EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06857 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr2:8484288-8485323 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr2:8485036-8485049ATTAAGTGGTTAT-7.34
ZNF384MA1125.1chr2:8484340-8484352AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr2:8484341-8484353AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr2:8484342-8484354AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr2:8484343-8484355AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr2:8484338-8484350ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr2:8484339-8484351TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr2:8484337-8484349AATAAAAAAAAA+6.62
ZNF384MA1125.1chr2:8484981-8484993TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
CCCTTAGCCC CGTTATTGTG TCAGATTGTT GTGAAATGTG TCCTCTGGAA ATAAAAAAAA 60
AAAAAAAGCT GCTGCGCTTG ACTTTGTGCT TGCATTGCTC GTGCCTCCTT CCTCCATTGA 120
GAACGTGGCC CATCTGCTCG CTCGGGCTGA GAATAGCACA GGCAGAGCCC TGAGGGTCAC 180
GTCCATCACA GCATTAATCT TGTACACAGC CCAGTGTGTG TGTGTGTGCG CGCGGCGCTC 240
GCCTCCTCTC CCTTCACCTG ACAATGAGGT TATTATGAGG TTGCCATGCC CCGAGCAGCT 300
TTCTAAACAG TCCCAGAGCT GACAGGAGTC AACTGCTGTT TGTGTGTAAG GCTTTTCACA 360
AACAAGACTG TGCACTGCAA GGTTGTTATC AAGGACATGC CTATTATTTA GTGCGTGTAA 420
ACAGGTGAAC TTTGAAAAGA TTTACATTTT TTTGGGGGTG GATGGTGTTT GGCGTAGTCT 480
TAAAAGTGTG TTCTAAGGGA AATTTAATTT AGGTTGTCGA AGTGTTTTAA AGTGTGATGC 540
TGAATGAAAA ATGTGGAGTG CTAAAAGTGT AATTACTGTT TTATGTTAAC TGAATATCTA 600
AAAAATGTAT TCAATTATTT ATTTAATTTT TGGACCGGAG ATGATTTAGG GTGCTGAAGT 660
GACTTCGCTG AATGTTTAAT GTTTGTCGAA GGATTTTTTT TTAAATTTTA CATATTTATT 720
TAACAATTTT TTTTATTTAA AAATGCTAAT TAAGTGGTTA TAGTGTGCAA TATGGCGGCT 780
TGATTTATAT AAGGCTGAAT GATTTATATC AGTGTTTCTC AAACTGGTGG TTTGCGACCC 840
AAAAGTGGGA ACATTTTCAG TGGGTCGCGG AGTGTGTGAT CAAAAAAACA ACAAAGGTTT 900
AATTTTTAAC TAATTTTGAC TTTTATTTTG AAATGTGTGC ACGACAACCC TACTGTTTGT 960
TGTGAAATTT AGTTATAAAA GTTTAATTAT TGCATCTAAT ATATCAAAGC GCAAGTACGA 1020
CCCTGAATAT GTAAA 1035