EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-07360 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr2:55285455-55287083 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr2:55286884-55286896CAGCATATGTTT-6.04
SIX1MA1118.1chr2:55286721-55286732TCTCAGGTTAC-6.02
Stat6MA0520.1chr2:55286777-55286792TATTTCCACAGAAAT+6.67
ZSCAN4MA1155.1chr2:55286145-55286160GTATCAGTGTGTGCA-6.13
Enhancer Sequence
AAGCATTTAT TTATAATACA AATATCTTCC TGACCCCCAA ACTTCTGACC AATCACATGT 60
GTTGATTTAC TTTGCTGAGG GTGCACATTT AATTCGGACA AAACCTCCAT TTTTCTTCAG 120
CATCCAGAAG AGTCCTCCAC AGCACACATG CTTCAGTAAT AGTGTTAGCA CAGCACAGTT 180
TCTGCTAGAG GTTAGGCGTT CATGTAAAGA TAAAATATGG CCATGCAATG CCAAGGTCAT 240
GAGTTTGAAT GGAGGAACTG ATCGAAATGA AACCTTTAAT GTGATGCATA TCACTTTAGA 300
TAAAGGCATT TGTCCAGGGC ATGAGCATAA GATGTGAATG TAGAGCTGTA GAAATCTATT 360
GTATGGCCTT ATTACCGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGC GTGTGTATGT 420
GTATGTGTCT ATCACGGTGT TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 480
CAATGTTTGT GTATGTGTGT GTATTTGTGT TGTTTGTATA TGTTTCTGTG TCTGTGCTGT 540
GTTATGTGTG TGTGTGTGCG CATGTGTGTG TGTGTGTGCA GTGTTCAATT GTAATGTGTA 600
TGTTTATCTG TGCTGTGTGT GTGCGCAGTG TGTCTGTTTA GTGTATGTGT GTGTCTGTGC 660
AATATGCATG TGTGTCTTTC TGTGTTGCGT GTATCAGTGT GTGCAATGTT CTGTTGTGTG 720
TGTGTGTGTC TGTCTGTCAT CTGCCTGTGT GTCTGTCTGT CTGTTTGTCC TTGTGCTCTG 780
TGTGTGTGTC TGTGTGTGTG TTTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGCGTA TGTGTATGTG 840
TGTGTGTGCG TGAGTATGTG TGTGTGTGTA TGCAGTGTTC AGTTGAAATG TGTCTGTCTG 900
TAATTTTTGT GGTGTGTGTG TTGGTGCAGT GTATGTGTGT TTTTGTGCAG TGTGTATCTG 960
TGCAATGTAT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTNNNN 1020
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1080
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNACTC AGGACTGTCC TCTCACCGCC 1140
AGAAATAGCA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 1200
CACACACACA CACACACACA CACACATACA TACACACACA CACATACATA CATACACACA 1260
GACTCCTCTC AGGTTACTCT AGAGAACATC TACAACACGA GAAGCACAGA AACAGCCCAC 1320
AGTATTTCCA CAGAAATATC TCCAGAAACT ATATATTCAC TATATATATA ACACTATATA 1380
ACTCTATATA TTCAGGAGTC ACCACAGTGG AATGAACCGC CAACTTATCC AGCATATGTT 1440
TTACACAGCA GATGCACTTC CAGCTGCAAT CCAGTACAGA TAAATACGGA TAAATTAAAT 1500
TCATTCAATC CACCTATAGC GCATGTGTTT GGACTGTGGG GGAAACTGGA GGTAACCCAT 1560
GCCAACATAG GAAAAAACAT ACAAACTCCA CACAGAAATG CAAACTGGCC CAGTTGGGAC 1620
TCGAACCA 1628