EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-07461 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr20:1501164-1502866 
TF binding sites/motifs
Number: 41             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr20:1502484-1502500ACTAAAGTAAACAAAC+6.6
FOXC2MA0846.1chr20:1502487-1502499AAAGTAAACAAA+6.62
FOXD2MA0847.2chr20:1502485-1502498CTAAAGTAAACAA+6.59
FOXE1MA1487.1chr20:1502371-1502386CAATAAACAAACAAT+6.18
FOXP2MA0593.1chr20:1501680-1501691AAGTAAACAAA+6.62
FOXP2MA0593.1chr20:1502488-1502499AAGTAAACAAA+6.62
Foxd3MA0041.1chr20:1501589-1501601AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501593-1501605AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501597-1501609AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501601-1501613AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501605-1501617AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501609-1501621AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501613-1501625AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501617-1501629AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501621-1501633AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501625-1501637AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501629-1501641AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501633-1501645AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501637-1501649AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501641-1501653AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501656-1501668AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501853-1501865AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501857-1501869AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501861-1501873AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501923-1501935AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1502030-1502042AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1502186-1502198AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1502325-1502337AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1502329-1502341AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1502438-1502450AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1502442-1502454AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1502624-1502636AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:1501865-1501877AAACAAACATAC-6.37
Foxd3MA0041.1chr20:1502034-1502046AAACAAACAATC-6.92
Foxd3MA0041.1chr20:1502154-1502166AAACAAACAATC-6.92
Foxd3MA0041.1chr20:1502375-1502387AAACAAACAATC-6.92
Foxd3MA0041.1chr20:1502492-1502504AAACAAACAATC-6.92
Foxj3MA0851.1chr20:1501677-1501694AACAAGTAAACAAACAA+6.92
Foxj3MA0851.1chr20:1502485-1502502CTAAAGTAAACAAACAA+7.49
GFI1MA0038.2chr20:1501250-1501262CAAATCACAGCA+6.52
Gfi1bMA0483.1chr20:1501251-1501262AAATCACAGCA+6.62
Enhancer Sequence
GCACCACTGT TGGCATAGAG GTGGCTGACA AACAAAGTTG TGTGAGCGGG GTGTGTGTTT 60
GTGCGCGCAT GTCCCAGATG TGTCACCAAA TCACAGCAGT ATCTCCACAG AATATAACCC 120
ACTTCTGACT GTCAGGTGTA TGTGCGCTCG ACGTATCCCT GCCTTTATCC TGAGCTGAAT 180
TATTCCTCTC ACTCATCTGC TGAATAAAAC ACAAGTTATA TTTATACATT CCTGACAGGG 240
TTTGATCTGC TCCTCCACTC GCAGAATGAG GCTGGAGCTG TCAGTGTAAT CATGTAAACA 300
CAGTAAATGG GCCAGAGCTG CTCTTCATCA TCTGGATGTG CTGTATATCT GCGGAGGAGC 360
ACCGTTTTAG GGGAGATGCC AGATGTGTGT GGACACTGAC TGATGGGGGA CAACTCAAAA 420
CAAGCAAACA AACAAACAAA CAAACAAACA AACAAACAAA CAAACAAACA AACAAACAAA 480
CAAACAAACA TCAAACAAAC AAACAAGCAA AAAAACAAGT AAACAAACAA AAAACAAACA 540
CACAAGCAAA AAACAAATAA GCAAACAGAC AAACAAGCAA ACAAATAAGC AAAAACCAAC 600
AACGACCAAG CAAGTAAACA AGTAAAAACA ATCAAAAAAG CATGCAAGCA AGCAAACAAA 660
CAATAAAGTA AGCAAACAAA CAAGCAAAAA AACAAACAAA CAAACAAACA TACAAACAAG 720
CACACAAACA AGCAAACAAA TAACAAAGCA ATTAAAAGCA AACAAACAAA CAAATAAACA 780
AGCAAGCAAA AAACAAGCAA ACAAACTAAC AAGCAGAAAA CAAGCAAGCA AAGAAACGAA 840
AATAAGCAAA CAAACAAATA AACAAAAAAC AAACAAACAA TCAAGCAAGA CATACACAAG 900
CAAACAAACA AGCAAGCAAA CAAAAAACAA CAAACAAACA ACAAGCAAAC AAACAAAACA 960
TCTAAAAAAA ACAAGCAAGC AAACTAAAGC AAACAAACAA TCTGGCAAAA AGATAATCCA 1020
ACAAACAAAC AAACAAGCAA ATAAACAAGC AAGCAAACAA GCAAAACAAA ACAAAAAAAA 1080
AACGAACTAA AAAGCAAGCA AACAAACAAA TAAACAAAAA ACAATCAAGC AAGAAACACA 1140
CAAGCAAACA AACAGGCAAT CAAACAAACA AACAAACAAA TAAACAAAAA ACAAACAGAA 1200
AAACTATCAA TAAACAAACA ATCAAGCAAA CAAAAACAAA CAAAAGCAAA TAAAGCAAGC 1260
CAAAAACAAA TAAAAAACAA ACAAACAAAC ATCTAAAAAG AAAAAAAAAC AAGCAAGCAC 1320
ACTAAAGTAA ACAAACAATC TGGCAAAAAG ATAATCCAAC AAACAAGCAA ACAAACAAGC 1380
AAATAAAAGC AAACAAACAA GCATATAAAA GCAAACAAAC ACTTAGACAA ACAAACAAGC 1440
AAACAAACGA TGAAGCAAAA AAACAAACAA ACACTTATTG AACGTGTAAA AAAATTAAGC 1500
AAATAACGCA GTTACTGGTT TTTTTTTTCC TGTTGTGGCC GATGTGTGTT CAGGGAAGGC 1560
GTGTGCATAG AGGTGACCTA GGTGGCCGCC TTGGGCAGCA GAATAGTGAG GGAAACCCCC 1620
GGTCTTTACT TTCATCCGCT ATACCCACCC CCTCCCTCAC GGTCCTAATT TCATCCGTGA 1680
ACCGGCCACT TTCTTTTTCA CT 1702