EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06880 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr2:12347636-12348410 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx4MA0853.1chr2:12347872-12347889AGTATTAATTAATTTAC+6.09
ArxMA0874.1chr2:12347872-12347889AGTATTAATTAATTTAC-6.22
FOXA1MA0148.4chr2:12347686-12347702CATTAAGTACACAAAG+6.18
Lhx3MA0135.1chr2:12347874-12347887TATTAATTAATTT-6.37
Lhx3MA0135.1chr2:12347877-12347890TAATTAATTTACC+6
POU6F1MA0628.1chr2:12347875-12347885ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:12347875-12347885ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr2:12347896-12347909TATTCATTCACTC+6.28
ZNF24MA1124.1chr2:12347900-12347913CATTCACTCATTC+6.54
ZNF24MA1124.1chr2:12347904-12347917CACTCATTCATTC+6.92
ZNF24MA1124.1chr2:12347908-12347921CATTCATTCATTT+7.34
Enhancer Sequence
GTGGCGCTTC ACATATAACA GGAATGACAC ACTTAACACA TTATACTTAA CATTAAGTAC 60
ACAAAGTGTT GGTGTTTATT GTGTTAAGTG TCTCATTCTG GTATATGTTA TATATTACTA 120
TTCACTGAGT AATATCAAAT CATTATACAC TATATTGTTT ACTATATGGT TGGGGTTTAA 180
ATGTGTATTA TGTTTGGGGA CAGTTACATA GTAATTTATT GTAATTACAA AATTAAAGTA 240
TTAATTAATT TACCTTAAAG TATTCATTCA CTCATTCATT CATTTTCTTT TTCGGCTCAG 300
TCCCTTTATT AATCTGCGGT CGCTACAGTG GAATGAACTG CCAACTTATC AAGCATCCAG 360
CATCCATACA CACTCATTCA CACTCATACA CTAAGGACAA TTTAGCTTAC CCAATTCACT 420
TATACCACAT GCTTTTGAAC TTGTGGGGGA AACCAGAACA CCCGGAGTTA ACACACGCGA 480
ACATGCAAAC TTCACACAAA AATGCCTACT GGCCCAGCTG AGGCTCGAAC CAGCGACCTT 540
CTTGCTGTGA GGTGATGGTG CTATCTACTG TGCCACTGTG CAGCCCTAAA TTATTATCAA 600
AAGTATTATC AAAGTAAATC TAATAGACAT CTAACAGACA TATAAACAAA AGAGCTTAAC 660
ATGCTAAACA CATGCAAAGT GAAAAATACA CATCAGCAAA TTAATAATAA TAATTATAAT 720
AATTATAATT CTTTGCATTT GTACAGCGCT TTTCTGGATA CTCAAAGTGC TTTA 774