EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-07251 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr2:46055521-46056587 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr2:46056326-46056343AAAAATTAATTAACTCT-6.08
Lhx3MA0135.1chr2:46056328-46056341AAATTAATTAACT+6.74
NR2C2MA0504.1chr2:46055904-46055919TGAGGTGAAAGGTCA+6.5
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr2:46055952-46055967AAGGTTAAAGGGTCA+6.17
Nr2f6MA0677.1chr2:46055905-46055919GAGGTGAAAGGTCA+6.6
PAX3MA0780.1chr2:46056371-46056381TAATCGATTA+6.02
PAX3MA0780.1chr2:46056371-46056381TAATCGATTA-6.02
PAX7MA0680.1chr2:46056371-46056381TAATCGATTA+6.02
PAX7MA0680.1chr2:46056371-46056381TAATCGATTA-6.02
RARAMA0729.1chr2:46055952-46055970AAGGTTAAAGGGTCATGT+6.19
RXRBMA0855.1chr2:46055905-46055919GAGGTGAAAGGTCA+6.78
RXRGMA0856.1chr2:46055905-46055919GAGGTGAAAGGTCA+6.66
RarbMA0857.1chr2:46055951-46055967AAAGGTTAAAGGGTCA+6.73
RargMA0859.1chr2:46055952-46055968AAGGTTAAAGGGTCAT+6.24
RxraMA0512.2chr2:46055905-46055919GAGGTGAAAGGTCA+6.8
Enhancer Sequence
AGGGTTTGAG TGTGTGTGTG TGTGTCTGTT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 60
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGCGCGC TGCAGCATTA ACAGTGTTGA AACATTGTCT 120
CCAGAGTGTC AGTCAAGCTT GCGAATCTTC TTGTGTGTTT GCGTCAGTCT GCACATGGCT 180
GTTTCTGAAA GACGTCCATG TGCTTTGTCA GGACAAAGTT AGAAAGTCCA GCAGTGAGGT 240
ACTGAGCCAT GTGTGTGTGT GTGTGGAGTC GCTGTCATTA CTGTCCATTA ATATCATCTA 300
TATATTTATC TGCCCGTCTC GCTGCTGGCC TGTTATATTT ATCTATAGCT TCTGGTCTCT 360
AGCTGACTCG TAAGCCCCGG GCTTGAGGTG AAAGGTCACG GCGAGCGTGT GCTGCTGATT 420
GTGCTGACTC AAAGGTTAAA GGGTCATGTG GGTTCGACCT TTTACGTTGA CATTTATTTC 480
CCCAGTGGGC ACTCCTGGGC AAAGTGACTT TCAAGGAATT GTGTATATAA GGGAGTGTGT 540
TGTGACATTT AGTCCTCAGC AGGTAGGGAA AGATTAAAAT CAAATGCTCT GCCTCGCTAT 600
GCTCAAAATC TGGTGCTGAA AGCGTGGAAA AATCTAGAGT GAAATGTCAG TGGGAAGATT 660
CAAATGGCAG TGGAGTGGAT TGGAATGGTT ATGGACCTGT AGTGGGATTT TAAAGGGGAC 720
CTATTATGCG AAAATCTATT TTATAAGGGG TTTAAAAACA ATTATGTGGC AACCGTTTGT 780
GATTATAACC AGCTTCTAAT AGTTAAAAAA TTAATTAACT CTATTTTTTA TAACCTGTGG 840
GTGAAACAAT TAATCGATTA AATAGACTTA AATCGATTAC TAAAAGTGTT GGCAACGAAT 900
TTCATAATCG ATTCGTTGTA TCGCACGACA CGGAGATGTT CAATCATTAA AAAAAACTTT 960
ACTTGAGCCT CTCTTGCGCA CTGATGCCAG CAAAGTTCAG CGCCACAGAC AGGACGGAGC 1020
AGAAAAATGA GTGGATGTAA CATTAGAGAA AAGATAAATG GCGAAG 1066