCATAT TTACAGTAAC TAAAGAGTTA AATGCTGAGA GGAGCTGACA GTAAACCAGT 1320
CTGACCTGCA GCAGCTGCAC CTCCATCTTT TGGTTTGCTG GAAGAAACAG AGGTCAGAGG 1380
TCAGACGGAG GTCAGACAGA GGTCAGTCAG AGGTCAGAGA CAGCAGCTCC TCTTCACATT 1440
TCTGTTTTAT TTCTATTTTC TGACCTCTCC AGCGGTTTCC TGCTGCTGCT GCTCTTAGCT 1500
TTACTGTTCG GGGGCTCTCT GGAGGATCCA GCAGCAGTTC TGTACACACA CACACACACA 1560
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CAGGTAAGAG 1620
AGTGCTCTTC TTTATATCTT GCATTCAACA CAATGTTAAA TTGGGTTTTA ATATCAGCTA 1680
TGAACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 1740
CACACACACA CACACACACA CCTCTTTGCT GCTGTTGAGG ACGGGCTGTA GTTCCTGGAG 1800
GAGGCTGAGG AGGGCAGTGT GGAGCTGGAG CTCTTCCTCA GAGACGATAC TGATGCTCTC 1860
GGGGTCAGAG AGAGAGACAC CGGACGCACA GCTGCACGCA CACACACACA CACACAGAGG 1920
AGAGACAGAT CACATGACTG CACATAAAAC ACACACAGCT CAAAATAAAA CACTATTAAA 1980
GCTGAATCTG TATGAACAGG AAGCTGCTGA AGTAAGTAAG CTGCTGCGCT TCCAGCTGAA 2040
TCTGCATATT CATAAGTGGG CGGGGCTTTC TTTAGCACAT CGCTCCAATT ACAATTCAGT 2100
CAATGACAGA CCCCCACACA CTCTAGCACT TCCACCATAC AGGCCCCTGC TGTCAATATT 2160
TCCAACATGT TTATTAGTTG TGTGCCACAG ATTTAAAGAA ACCATTGAAG CAGGTCATCT 2220
ATAGGAAATG AGGATTTTAA ACACTGGAGC TGATCTGG 2258