EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-07352 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr2:54840247-54842720 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HSF1MA0486.2chr2:54841596-54841609GAAAATTCCAGAA-6.17
HSF2MA0770.1chr2:54841596-54841609GAAAATTCCAGAA-6.2
HSF4MA0771.1chr2:54841596-54841609GAAAATTCCAGAA-6.17
MEOX2MA0706.1chr2:54840279-54840289GTTAATTACT-6.02
NFAT5MA0606.1chr2:54841592-54841602AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr2:54841592-54841602AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr2:54841592-54841602AATGGAAAAT-6.02
PKNOX1MA0782.1chr2:54840544-54840556AGACAGCTGTCA-6.37
PKNOX2MA0783.1chr2:54840544-54840556AGACAGCTGTCA+6.22
RFX1MA0509.2chr2:54842035-54842051TGTAGTCATGGAAACG+6.25
RFX1MA0509.2chr2:54842035-54842051TGTAGTCATGGAAACG-6.27
RFX4MA0799.1chr2:54842035-54842051TGTAGTCATGGAAACG-6.25
TGIF1MA0796.1chr2:54840544-54840556AGACAGCTGTCA+6.14
TGIF1MA0796.1chr2:54840544-54840556AGACAGCTGTCA-6.37
TGIF2MA0797.1chr2:54840544-54840556AGACAGCTGTCA-6.18
TGIF2MA0797.1chr2:54840544-54840556AGACAGCTGTCA+6.27
Enhancer Sequence
GGAGATCTCG TTTGAGTCTT GAGTTCTGAT AAGTTAATTA CTGTGATCTC ATCCAAATAA 60
ATCCATCCGC TGATCTGATT GTCCTGTCCT TGTGTTTCGG ATCTGCTGTG CGATGAGGGA 120
CACGTGTGGA CACTTTCTCT ACTAATCTTC ATCATTGTAA TGGGTTTCTC CATGACTGAT 180
CTCCAGCCTG TGAACATCTC CATCTCCTTG CAAACATTAA TCCAATGCCA GCGGATGAGG 240
AGCTGTAATA CAATCAGAGA TCAGATCCGA AGCTCAACCT CTGTGAGTGT CATTCAGAGA 300
CAGCTGTCAA CCATATCCAT CCATCCATCT ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT 360
CCATCCATCG TTCTATTGTT CTATCTATCC ATCCATCCAT CCATCCATCT ATCTATGATC 420
TGTCTATCCA TCTATCCATC CATCTATCCA TCCATCCATC CATCTGTCTA ATCCATCCAT 480
CCATCCATCC ATCTATCTAT CTATGATCTG CCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC 540
CATCGTTCTA TTGTTCTATC TATCCATCTA TCCATTCATC CATCTATCTA TGATCTGTCT 600
ATCCATCTAT CCATCCATCC ATCCATCGTT CTATTGTTCT ATCTATCCAT CCATCCATCC 660
ATCCATCTAT CTATGATCTG TCTATCCATC TATCTATCCA TCCATCCATT TATCCATCCA 720
TCTGTCTAAT CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCGTTCT ATTGTTCCAT CTATCCATCT 780
ATCTATCCAT CCATCCATCC ATCGTTCTAT TGTTCTATCT ATCCATCCAT CCATCCATCC 840
ATCTATCTAT GATCTGTCTA TCCATCTATC TATCCATCCA TTCATCTATC TATGATCTGC 900
CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 960
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1020
NNNNNNNNTC CATCCATCCA TCTATCTATG ATCTGTCTAT CCATCCATCC ATCCATCTGT 1080
CTATCCATCA ATCCATCATC TATCTGTCTA ACCCATCCAT CCGTCCGTTC GTCTGTCTAT 1140
CTATCTATCT ATTGATCAAT CGTTCTATCT ATCTGTCTGT CTATCTGTCT ATCGTTCTGT 1200
CCATCCATCC ACTCTATCTA TAATCTATCT ATATTTCCAG AACTAGTCAT TATTGTCTGT 1260
CTGTCCATCT ATATATCATT CAGTCTGTCT GTCTTTTTCA ATCTATCTGT CTGTCTGTCT 1320
AATGTAATAA TTAATGAAGT AATTTAATGG AAAATTCCAG AACTAGATAT CATATTATTT 1380
TTATGCATCT TTGTAAAAAC AAATTTATGT ATTGTACATT GATGAACTGT GCAGAATAAT 1440
TGAGTTGTCA CTTATATATG AATTTGTAAA GTATCAGATC AAGTGTGTTT GTGTGTGTGT 1500
ATGTGTATGT AAGAATGTGT GTGCACGTGA GTGTGTTTAT GTGTGTACAT AAGAGTGAGT 1560
GTGTGCATGT AGGTGTGTAT GTGATAGTGT AAGGTTATTT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1620
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GCGCGTGTGT GCGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1680
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT TTGTGTTATA GCACAGATGG CACAGTCATT GTCAGGCTGC 1740
TAAACCTTTG CACACACTTG TTAGGATGAA GGCTCTTGCC AAGATGACTG TAGTCATGGA 1800
AACGACACCA CTGTGAGATC ATGATATTGT GATGGAGATT TCTACAGTTA CATGTGAACT 1860
TCTTTGCTTT AGTCTGCCCT CAAACTCGTA CGCATCCAAA TAAACAAACA TTAGGCGAAA 1920
CAGAAAACTA ATATCAGTGC ATGTTTCATT CAGTGTAAAG CCCGTCACTC CAGAACAGCA 1980
AGAAAATGTT TCTGATAAAT CCCCATAAAC ACATTACGCA ACAGTCCTGA TATAACCATG 2040
ACATAATACT AGTTGTGTTA GGAGGTAAAA CTCTTAAGAA AAGACGCTCA GATCTTATTA 2100
AATCATATGA TTTTTTTAAG CTCTTGTAAT ATTGCGCTGT CACATTCTGC CTGGAAGCAT 2160
CTGTTGGGAG GACGCTTAGA GGAAGAAAAA AAGATGATCT GAATAGAGCT TGAACTAAAT 2220
GATCTTTTCA TAAAGGACAT GGACATAATC TTCCACCGCC TGCAAACACA CACACACACA 2280
CACACACACG CAACAGTACA GAAGTGCTTG ATGTATAGAG AAAGGGGTCA GTAAGTTTGT 2340
GTTATCGGAC ACTCACTAGC CACTTTATTA GGTACACCTG TCCTACTGCT TGTTAATGCA 2400
AATTTCTAAT CAGCCAATCA CATGGCATCA ACTCAATGCA TTTAGGCCAA GCGGCAACCT 2460
CCCGCTCTCT CTC 2473