EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-07940 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr20:48898098-48899065 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HMBOX1MA0895.1chr20:48898950-48898960ACTAGTTAAC+6.02
IKZF1MA1508.1chr20:48899031-48899043GTTTCCTGTTTC-6.22
ZNF263MA0528.1chr20:48898621-48898642GGAGGAGGTGCGTGGGGAGGG+6.44
ZNF384MA1125.1chr20:48898324-48898336ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr20:48898323-48898335AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
TCAAAAGTCA AAGTCAAAGT CAAAGTCAGC TTTATTGTCA ATTCAGCCAC ATGTACAAGA 60
CATACAGAGA ATCGAAATTG CGTTACTCTC AGACCCAAGG TGCTTAACAT TAATATAAAA 120
TATATATATA AAAAAAATAG TAGGGTTTAA GAAAAAAAAA GAAAATTTAG AAAATTTACA 180
GTATATACAT TGCACATAAA TGTGGTCTAA GAAATATACA TATGTAATAA AAAAAAAATT 240
GTAAACAATA CAGTGACATT AAGGGCATAT AGCAATGAGT GCAAAGTAAA CCAGAGTTGT 300
GCAGATAAAA AACAGTATAG TGCAAAAAGA ACTTGTAAAC ATGATAATTG TGATAAAGTG 360
ACAGTGACAT ATTGGGAGGT AGTATATGTG TCTGCATAAA GTGACCAGTG CAGATGAGTG 420
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 480
TGTGAGTGTG AGTGTATGTG TGTCAGAGTC CAGAGGTGCG AGGGGAGGAG GTGCGTGGGG 540
AGGGAGCGGG GAGCAGAGCT GGGAGAGAGT TCAGCTTCCT GACAGCCTGA TGGATGAAGC 600
TGTCTTTCAG TCTGTTGGTC CTGGCCTGGA GACTGCGCAG TCTCCTCCCT GATGGCAGCA 660
GACTGAAGAA GCTGTGCATT GGGTGGGTGG CATCTGCTGT TATGCAGAGG GCTTGTAAAC 720
ACTCACATTC ACATGAACTA CAAATGCGCC ATGTTGTGGA CTACATATTC AGTCATGCAA 780
CACACACAAC CGGTTCCAGA TACTGACTGA TTTAACTCTC ACAGCTGATA TTTATGACCA 840
TTGATTATTT GGACTAGTTA ACCCCTTCTG TTCCACACAC ATGTTGCTGA GTATTGTTTA 900
GCTGTTGCTG TCTTTAAGCA AGCATATTTC CTTGTTTCCT GTTTCCAGTG TTTTTGATTT 960
TGGACTG 967