EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-07892 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr20:45383924-45385529 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr20:45384556-45384573TGAATTAATTGATGGAT-6.47
ArxMA0874.1chr20:45384640-45384657TGAATTAATTGATGGAT-6.47
ArxMA0874.1chr20:45384555-45384572ATGAATTAATTGATGGA+6
ArxMA0874.1chr20:45384639-45384656ATGAATTAATTGATGGA+6
EWSR1-FLI1MA0149.1chr20:45384105-45384123GGATGGACGGATGGAAGG+6.49
EWSR1-FLI1MA0149.1chr20:45384113-45384131GGATGGAAGGATGGATGG+6.57
EWSR1-FLI1MA0149.1chr20:45384117-45384135GGAAGGATGGATGGATGG+6.59
EWSR1-FLI1MA0149.1chr20:45384109-45384127GGACGGATGGAAGGATGG+6.6
PBX1MA0070.1chr20:45383935-45383947ATTGATTGATGG-6.62
PBX1MA0070.1chr20:45384487-45384499ATTGATTGATGG-6.62
PBX2MA1113.1chr20:45383948-45383960TTGATTGACAGA+6.11
PBX2MA1113.1chr20:45384692-45384704TTGATTGACAGA+6.11
Enhancer Sequence
CTGGTGGATA GATTGATTGA TGGATTGATT GACAGAGTGA CGAAAAGACT GACAGATTGA 60
TGAATGGATG GGATTGACAA ATTGACAGAT TGATGGATTG ACTGACAAAT TGATAGATGG 120
ATTGATAGGT TGTTGGATAA TGGATTAAAG GAAGGATTGA TGGATAGACA GATTGACTGA 180
CGGATGGACG GATGGAAGGA TGGATGGATG GATTGAGAGA TGGATTGAGA GATGGTTTGA 240
GAGATGGACT GAGAGATGGA CTGAGAGATG GACTGAGAGA TGGACTGAGA GATGGACTGA 300
GAGATGGACG GATGGATTGA GAGATGGACG ATGGATTGTC GGAGGGACTT GCTTGACTGA 360
CTGACTGACT GACCGACAGA TGGATTGATG GATGGATGGA AATAGTGATT GGCAGATTAA 420
AGGATTGATG GAAAGATTGA CTTAAAGATT GAAGGATGGA TGGATGGATG GACAAATTGA 480
CGAGTTGTTG GATGAATGGG TTGAGGGATG GATGGACTGA TTGCAAGATG GATGGATTGA 540
TCGATGAATG GATGGACTGA TTGATTGATT GATGGACTGA TTGATTGATT GAAACATAGA 600
TGGATGGATT GTCAGATGGA CTGCTTGATG GATGAATTAA TTGATGGATG GATGGATTGA 660
GTTGCAGGGG AATGGATAGA CTGATTGACG GATGGATTGA CTGACGAATT GACAAATGAA 720
TTAATTGATG GATGGATGGA TGTATTGATT GACGGATGGA TGAATGTATT GATTGACAGA 780
CTGAAGGAAG GATGAATTCA CAGATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA 840
TGGATGGATG GATGGATGGA TAGACGGACA AATTGAAGGA TGGTTTTATA AATTGATGGA 900
TGGATGGATG GACCGACAGA TGGACTGGTC AGTTGATTGG TTAACTGATT GGCTGTTGGA 960
TTGATAAATG GACAAATTCA GAGATGCAAT AACAGATTAA TTGATTTATG CACTGATGGA 1020
GAGATGGATG GACTGATGGA TTGATAGGAC TGATTGATGA ATAAATGAAC TAATGGATTG 1080
ACTGAATAGT TGATTGACGC AGGGAGGAAT TGATTGACTG ATTGATTGAT TGATTGATTG 1140
AATGCTGGCT GGATTGAATG ACAGATGGAT TGATGGATGG ACAAAAGAAC TGGATAGATT 1200
GACTGACTGA TGGATGGACT ATAGATTAAT GGAAACCCAC AGTCAATGAC GGCCATAACA 1260
CAAAACAAAA AATACAACAG AATTAAATGG TTGCCATTTG TAAACATTCC TCAGAATATC 1320
TCCTTCAGTA ATTTACCCAA AGTAAAACTC AAGCAGATTA GGAATAACTG GAGGATGAGT 1380
AAATGATGAA ATGTCTCTTT AAGACAGACA GCTTGTGGCA GTGGCAGAGA GATTGTGGGT 1440
GTTTCTGCGG GACGTCTCCT TCAGTTGATG GTTTCTCCAT CTGTCTGGCA GCGCCTGTGC 1500
TCATGTGCTG CGCCTGTTCA GCTTTTACAG CCTCTGCTTC ACCTCATGCC CCATTAACAG 1560
AGCAAAGGGA GAAATGCAGG CCAGTGTTTT CCTGATCCAA ACATT 1605