EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-07690 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr20:25404596-25406332 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr20:25405651-25405666TGTTATACAAACAAT+6.38
Foxq1MA0040.1chr20:25406060-25406071TATAAACAATA-6.32
PBX3MA1114.1chr20:25404985-25405002GCTTGAGTGACAGACAG+6.64
SOX10MA0442.2chr20:25405680-25405691AAAACAAAGCA+6.02
SOX10MA0442.2chr20:25405129-25405140AAAACAAAGAC+6.14
SOX10MA0442.2chr20:25405234-25405245AAAACAAAGGA+6.32
SOX10MA0442.2chr20:25405073-25405084AAAACAAAGAA+6.62
Sox3MA0514.1chr20:25405234-25405244AAAACAAAGG-6.02
ZNF24MA1124.1chr20:25404769-25404782AAATGAATGAATA-6.42
Enhancer Sequence
TTGGGTAGGC TAAATTGTCC GTAGTGTATG AGTGTAAATA AGTGTGTATA GATGTTTCCC 60
AGAGACGGGT TGCAGCTGGA AGGGCATCTG CTGCGTAAAA CATATGCCGG ATAAGTTGGC 120
GGTTCATTCC GATGTGGCGA CCCCGGATTA ATAAAGGGAC TAAGCCAAAA AGAAAATGAA 180
TGAATAATGT GTGTAATAGG TTACTGACAA TCAGACAATT CAACATCATC ATTTCTACAG 240
ATACTATACT GCTACAGCTA AAGCATTCTT TAACAAGACA TATAAAAATA GATTTTTAAA 300
GTTTATAGTC AGAATTAAGG GTTGAATCGA TGATATTTAC AATAAGAGAT AGACAGAGCA 360
GAGCATTTAA CAGATAAAAC AGGCAGACAG CTTGAGTGAC AGACAGAATG ATAGACAGAG 420
ACAGAACGAC AGACAGAATT TTTTAAAGAG AGAGATAGAA AGTTAGACAG ACAGACAAAA 480
ACAAAGAACA TTAGACAGAC AAATAAAAAA AATCTAAACT ACAGAGAGGA TGTAAAACAA 540
AGACAAAAGA ACAGAACAAA AGAGAATAAG ACTGAGAGAA TGACTGACAG ATCACAAAAC 600
AGACACCAAC AGAAAAACAA AACAGATAGA CAGGCAGAAA AACAAAGGAC AACAGACAAA 660
ACAGTAGAAA AACAAAGTGA AAGACAGATA GACCAGACAG AAAGACAACA ATCACCAAAA 720
AATTGGACAC ACAGACAGAA AAGCAAACAG GATGAAAGAC AAAATGAAAG ACTTGAAGAA 780
TGGCAAAATT ATAGTCAGAT AGAATGAATC ACGAAGAGAA AATGACACGG ATGAAACAAT 840
ACTGGACAAC AGACAGACTA AATAACAGAC AGCATTTTAG ACAGAATGGG ATACAAACAA 900
ATTGAACAAG AGAAAAAAAA AACAGACAGA ACGAGACAAA ACAATATAGA CAGAATGTTA 960
AACAGGGAAA ATAAACAACA CATAGACAGA AAGGCACAGA CTCACTGATA TAGATTAAAC 1020
AACAGAACAA CCGACAGACA AGGTAACAGG TAGAATGTTA TACAAACAAT ATGAACAATA 1080
GACAAAAACA AAGCAGTACA GACAGAATTT TAAACATAAA AACCAAAGAG CTCACAGACC 1140
GAAAGGCAGA GATGGGTACA GATGAAACAA CAAGACAACT GACAGACAAA GTACAGTTAG 1200
ACAGAATGTT ATTCAGTAAA AATAAATTGA ACAGACAGAA AATCATACAA AACAACAGAC 1260
AAAACAGTAC AGACGAATAT TAAACATACA AACTAAACAA CACCGACAGA AAGAAACCAG 1320
ACAGACAGTT AAACTGAATG TTATACAGTA CAAATTAAAG AACAGATAAA AAAAACAGGC 1380
AAAATGTTAA TCAGACAAAC TGAGCAGACT GAATGACAGA GAGAGAGAGA TAATAACAGG 1440
CAAACAGATA CAGTAAATAA TGAATATAAA CAATAATGTG TATTTCTACT CGTCATTCCT 1500
GAGTATGTTT GCTATATAAG CGATCCTCGT GTGAGAGAGA GTGTGTGAAT GATTGGGTCA 1560
GGTGTTTACA GATCACAGAG GCAGTCTAAA AGTTTCATCT GCGACCTTTA ACCTGTGCTG 1620
GAGGTGAGGA AGTGTTGAGT GAACGGTGTG GAGGAGCTCA GTGAGGCCTG TGTGAGAAGT 1680
GCTGGGTCGT TAAAGCAGTC TAGCCATACG GCACACAGCG CTGAGCTTCC CATAAG 1736