EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-07091 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr2:33154875-33156563 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr2:33156132-33156142TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr2:33156132-33156142TCTAATTAAA+6.02
Alx1MA0854.1chr2:33155882-33155899ATTGGTTAATTAATTGG-6.08
GFI1MA0038.2chr2:33155723-33155735TGCAGTGATTGA-6.18
HOXC11MA0651.1chr2:33156439-33156450GGTCGTAAAAC+6.14
HOXC12MA0906.1chr2:33156439-33156450GGTCGTAAAAC+6.14
HOXD10MA1506.1chr2:33156439-33156450GGTCGTAAAAC+6.62
HOXD12MA0873.1chr2:33156439-33156450GGTCGTAAAAC+6.02
Hmx2MA0897.1chr2:33155614-33155631ATTGATTAATTGGTTGA-6.31
Hmx2MA0897.1chr2:33156044-33156061ATTGATTAATTGGTTGA-6.31
Hmx3MA0898.1chr2:33155614-33155631ATTGATTAATTGGTTGA-6.21
Hmx3MA0898.1chr2:33156044-33156061ATTGATTAATTGGTTGA-6.21
IKZF1MA1508.1chr2:33156445-33156457AAAACAGGAAGG+6.18
MEOX2MA0706.1chr2:33156466-33156476AGTAATTAAC+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr2:33155578-33155591ATTAAGTGGTTGA-6.1
PBX1MA0070.1chr2:33155730-33155742ATTGATTGATGG-6.62
PBX2MA1113.1chr2:33155365-33155377CTGATTGACAGA+6.18
Enhancer Sequence
TTTTTTTTTC AAGGGAAATT GGCTGTTACT CTGCAGATGT CATAGTCTCT GTTCCTGATA 60
AGCAGCGTGT GATTGATTGA TTTTTAGATT CTCTTTTGAC GATTGGCACC CACAGCTTCT 120
CCTTTCAACC TAAGATAAAA ACAAGCTGCT TTCTTTTACT TGCGGTGCTG AGGTTACAGC 180
CTGCCTTGTA TTATTTGCCA ATTTAATGTG ACAGGCAACG GCGGCTTCGA TCAGGGTTTT 240
CAGATGGATA GGAATGTCTT AAAAGTATTG CCGGGATTAT GCCAAAGCCT ATTATACTTT 300
AATGAAATTA TCCCCACACA AAATCTCCCT CACACTTTCT CTCTCTGACT TTGATCTCTA 360
GGTGTTTATT TGTTATATCC ACCCTAGCCA ATTCAATAAT TATGCAGACA AACAGGTGAA 420
AAGCAGGGTC TGTGCTGAAT ATAAGAGAAG AGATCAGGCA ATTTAGCATA TTTTATATTT 480
GCAAACACAT CTGATTGACA GACAGACAGT CTGATTGATT AATAAATGGA TAGATGGATT 540
GATCGATTAA TTGGCTGATG GATTGATGGA TAGATGGATG GGTGGATGGG TGGATGGATG 600
GACAGATTTG ATTGATTCAT TTTTTGATGG ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATTTGA 660
TCGCTTAATT GGTTGATGGA TGGATGGATT GATTGATCGA TTGATTAAGT GGTTGATTAA 720
TTGGTTGATG GATGGATTGA TTGATTAATT GGTTGATTTA TTGATGGATA GATGGATGGA 780
TGGAATATTG GATTCATTGG TTGATTAATT GGTTGATGGA TAAATGGATT GATTGATTAA 840
TTGGTTAATG CAGTGATTGA TTGATGGATG GATGAATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA 900
TGGGTGGATG GATGGATGGA TGGATTGATG GATGGATCGA TGGGTAAATC GATTGATTAA 960
CTGGTTGATT TATTGATGGA TGGATGGATG GATGGAATAA TGGATTTATT GGTTAATTAA 1020
TTGGTTAATG GATGAATGGA TGGGTAGATG GATGGATTGA TTATCAATTG ATGGATGGAT 1080
GGATGGATGA ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGAAA TGATTAGTTG TTTGATGATG 1140
GATGGGTGGA TGGATAGATG GATGGATCGA TTGATTAATT GGTTGATTAT TGGTTGATGG 1200
ATTAATGGAT GGATGGATGG ATTGATTGAT TAATTGGTGG ATTGGTTTAT AAATAGCTCT 1260
AATTAAACAC TGATCCATTC AACGTTCGGG ATGGATGGAT TGATTGATTA ATTGGTGGAT 1320
TGGTTTATAA ATAGCTCTAA TTATACATAG ATCCATTCAA CGGAATGCCC CAACCTGGAC 1380
TCCTGCCTGT GTTTAGCAGT AATACAGAAG ACATTCATTC TTATCAGGTG ACGGGAGTCG 1440
GAGGGAAAAC CAACCCTCGC TCCTGTCCTA ATCTTGTTTG TCATTGCTAA ATGAGCAGCC 1500
ACACTAGGTG TGTTAGCGTC TAATGAATTT ACAACCTGAT ATCAGAAGGC CTTAGACTGA 1560
CAGGGGTCGT AAAACAGGAA GGGAAAAAAG CAGTAATTAA CATTTATTAG CTGCCTTGTC 1620
ATCTGTGCTG GTTGGCTTGG GAGTATGGAT AATATTGCAG TGATCAATTA ATTTTTAATC 1680
ATCTCTAG 1688