EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-07173 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr2:40503165-40504431 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF2MA0051.1chr2:40503589-40503607AATATACTTTCTCTTTCC-6.14
PKNOX1MA0782.1chr2:40503551-40503563AGACACCTGTCA-6.44
PKNOX2MA0783.1chr2:40503551-40503563AGACACCTGTCA-6.07
Enhancer Sequence
GGATATTGTC TCATTGATTA AACAGAGTAA CTGACTGTCC ATGTCCCTGT GCGCTGTGTA 60
GATTTCACCC GTCCTTTCCT TCTCTTTCTG AGTAACCCTA CACATCCATG GCAAAAATAA 120
ACCATTGTGG ACTGTCACCA GGATTATATC ATTATGGAAT TGAGATTTGC TGTCAAAACA 180
CACCACTAGA TCCTCAATTG CACTCATTGC ACACTGTTTT GGTTCTGTCT CTTCCTTCCT 240
TTCCTTTTTC TATCACTGCT TTGAGCTGAT GTTTTTTTTT TTCCCCTCCA TCTCTCTACC 300
TGACCCCTGG AGGCCTGAAG CAGGCCATTC ATGCTGTCTG CGTCTGCCAC AACCAATTAC 360
AGTTCCAGCA GAGACCAGAG CAGCCCAGAC ACCTGTCATC CTCCACTCCT CTGTCCTGGA 420
GCCCAATATA CTTTCTCTTT CCACTGACTC CCTCTCGCTC CTCCTTTTAT GACGTTGGCC 480
GATCGCTTCT ACTTAGGCTG TTTGATTCCT TCTCTTCGGT CTGCGTATTT AATTTCTTTT 540
TTGTTCCAGG CACATGCCCT GCAGTAAGTC CTGCTGTCTG GTAGTCTTTT GAAAGCTACG 600
TCATGCTTTA TTTCTTGAGC AGGGTCCAGG AAATTGCACA GGATCAGTAT GAAGCTTTAA 660
AATGGGTGAA CGAGTTAGAC CGGTGAACAG GTTATGTTGT GATTTTAAAA TCAGATTGTA 720
AGTTTTGTTA TGGATAGGTT GGGTAAATGT GAAGCATGAC AAAGTGTATT TCTGCCGTCA 780
GGTCAGGTCA AAATGAAGAT ACTTACAATT CTGTCGACAA GTGGAAAATA CTGTCTCTAT 840
CTATCCATCT ATCCATCTAT CCATCCATCC ATCCATCTAT CTATCCATCT ATCTATCTAT 900
CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT 960
CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT 1020
CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCGTC TATGTCTGTC TGTCTGTCAA 1080
TTCCACCGAT TGGTCTGTCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC 1140
ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC 1200
ATCCATCCAT CCATCCATCC AATCAAGCCA ATTTTTTGAA CTCCAGTATG AGTTTCCCAG 1260
GATGAG 1266