EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06761 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr19:48086232-48087860 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr19:48086273-48086290GTATTTGTTTATTTGTT-6.01
RARA(var.2)MA0730.1chr19:48086468-48086485AGTTCAGCTGAAGGTCA+6.4
Rarb(var.2)MA0858.1chr19:48086468-48086485AGTTCAGCTGAAGGTCA+6.12
Enhancer Sequence
CCTTTAAAAC CAGAACCGTG ACATTAATAG AGCTTTGAGC TGTATTTGTT TATTTGTTTT 60
AGCTGGCTTA AGAAATACAG ATATTTAAAT GTATTTCCTT CTCCAAGAAG AGCTCAGCCG 120
CACTTGTGTG TAGAAAACAT CTGTTTGGGG CTTTAATAAG ACTGAGGCCC GTCCAGTGAC 180
CCAGTTCAGA TGCAGATATA CAGACGGATC TGCTGGCTAA TCTCTCATCT GTCCAGAGTT 240
CAGCTGAAGG TCAAACTGCA GATCATAGAC AAGATGAGGA GAAGAATAAC ACTGATCTAC 300
AGCCCTGACC GCTCAACACA CACACACACA CACACACACA CGCGCACACA CACACACACA 360
CACGCACGCA CGCACGCACG CACACACACA CACACACACA CATACAATTA TCACTCAAAC 420
ACACACACAC ACACTACTCA AACATACACA CAACAAACAC GTGCACACAC ACTCACACAT 480
ATTACTGAAA CACATAACTC TAACATACAC ACACACTTAA ACACACGCCT GCATCTAGAC 540
ACTCACACAC ACAGATCTGA CTCAAACACA CACCACATCA CTTAAACACA CACATTACTC 600
AAACATAAAA ACACACATTA CACTCAAACA CACACATACA AACACACAAC TCAAAAATAA 660
AAATACACAG ATCACTCAAA CACACACACA CACACACACA CACACACTCA AACGCACGTA 720
ACTCTAATAT AAACACACAC ACACACTCAA ACAAACTCAA ACATAAACGC ACACACATCA 780
CTCAAACACA CATAACTAAC ATAAACACAC ACACTTCACT CAAACACACA CCTGCACACA 840
GACACACACA GATCTCACTC CAAAAACACA CATTACACTC AAACACACAC ATACAAACAC 900
ACAACTCAAA AATAAAAATA CACAGATCAC TCAAACACAC ACACACACAC ACACACACAC 960
ACACACACAC ACACACACAC ACACTCAAAC GCACGTAACT CTAACATAAA CACACACACA 1020
CACACACTCA AACACACACA AACATAAACA CACACACGTC ACTCAAACAC ACACCTGCAC 1080
ACAGACACAC ACACAGATCT CACTCAAAGA AACACACACC ACATCACTCA AACACATACA 1140
CACACACACA CACACACCTC AAACACACAC AGATCACTTA AACACATGCC CACACACATA 1200
GAGAGCACTG AAACACTCAC ATATACACAC ACACGTACGC ATACACACAC TTCTTATATG 1260
TCTACACACA CATCACTCAA ACGCACACAT ATGTAATCAC ACACATGTAC ACATACACTC 1320
ATAGAGCGCT AATGCACTGT GCTGGAGCTG CATGATTATA AATGCAGGAG ATCGCTTTCA 1380
TCAGAACACA CACACACATC AGGTCACACA CACACACACA CACACAAACA CACTCTGCCT 1440
TCCATTAAGA GTAGATTGCA GGACGTTTAT TTGGCACTGA CTCCGGCGCT CTTCATTACT 1500
TGATTCTCTT TGCAGCACGA TTGCTTTCCT CTCTGCCAGA AATGACTCTC TGTGTGCGTC 1560
TCGCAGCTTC TCACCAGTCT ATTATCATCA TCATCAGCTC ACTCTCACTG TGTGTGTGTG 1620
TGTGTGTG 1628