EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06853 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr2:8087255-8089170 
TF binding sites/motifs
Number: 29             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EOMESMA0800.1chr2:8088631-8088644AATTTCACACCTA-6.46
FOXE1MA1487.1chr2:8087748-8087763GTTGTTTGTTTAATT-6.37
FOXE1MA1487.1chr2:8087973-8087988GTTGTTTGTTTAATT-6.37
Hmx1MA0896.1chr2:8087857-8087874ACTGATTAATTGTTTGC-6.05
Hmx1MA0896.1chr2:8087977-8087994TTTGTTTAATTGCTTGA-6.11
Hmx1MA0896.1chr2:8087274-8087291ATTGATTAATTGGTTGT-6.19
Hmx1MA0896.1chr2:8087498-8087515ATTGATTAATTGGTTGT-6.19
Hmx1MA0896.1chr2:8087654-8087671ATTGATTAATTGGTTGT-6.19
Hmx2MA0897.1chr2:8087857-8087874ACTGATTAATTGTTTGC-6.67
Hmx2MA0897.1chr2:8088089-8088106ATTGATTAATTGGTTAT-6.79
Hmx2MA0897.1chr2:8087274-8087291ATTGATTAATTGGTTGT-7.66
Hmx2MA0897.1chr2:8087498-8087515ATTGATTAATTGGTTGT-7.66
Hmx2MA0897.1chr2:8087654-8087671ATTGATTAATTGGTTGT-7.66
Hmx2MA0897.1chr2:8088152-8088169ATTTATTAATTGGTTGT-7.82
Hmx3MA0898.1chr2:8087857-8087874ACTGATTAATTGTTTGC-6.27
Hmx3MA0898.1chr2:8087977-8087994TTTGTTTAATTGCTTGA-6.38
Hmx3MA0898.1chr2:8088089-8088106ATTGATTAATTGGTTAT-6.42
Hmx3MA0898.1chr2:8087274-8087291ATTGATTAATTGGTTGT-7.36
Hmx3MA0898.1chr2:8087498-8087515ATTGATTAATTGGTTGT-7.36
Hmx3MA0898.1chr2:8087654-8087671ATTGATTAATTGGTTGT-7.36
Hmx3MA0898.1chr2:8088152-8088169ATTTATTAATTGGTTGT-7.67
ONECUT3MA0757.1chr2:8087271-8087285ATTATTGATTAATT-6.01
ONECUT3MA0757.1chr2:8087495-8087509ATTATTGATTAATT-6.01
ONECUT3MA0757.1chr2:8087651-8087665ATTATTGATTAATT-6.01
PBX1MA0070.1chr2:8087530-8087542TTTGATTGATTG-6.18
PBX1MA0070.1chr2:8088112-8088124TTTGATTGATTG-6.18
TBR1MA0802.1chr2:8088633-8088643TTTCACACCT-6.02
TBX20MA0689.1chr2:8088633-8088644TTTCACACCTA-6.14
TBX2MA0688.1chr2:8088633-8088644TTTCACACCTA-6.32
Enhancer Sequence
TCAATTAATT GACTGAATTA TTGATTAATT GGTTGTTTGT TTGATTGATT CAATATTTTA 60
TTGATTGATT GATTGATTGA TTGATTGATT GATTGATTGA TTGATTGATT GATTGATTGA 120
TTGATTGACT GATTGGTTGT TTAATTGATA GATTTATTGG TTAGTTGATT AGTTTATCAA 180
TTGATTGATT CACTTATTTG TTTATTGGTT GTTTTATTTA TTTATCAATT AATTGACTGA 240
ATTATTGATT AATTGGTTGT TTGTTTGATT CAATATTTGA TTGATTGATT GGTTGTTTAA 300
TTGATGGATT TCTTGGTTAT TTGATTAGTT TATCAATTGA TTGATTCACT GATTTGTTGA 360
TTGGTTGTTT TATTTATTTA TCAATTTATT GACTGAATTA TTGATTAATT GGTTGTTTGT 420
TTGATTGATT CAATATTTTA TTTATTTATT TATTTATTTA TTTATTTTTA TTTATTGATT 480
GATTGACTGA TTGGTTGTTT GTTTAATTGA TTGATTTGTT GGTTAGTTGA TTGGTTTATC 540
AATTGATTGA CTGACTGATT TGTTGATTGG TTGTTTTATT TATTTAATTG ATTGATTGAT 600
TGACTGATTA ATTGTTTGCT AGATTAACTG ATTGATTCAT TGGTTGGTTG GCTGATTGAC 660
TGATTTGTTG ATTGATTGAT TCATTGGTTG TTTTAATGAT TGATTGATTG ATTGATTGGT 720
TGTTTGTTTA ATTGCTTGAT TTGTTGGTTG GTTTATCGAT TGATTGATTG ACTGATTTGT 780
TGATTGGTTG TTTTATTTAT TTATTTATTT ATTCATCGAT TAATGGCCTG ACTTATTGAT 840
TAATTGGTTA TTTGTTTTTT GATTGATTGG TTGTTTTATT TATTGATTGA TTGACTGATT 900
TATTAATTGG TTGTTTGTGT AATTGCTTGA TTTGGTGGTT AGTTGATTGG TTTATCAATT 960
GATTGACTGA ATTATTGACT GACTGGTTGG TGTATTGATT GATTGATTGA TTGCCAATTA 1020
GAGGAAAGGA TAAATAAATT GTGGTAATCA ACAGCATATA CCCTGCTGAT TAAGTGTGTA 1080
GCTAGAACTG AGCCTGAAAT ATTCATCTAA AGGCTTTGCC ATCCTGTGCA TTTGCAGGAG 1140
TCCAACTTTG CATAATTCCA CCTCTGCTTT CATCTTAAGT AATGCTTCAC ATGACAAATC 1200
CACTTGTTAC TTTTAGTTAA TGGCTGCGCC GACACCTTCA CTAATCACCC CGGCCCCATA 1260
CAGATAGCAG CAGCGCAGCA TAAAATATTT CACCTCTGTG TATCAATGTA TTATTAAAAA 1320
GTCATTTATA TTTAATGCCT CAGGTCACTG CGAGGTGTGC AAAGCTATAG CAGCACAATT 1380
TCACACCTAA CCACCAGGAA CTCAAACCAA TCCTGTCGCC TCTAAATGGA CATATGTGGG 1440
CCGTGTTCGT GCTAAATGCA GATGTGAAAT CGAATAGATT ATGCAACGCT GAGCCCCCGT 1500
GGTCCTGCGA TGGGGGATTA AAATGCAGTT GATATGTATA TCACCCAGCA GGGATTAATG 1560
GATTAGTCCT GTCCTGGCCA TAACAACACG AATCAACAAG TCTGGAGAAA CAAGGTTGTG 1620
GCACTGGCTC AGGGTTACAC GTCGATCAGA GAATTTCTGT GGCGTTTAAA AACTTAAAAA 1680
TAGTGACTTT TTACATCGTT TGGAGTTTTG ATGTTTGTCT ACAAGTGGTC TTTGGGGACG 1740
TCAATTCATG CTGGTTCCCA AACCCCAGAC TCTGGAGTGT GTAATCCTGT CTAACACGCA 1800
TGCAAATCCT ATCTTTTGCC TTACACAATA GCCAGTCTGT GTGCTACTCG GCAATAACAA 1860
AGATAGCAGT TAGCGACTGG CTACGTCTCA GCTCAAAGGG GGTAAACTTA AAAAA 1915