EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06890 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr2:13479129-13480261 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr2:13480148-13480159ATATTAATTAA+6.62
Foxd3MA0041.1chr2:13479622-13479634GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr2:13479626-13479638GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr2:13479397-13479409GAATGTTTATTT+6.74
Lhx3MA0135.1chr2:13479460-13479473GGTTAATTAATTT-7.22
POU6F1MA0628.1chr2:13480150-13480160ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:13480150-13480160ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
CACAGTTTAA TACACTTCAC ATTTTTATTT CCATTTTCAA TAATTTCATG TCATAAGTTA 60
CTAGTATGGA GTGCAAACTT TCTAGATCTT TTGACAAGGT TTATAGACAT TTATTTATTT 120
GAGTTTAAGT TACCTGTGGG ATCCAGGATG GCATGGCTTA GTGCTCCAGA TGGAGGTCCG 180
GTTGCTCTAA GGGACCGGCT GGCAACATTT GCCGACATTT TGTTCCGCCT GACTAAACCA 240
AAATACAAAT TGGCTGAGGG GGTTGTTTGA ATGTTTATTT CTTTATTTTT GTTTATTAGT 300
AGTATTTGAA TTGCTAATTT GTTTATATAT TGGTTAATTA ATTTTAAGTG TATCATTTAA 360
CTATGTTTGG TGGTTGTTTT GTATTAGTTT GTGATGTTTA ATTTCTTTTT TCGTAATGGA 420
CAAGTCCCTG TCTTTTGTGT ATTTAAGTCC TGTTTGTGTG TTAGGAAGGA GGTCTGCTTT 480
TCTTTTTCTC TTCGTTTGTT TGTTTGTTTG ATTTGGTTAT GTTTGTTTGC TTTAAGTCTA 540
GATTTGATTT TAATTTATTC AAATGCTTTA ATTTGTAACT TTATTTATAA TTAATAAATA 600
CATTTTCTTT TGGAAATTTT GTGTTCGTTG CCCTTGACTG CTTGGTCCCT CACAGTACTT 660
TTATTGCCAC TGTCTCTCAC ACTACCCCTA CTGTAAGTTC CATTGTCTCC GGCAATCATC 720
ATGAGGTTGA TGCTGTGCCT CACGCTGTAC CTTCTAGACT CAACCAGTGC ACCTATAATT 780
TTAGGGCATC TTTGGGTTGC CTGTTTCTGT GTCTTCTGTG TTACAGGTGG AGTCAGTGGA 840
TCTGATCGGG GTTCCGGCAG AGTACCTCAA CCTGCACCTA GTCTTCAGCA AGTCCTGGGC 900
CACCACCTTG CCTCTGCATT GACCTTACGA TTGTGCCATT GAGTTCCTCT TAGGCACTTC 960
TCCGCCTAAG GGACATTTGT ATTCCCTGTC CCTTCCTGAA AAAGAGGCCA TGGACAAGTA 1020
TATTAATTAA TCCCTTAAAG CTGGCCTTAT CCGTTCCTCC CCTTTCCCAG CGGGAGCTGG 1080
GTTCTTCTTC GTCAAGAAGA AGGATGGCTC CCTCCGTCCC TGTATTGGTT AT 1132