EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06719 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr19:46301248-46303021 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxo1MA0480.1chr19:46302924-46302935TCCTGTTTACA+6.62
PBX1MA0070.1chr19:46301568-46301580ATTGATTGATGT-6.44
SMAD3MA0795.1chr19:46302883-46302893TGTCTAGACG-6.02
Enhancer Sequence
AAAGCACTGA TCGTTCGATG AAGTCTTGAA GCAGTCTATA TTATGAAGTC AAGAAAATAT 60
CTCAGTATTA GTTTGTGTTT TTAAATTCAG ATGATATAGT GCAGAGACAT CCCACAAGCA 120
AGAGCTACGT TTGCCGAAAT ATCTGCGAAT ACAAATACAT GGTTTATTGT GCATCTCAAT 180
GCAGCAGTGT GCCATTTGGT TCTTGAATGA ATCAGTTTTT AAATTATTCG TTTGAGTCAA 240
TGATGGATGG ATGGATGGAT TGATGGATGG ATAGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT 300
GGATGGATGG ATGGATTCAG ATTGATTGAT GTATTCAGAG TGATAGATAG ATTCAATCTG 360
TTTTTGAATG ATTCAATTGA GTCAATGAAT CATTTGAAGT GTGTAGGATG GATGGATGGA 420
TGGATGGATA GATTCAGATT GATTGATAGA TTCAGATTGA TAGATAGATT CAATCTGTTT 480
TGAATGATTC AAAAAGTTTA TTCTGAGTCA ATAAATCATT TGAATCATTT GATGTATGTG 540
GGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 600
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT 660
GCATGGTGTG CATGGTGGAT GGATGGATAG ATAGATTCAT ATTGATTGAT AGATTTAAAA 720
TGATAGATAG ATTCAATCTG TTTTTGATTG ATTCAATTGA GTCAATGAAT CATTTGAAGT 780
GTGTGGGACG GACGGACGGA CAATTCAGAT TGATTAATAG ATTGAGACTG ATAGATAGAT 840
TCAATTCAAG ATTTGGTTCT TGAATGAATC AGTTTATGAA TGATTCGTTT GAGTCAATGA 900
TGGATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATT TAGATTGATT GATATATTCA GACTGATAGA 960
TAGATTCAAT CTGTTTTGAA TGATTCATCT GAGTCAATAA ATAATTTGAA TCATTTGATA 1020
TATGTGGGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG 1080
ACAGACAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG 1140
ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG 1200
ATAGATAGAT TCAGATTAAT AGATTAAATC TCTTTTTGAA TGATTCATTT GAGTCAATAA 1260
ATCATTTGAA TCATCCGATG TGTGTGGGAT GAATGGAAGG GTGGATAGAA AGATTCAAAT 1320
TGATTGATAG ATTCAATCTG TTTTTGAATG ATTCATTTGA GTCAATGAAT CATTTGATTC 1380
AATTTGAGCG TTCTAATTTC AATTCAGTCT CATTTAGGGT AATTCGCACA CTTAGAGTAA 1440
TCCAAGAGTG TTTGCAGCAT GTCTGGGTAA GAGGAGGTGT GTAACATTAG TTTTAGTGTA 1500
ATTAGGGAAA CAGATTTGTT GTTAACGCGG TTCCTCCATT GTCCACATCT GTGCGGCGGG 1560
ATGAGCGGTG TCCGGTTCTC GATCCACACA TCAGCTCAGC GATAGCAGGC TAAATAAACA 1620
GAGAGGAGGA AACCCTGTCT AGACGAGGCT GCTGTCGGCT GCTACACACA CCAGCCTCCT 1680
GTTTACACAA GGGGGGAACA GCCATACACA GCCAGAACAC CATGAGCAGA GTGAAACACA 1740
GAGAAGCAGT GCTGTAGAAA AGAGTGTGTG TGC 1773