EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06933 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr2:15673270-15674566 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr2:15674543-15674554GTTTTATGGCC-6.62
CDX4MA1473.1chr2:15674543-15674554GTTTTATGGCC-6.32
CTCFMA0139.1chr2:15673546-15673565CAGTGCCCTCTTGTGGACT-6.33
FOXA1MA0148.4chr2:15673926-15673942CTTTGTTTACTTAATA-7.62
FOXC2MA0846.1chr2:15673927-15673939TTTGTTTACTTA-7.22
FOXD2MA0847.2chr2:15673928-15673941TTGTTTACTTAAT-6.98
FOXE1MA1487.1chr2:15673927-15673942TTTGTTTACTTAATA-6.24
FOXF2MA0030.1chr2:15674166-15674180TTTGTTTATGTTTA-6.3
FOXP2MA0593.1chr2:15673927-15673938TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr2:15673924-15673941TTCTTTGTTTACTTAAT-6.16
Myod1MA0499.1chr2:15673636-15673649TCCAGCTGTTCCT+6.09
Enhancer Sequence
AATTCCAGCG TGGGGATTGG CATGATTGAC ATCATTGAGT ATTCAGCACA TCTTTTTATT 60
AATTCATCAG AAGGACTTGT TTCGAACCAG TTAATATGCA TGATGTACTC CTTTTACCAG 120
TTACAGTGTT CAGAGAGACA TCACGTGTTG CCAACCGTAA TTAAAACAAG TAGAAGAAGA 180
AGAGTTGTTC GGAGACATGG GTTGTTTATA AATGTGCCAC AACGAAGGTT CTGTTTCTAT 240
TTCCCCACGA TGAAAGTGCT GCTGTCACAC CTGCTGCAGT GCCCTCTTGT GGACTCTTAA 300
GGGCACTAAG TCTTGTTTTG GTTGTTTTCA TTTCCTGTAT GCCTGCTCAC ATGATCACTC 360
CTTGTTTCCA GCTGTTCCTT GTTGTCTAAT TGGTTCTGTC TTTTATAAGC CTTGTCATGT 420
TGTGTTTAGT TTGCCTTTGG ATTTTGCTTT GCTCTGTCCT GTTTTGCTTT GTCCTGTTTT 480
GCTCTCCCCT GTTTTGCTCT CCAGTTCCTC ATGTTAGGTT CGGTTTGTTT GTTCACTTTT 540
AGTACCGTCT CGATGTTTTT GGATCCCTGT TAAGATTTAG TTTGATTCAG TGCTTTTAGT 600
TTTTGCACTT GCGTTTGTTT TGTCAGTTTT TGTACCTTGC CTGTTATTTG GATCTTCTTT 660
GTTTACTTAA TATATTAAAC TATATTATGC TGCATTTGGA TCTACTCCTT GTTTTTGTAA 720
TACCTCATCG TGACAGCTGC TCGCTTGTAT GTTTGTAAGG AATATTTTTC ACCCAAGAGC 780
TTTTAAAATC TGGAAATGGT GAAATCTGGA TTTGCCACTC ATTTTCTTTA AAAAAAAGAT 840
GCAATTCCAG TTTGTGTTAA TTGTCCCGTT TCTATGGATT TGGCAAGTGT GTATTCTTTG 900
TTTATGTTTA TTCAGATGGC AAAGTTAGTT AGTATTGTCA GCAATACTCT TTCAGTTATA 960
AAAGACATAA CTTAGTCAAA ATAATTTAGT TACTAAGTTT ACAGAATGTT ACTATAACTA 1020
CAATATTATG GATTGAAAAT CCTCAACTTC TTCACAGCTC TCAGATCCAA AGAGTAAATG 1080
CTACTCTCCA AATCCCTGTC TATCTCCCCT GCGTCAGTGT TTGTGTTGCC ACTGTGAAAA 1140
TCAGCATGTG CACGTAATAA AACTCTGCTT TTCATATAAA CCCTTTCCTC TTTCGCCACT 1200
CCCACCTAAA CAAAGCTGGA CCCAGCCACT TGCCTGACTT TTCACACAAG AACACCCTGG 1260
TGAGACAGTG GGGGTTTTAT GGCCCTTTAA TATTCC 1296