EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-07418 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr2:58892783-58895188 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr2:58893959-58893974TGACCTTTGACCTCA-6.55
NR2C2MA0504.1chr2:58893952-58893967TAACCTTTGACCTTT-6.27
NR2C2MA0504.1chr2:58893959-58893974TGACCTTTGACCTCA-7.73
NR2C2MA0504.1chr2:58893938-58893953TGACCTCTGACCCCT-9.03
NR2F1MA0017.2chr2:58893955-58893968CCTTTGACCTTTG-7.22
NR2F2MA1111.1chr2:58893957-58893968TTTGACCTTTG-6.62
Nr2f6MA0677.1chr2:58893938-58893952TGACCTCTGACCCC-7.03
Nr2f6MA0677.1chr2:58893952-58893966TAACCTTTGACCTT-7.22
Nr2f6MA0677.1chr2:58893959-58893973TGACCTTTGACCTC-8.42
RARA(var.2)MA0730.1chr2:58893966-58893983TGACCTCAGGGTGAGCT-6.02
RXRBMA0855.1chr2:58893952-58893966TAACCTTTGACCTT-6.64
RXRBMA0855.1chr2:58893938-58893952TGACCTCTGACCCC-7.06
RXRBMA0855.1chr2:58893959-58893973TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRGMA0856.1chr2:58893952-58893966TAACCTTTGACCTT-6.8
RXRGMA0856.1chr2:58893938-58893952TGACCTCTGACCCC-7.01
RXRGMA0856.1chr2:58893959-58893973TGACCTTTGACCTC-8.12
Rarb(var.2)MA0858.1chr2:58893966-58893983TGACCTCAGGGTGAGCT-6.55
RxraMA0512.2chr2:58893952-58893966TAACCTTTGACCTT-6.86
RxraMA0512.2chr2:58893938-58893952TGACCTCTGACCCC-6.98
RxraMA0512.2chr2:58893959-58893973TGACCTTTGACCTC-8.12
TCF7L1MA1421.1chr2:58893955-58893967CCTTTGACCTTT-6.22
Enhancer Sequence
CACTCACACA CACACACACA CACACACACA CACACGTCAG GGAAGAGCTC CTTTTTTCTG 60
TCCAATAAAG ACGGCTTTAT GCGAATAATA AGTGACAGTG AAGAGGATCC TCCGTTTCCA 120
CAGTAACAGG AGGAAGAGGG ACATCAGCAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 180
ACACACACAC AATGATAAAG GATACACACA CAACCATAAA AGTCCCTGAC ATTCAACTGA 240
CATAAACAGA TACACATGAC ACACACTCAG ACACACACTG TGCAGCAGTC TGCAGATACA 300
CACGCGCACA CACTCTCACA CACAAGTACA AAAACACTAA CACACAGCTG AAGTAAACAC 360
ACACACGCAC TTGCTGACCC CCACTCTGAC ATGCACACTG TGACAGACAC TCTCACACTG 420
CAGATACACA CACACACTCT CTGACATATA ATTTTGGACA CATTCACACA CACTTGGCAC 480
ACACACAGAC ATTTTACATG CTAAGTTAGT AGTACTGCGG GTTACATTTT AGCATTTAGC 540
AGATGCTTTT ATCCTGAGTG ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC AAAAACACTC 600
AGTTTGCAGT TACACACATT CAGACACACA CAGACATGCA TGCACAAACA CACACTTCCA 660
TGTACACACA CATGAAGGCA TAGTTACATG CGCACGCACA CACTTACACA TACACACATT 720
GATGACAGAC ATGCACAGAC ACACACATAC ACACACTAAC TTGCATTCAC ACACTCATAT 780
GTGCATATGC GAGCACACTC TCACCCACTC ACACACGCAC AGACACATGA ACGCACACAC 840
ACACACACGT ACATTCACAC ATAGACTCAC ATGCATGCAT GCACGCACAC ACTCACACAC 900
AGACGCATGC ACACACACGC ATGTACACTC ACACATAGAC TCACATGCAT GCACGCACAC 960
ACACACTCAC ACACAGACGC ATGCCCACAC ATGCATGTAC ACTCACACAT AGACTCACAT 1020
GCATGCACGC ACACACTCAC ACACACATGT ACGTACACTC ACATGTAAAC TCACTCACAT 1080
ACACACACAG ACACACACAC ACACACACGT CCTGTGCATC TGTAGTCAGA CTGATGCTCT 1140
GCTGAGGCTG TGCTGTGACC TCTGACCCCT AACCTTTGAC CTTTGACCTC AGGGTGAGCT 1200
CAGCTGTTAA TGAACTTCTG CTGCTCTGCT GCCTTCAATA ATTGATCAGA TGATGATCAT 1260
GTCCAGCTCA CAGGCAAGAG TTAGCATTCA GCACAGCACT CTCAGACCTG CACTGAGTAT 1320
CACACACACA CACACACACA CACACACATA CACACTCACA AGATTTTATA GCACTTCTGC 1380
ATGCGCATAC TCATACACAC ACACACACAC ACACACACAA AATTTTATAG CACTTCTGCA 1440
TGCGCATACT CATACATACA CACACTCACA CACACACACA CACACATACA CACACACACG 1500
CACACACACT CACACGCGCA CACACACACA CACGCACACA CACACACATA CACACACAAG 1560
ATTTTATAGT GCTTCTGCAT GCGCATACTC ATACATACAC ACACACACTC GCACACACAC 1620
TCACACGCAC ACACACACAC ACGCACACAC ACACATACAC ACACAAGATT TTATAGCGCT 1680
TCTGCATGCG CATACTCATA CATACACACA CTCACACACA CACACACACT CACACGCACA 1740
CACACACACA CACACAAGAT TTTATAGCAC TTCTGCATGC GCATACTCAT ACATACGCAC 1800
ACACACACAC ACACACACAC ACACAAACAC ACACACACAC TCACACGCAC ACACACACAC 1860
ACACACATAC ACACACAAGA TTTTATATTG CTTCTGGATG CCCATACTCA TACACACACA 1920
CACAAACACA CACACACAAT ATTTCATAGC GCTTCTGGAT GCTCATACTT ATACACACTC 1980
ACACACACTC ACACACACAC ACACACACAC ACAATATTTT ATAGCGCTTC TGGATGCTCA 2040
TACACACCCA CACACACACA CACACACAAG ATTTTATTGC GCTTCTGGAT GCTCATACTC 2100
ATACACACGC ATACACACAC ACCTATGCAA TACACTCACA CACAAACACA CTGACACACA 2160
CACACAAATA GTATCGCGCT TCTTGATGTT TTCAGAGCTT GCTGATGTGC GTTTGAATCA 2220
TCAATATGAA GTTGTGTGTA AGTGTAACAG TTAACCATGG TGAACAGTCA GTACTCACGC 2280
TGTCCTGACT TATGAGAGAT TATATAAAAT TAGGTATATC ACACATGTTC TATTACATGG 2340
TTTATCAGTC TGTTTATTAC TACACTACAG TTTACTTGTT CATCCCATAT ACAGTATAAT 2400
GTTTT 2405