EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-07389 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr2:57494879-57496343 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr2:57495802-57495813GGCCATAAAAC+6.62
CDX2MA0465.1chr2:57495801-57495812AGGCCATAAAA+6.02
CDX4MA1473.1chr2:57495802-57495813GGCCATAAAAC+6.32
Dmbx1MA0883.1chr2:57495322-57495339ACACCTAATCCGTTTTA-6.44
PBX2MA1113.1chr2:57495522-57495534TTGATTGACAGG+6.44
Enhancer Sequence
ATTCTCCTCT GACATCATCA ACAAGGCATT TGCGCCCACA GAACTGCCGC TCACTGGATA 60
TTTTCTCTTT GTCGGAGCAT CCTCTGTAAA CCCTAGAGAT GGTTGTGCGT GAAAATCCCA 120
GTAGATCAGC AGTTTCTGAA ATACTCAGAG CAATCCGTCT GGCACCAACA ACCATGCCAC 180
GTTCAAAGTC ACTTAAATCC CCTTTCTTCC CCATTCTGAT GCTCGCTTTT AACTGCAGCA 240
GATTGTCTTG ACCATGTCTA CATGCCTAAA TGCATTGAGC TGCAGCCATG GGATTGGGTG 300
ATTAGAAATG TTCATTAACA AGCAGTTAGA CAGGTATACC TAATAAAGTG GCCAGTGTGT 360
GCGTTTGCTT TTGTAAATTT AGGGAACATT TCATGGGTTT TTATACTTTA CAAAGTGTAT 420
TTTCTATTGT CCTTTCCAAC CCTACACCTA ATCCGTTTTA AAACAACTCT GTATGATTTA 480
TATGCCTTTA AAATTGTAAT TAACCATCTC TTTGTATTAC CCATGTGATC ATACGCATTT 540
GTGTCCTGAT ATGTCACAAA AACAAGCACA AACCAAACAC ACACACATAT ATCTTATATG 600
TGTTGTCAGC TGCTGGTCTG CTGATTTATG GAGTATCAGC TCTTTGATTG ACAGGATCAT 660
CATCATGCGG TGTGTGTTCA GCTAATGGCA TCACTAGAGC TCGACACACA CACACACACA 720
CACACACACA CACACACACA CACGCACACA CGTCAACCAG AGAAAACATG ACCATTTATT 780
CCTCTGCCAT TCAGCACGGA TGCATCTGTC TGTCATTTAC AGCCCTGCTA CCGAAAGCCT 840
GATTCAGCAG ACGATACACT TCAGCACACG GCTGTAAAAC ACACACACCA TCTCACTGAC 900
AAATGCATCA CACACACTCA TCAGGCCATA AAACAACCCA GTGACCACAC ACAACATCTG 960
CAGCAATCCC ATAGCAATAC CCTAGCAACT CCATAACAAC AGTCTAGCAA GACCCAAGGA 1020
ACTTGATAGC AACTGCATAG GAACTCAATA GCAATACTGA CGCAACTCCA TACCAACATT 1080
ATATCAACAC CCTAGCAACT TCACAGCAAA ACCCTAACAA AATAACAGCA ACACCCTAGC 1140
AGCATCATAG AAACTAAATA GCAACTCTAC AGCAACAGCC TAGCAGCCTC CTATGAACTC 1200
CCTAGCAACA CCTTGTCATC TCTATAGCAA CATCCTATCA ACACACTAGG AACTTCATAA 1260
CAACACCATA GCAACTCAAT AGCAACACCC TAGCAACTCA TTAGCGACAG CCTAACAACA 1320
CCATAGAAAC TCAATAGCAA NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1380
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1440
ATATATATAT ATTTTTTTAT ATAT 1464