EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06780 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr2:347-1433 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr2:453-468TATTAATAATTAACT-6.01
HNF1AMA0046.2chr2:453-468TATTAATAATTAACT+7.27
HNF1BMA0153.2chr2:454-467ATTAATAATTAAC-6.92
RREB1MA0073.1chr2:1170-1190GGGTGGGGGTTGGTTAGGGC-6.35
TWIST1MA1123.1chr2:581-594AAACATCTGGTTT-6.33
Enhancer Sequence
TGACTACCCC TAGTTGACTA CCCCTAGTTG ACTACCCCTA GTTGACTACC CCTAGTTGAC 60
TACCCCTAGT TGACTACCAA TTATGTATTA TAAGAATATA TTATTATATT AATAATTAAC 120
TATTAATTCA GTATACTGGG GTAGAGTTCA GTAGGGGTAA TGTTCTCAAC TTAAGAACTG 180
ACCAGATTTT GTTTAGGGTT GTGTTTTAAA ATTGTTTTAT GTTCTTCACT CACAAAACAT 240
CTGGTTTTAG GGTTAAGTTT GAGGGAAGGT TGTTATTTAC AATTAGGTTT GACTTACGGG 300
TAGACATGGT TTAGTCAATT TTCCTTCAAT GCTTTAAGAA ATGATTTGTT GCTCAGAGAA 360
GTTAGTTTAG GATTGGTTAA GAAACCCTTG TAGTTAGTAT AAGGTGTAAG ACAAAAAAAA 420
GTAGATGAAG AGGATTCAAA ATGCTGGTTA AGACCATGCA AGAAAGAACT GAACATTGAA 480
CAATCTTGGT GAAAAATCCA TCGATGTGTG GATGGGAATA AAATGATGAT TCAAGTGACA 540
TAGTATCCAA GTAGATGACA TCGATCCAAG ATAAGGCTAG TGTTCGAAGA GAGAGAGAGA 600
AAGGATGGTT AAACTGATTA GAGTTTAAAA AGATTGCACT AAGGAAATCC AGATGACCAA 660
GATGTTGATA CAAATGAAAC CATGATGCAT ATGAAAGATC CAATAGATTA TCTGACATTA 720
AAATATCCAT ATAATCAAAC TCCTTTTGGT TGGGTTAGAG CAGTTTCAAT TTATAAAACG 780
TATGAACATG ATCCAAATAC ATGCCAAGCT TACCGTTGTT TAGGGGTGGG GGTTGGTTAG 840
GGCTGTTTCA TCCACATTAA ATTTAGTTAC TACCGATGTT GGATCATATT TGCTGCTATT 900
TTTCTACTTG ACAGTTTGGA ATGAGGAACC TAAGGATGTT TGGCCTTTTT AGGCCATGCA 960
CTGCCAGCCT TTCTGGCCTT CAGGTTCACA CACCAGTCTT CAGTCCATCC CCACACTCCA 1020
TATGGGACAG GACAGAGGTG AGCAAAGAGT TAGGGTTAAT CTTCAAGTTA AGATTAAATT 1080
GTTATT 1086