EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-07861 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr20:40769213-40770376 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chr20:40769756-40769776CACCCACCCACCCACCCACC+7.33
SOX10MA0442.2chr20:40769554-40769565AAAACAAAGAC+6.14
SOX10MA0442.2chr20:40769653-40769664AAAACAAAGGA+6.32
Sox3MA0514.1chr20:40769653-40769663AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
GTTTGCCGCT ATTCTCTGGT GTTGCATCAT GGATGAAAGT GATTGGCTAT TGTCAGCACT 60
AGTATATTTG CATGAAGCGA TCTCATTGGC TCAACCCTTC ATTGGTGCTT GAAAAGTTCC 120
GCTTGATGTC ACTCCATTCA AAGTAAAGGA AAAACTTTAA CGCTGATGCC CTGTGTAAAC 180
TGGAGGTTGA GCAAATGGTG AGTACATTTA CAAACTACGC CTTTAGGTGG AAGTTAAATT 240
GATGATGACT AAAAATGATG GTTCTTTATT CGATTTATAA TGATTGCACA AAAGCTATTT 300
TAAAACTGTA AAAAAGAGAT TATTAAATGT TCCTCACACC AAAAACAAAG ACGACTAATA 360
GCATAATTCA TGTTTATCTG TCTGTCTGTC TGTCTTTCTA ATCTGTCTAT ATTTCATGTT 420
CAGCAGAAGA AAGAAACTTC AAAACAAAGG AAGAAAATTC GAAACAGGTG GAAGGGAAAG 480
AACAGTTCAT ATATGGGGTA AATAATGTGT CTGTCCGTCC GTCCGTCCGT CCGTCCGTCC 540
ATCCACCCAC CCACCCACCC ACCCATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 600
ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT 660
GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTATCTGT CTGACTTTCT 720
GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCA 780
GTCTGTCAGT TTTTCTAATC TGTCTATCTT CTGTTGTGTT CAGCTGAAAA GAATCACAGA 840
TTTGGCACAA GTGGAAGGGA AGGAAAAGTT TATATATGGG GTAAATAATC TGACTGTCTG 900
TCTATCTGTC TGTCTGACTG TCTGTCTTTC TAATCTGATT ATCTTTTGTT TTCAGCAGAA 960
GAAAGAAACT CAGATTCGAA ACAAGTGGAA GGGAAGGAAC AGTTCAAATA TGGGGTAAAT 1020
AATCCTTTAT ATTGCCTTTG AGTAAAACAC AGATCTAGCA AAATAATAAA ATACTTTATT 1080
AGAATATTAT TACTGAAATA TTTGACACCA GTGTTTGAGT TATTTAGTTT CTCTCATGTC 1140
ATCCCAAACC CATCTGACTT TCC 1163