EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06788 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr2:350577-351891 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF2MA1465.1chr2:350720-350734GTATGATGTCATCA-6.46
IKZF1MA1508.1chr2:351823-351835AAAACAGGAAGC+6.62
PBX3MA1114.1chr2:350918-350935GAGTGAGTGACAGTGTG+6.06
PBX3MA1114.1chr2:351170-351187GAGTGAGTGACAGTGTG+6.06
PBX3MA1114.1chr2:351053-351070TTCTGAGTGACAGTGGG+6.14
PBX3MA1114.1chr2:351456-351473AGTTGAGTGACAGCGTG+6.43
POU1F1MA0784.1chr2:350763-350777CTCATTAGCATAAA-6.64
POU3F1MA0786.1chr2:350764-350776TCATTAGCATAA-6.22
POU3F2MA0787.1chr2:350764-350776TCATTAGCATAA-6.44
RREB1MA0073.1chr2:351020-351040TGTGTGTGTGTGTGTTGTGT-6.19
SP1MA0079.4chr2:350741-350756AAAGCCCCGCCCACT+6.69
SP2MA0516.2chr2:350740-350757GAAAGCCCCGCCCACTA+6.98
SP4MA0685.1chr2:350741-350758AAAGCCCCGCCCACTAG+6.42
TCFL5MA0632.2chr2:350948-350958GTGCGCGTGA-6.02
Enhancer Sequence
CAAACACAGA TCATCAGCAT GTGTGTGTGT GTGTGTGTAT CTCCAGGTGC CTCTAATGGT 60
TAACAGTAGT GAATTGTGTT TGTTCTAATC AGACTTGATG AAAACAGTCT GCAGGATCTC 120
TGTGATTGAC ATTCTCCCTT TGTGTATGAT GTCATCAGAG GGGGAAAGCC CCGCCCACTA 180
GTGACCCTCA TTAGCATAAA CAGCCCTGAG TGTGTGAGTG AGAGTGTGAG AGAGAGTATT 240
GTGTGTTTGC GACTGTGTTT GCGTGAGTGA CTGTGTAATG TGTGTGTGTG TGTGTCAGTG 300
AATGTTCTGA GTGACAGTGT ACCTATGTAT GAGGTATGTG TGAGTGAGTG ACAGTGTGTA 360
ATGTATGATA TGTGCGCGTG AAAGTGTGTT TGTGTGAAAG ACTTGTGTGT GAGTGAGTGA 420
TTGTGTGTAT GTGACAGACA GTGTGTGTGT GTGTGTGTTG TGTTTATAAG TGAGTGTTCT 480
GAGTGACAGT GGGTATGGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG AGTGACGTGT AATGTACGAT 540
GCGTGTGGGA GAATGTATGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT ATGAGGTATT TTTGAGTGAG 600
TGACAGTGTG TAATGGATGA TTTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTATGGT GTGTGTGCAA 660
GGTATGTGTG TGTGAGTGAA AATGTGTAAT GTTTGATGTG TGCGCGAGTA TGTATGTGTG 720
TGTATGAGGT ATTTATGAGT GACAGTGTGC ATGGTGTGTG TGACAATGTG TATGAGGTTG 780
TGTTTGTAAG TGAGTGTTTT CAGTGACAGT GTGTATGGTG TGTGAGTGAG TGACAATGTG 840
TAATGTACGA TGTGTGTGTA TGTGAGGTGT GTGTATGTGA GTTGAGTGAC AGCGTGTAAT 900
GTATAGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGAGGT ATTTTTGAGG GTGACAGTGT 960
GTAATGTATA ATGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTACCA CGCTACGTCC CCCGCGGTCG 1020
GTGTGTCTCA GTGTGAGGGT GAAGAGCCCC GCGCGGTTCG GGTTCATGCT GAGCTGCAGC 1080
CGCAGAGAGT CGGAGCCCAC CGGCAGCGGC CGCACGGAGA CCCGCACCGA CATCAGCACC 1140
GTACTGCAGC CCGTGCTCGT CGACATCACG ACAGATGCAG GATCCCCGTT ATTACCGGAC 1200
ACTCACATCA CAACACAACA CAGCTACTTC ACCGAGCGAC CGAGTCAAAA CAGGAAGCGG 1260
TCCGTCTGAT ATTATTTACC GCCACTTTCT CCTGACACAA ACGTGTGGTT CCGA 1314