EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-07574 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr20:15550468-15551496 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr20:15550634-15550655ATTTAGTTTCACTTGCTTTTC+6.14
Nkx3-2MA0122.3chr20:15551192-15551205TAAAACACTTAAA+6.33
RREB1MA0073.1chr20:15551075-15551095TGTGTGTGTGTGTTTTGGTT-6.14
Enhancer Sequence
TCTGTTCCTC TTTTACTTTT ATTTAGCTTC AAAGAAACAT TCGCGAAGCC TTTGGAAACA 60
CCTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 120
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG AGAGAAAGAG AGAGATAAAC AGACAGATTT AGTTTCACTT 180
GCTTTTCTTA GGCCCCATAT ATGTTGGTAT CTCTCTAAAT GAATGTTCTC ACAAAGTGTG 240
TGTGTGTGTC CAGGCTCTTT GAGTTTCAGG AAAAACTGTG AAGTTCCCAT TCTCTCTTCT 300
CTCTGTCTTT GTCTTTTTTT TTCTCCGGGG GTTTGTGTTT AATTGTTAGT CCAGCCGGCC 360
GTTCTCTGTG TGTTTAGGAT GGGAAGAAGA TGTGGAGGTT TACTTAAGAT AGCTGATCCA 420
GAAAGCAGCG ATAAGAGCTG AATATATGAG TTGAGCTGTG TTTGCTCAGC CTGGTTTCGT 480
GTGTGGGTCA GTGAGAGAGA GAGAGAGAGA TTATTTCATT TGACTCAGAT TTTACTGAGA 540
AAAGATGCTT TTAAACAAGG CTGACACTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 600
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT TTTGGTTGTT AACAAGGACA GAAATGTGTA TAATGACATG 660
GGTATGACCT TAGTATTACA ACACTAAGGT GGTTTATGAG GACATGCCTT ATGTCTTTGT 720
AATTTAAAAC ACTTAAAATT ATACTGAACT GAATCTTATT ACAGGCAAAA TGTTCAACAT 780
GTTCAATTTG AGGGTTGGGT TTAGGGGTAG AGCATATAAG AAGCTGTTTT TACTGTTTCT 840
CTTTGTTAAG TCGAGACGTA TGGAATACTG TCTCGGGTCC AAGCCGCAAC TCATTTGAAT 900
TGAGAAAATA TTCCTTTATG ACCACTTTTT AGTCTTATAA CACATTAAAG CAAATTTTAT 960
ATAAAGATTT TGGTGTACAC ATCAGACCTG GGACATGCTG CATCACAGAC ACCAATTATT 1020
GAACAATT 1028