EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06500 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr19:26493794-26495710 
TF binding sites/motifs
Number: 35             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr19:26494526-26494541TTTGTTTGTTTTGCC-6.04
FOXE1MA1487.1chr19:26494546-26494561AATGTTTGTTTTGGG-6.04
FOXE1MA1487.1chr19:26494294-26494309TTTGTTTGTTTTGTC-6.05
Foxd3MA0041.1chr19:26494604-26494616GATTATTTGTTT+6.07
Foxd3MA0041.1chr19:26494265-26494277GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr19:26494521-26494533GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr19:26494525-26494537GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr19:26494261-26494273GATTGTTTGTTT+6.92
Foxj3MA0851.1chr19:26494733-26494750AGTTTTGTTTATTTTTT-6.35
IRF1MA0050.2chr19:26494418-26494439GTTTAGTTTCTTTTTCTTGTT+6.43
LMX1BMA0703.2chr19:26494820-26494831AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr19:26494835-26494846TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr19:26494824-26494837TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:26494828-26494841TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:26494825-26494838AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:26494829-26494842AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:26494832-26494845TAATTAATTAAAT+6
Lhx3MA0135.1chr19:26494821-26494834ATTTAATTAATTA-6
PHOX2AMA0713.1chr19:26494819-26494830TAATTTAATTA+6.62
POU6F1MA0628.1chr19:26494826-26494836ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:26494830-26494840ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:26494826-26494836ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:26494830-26494840ATTAATTAAT-6.02
POU6F2MA0793.1chr19:26495444-26495454AGCTCATTAT+6.02
PROP1MA0715.1chr19:26494819-26494830TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr19:26494819-26494830TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr19:26494819-26494830TAATTTAATTA+6.62
RREB1MA0073.1chr19:26495219-26495239GGTGGTTGGTTGTTTTGTTG-6.28
SOX10MA0442.2chr19:26495208-26495219TGCTTTGTTTT-6.02
SOX10MA0442.2chr19:26495416-26495427TGCTTTGTTTT-6.02
ZNF384MA1125.1chr19:26494844-26494856TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr19:26494845-26494857TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr19:26495142-26495154TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr19:26495143-26495155TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr19:26495144-26495156TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
TGCCTTTTAA GCAAGATGGG ACAGGTTTAC ACAGAGACAG AGTTCTGTTT TTACAGTTTT 60
TTCTGAGTTT TAGGGCAGAT TGGTCAGATG CAGCTTTTGT CTGTTCTGTC ATCTTGTTTC 120
CACTATTTTG TGACGTTTTA ACTATTTATA GAGAGAGAGA GAGTGCGTTG TATTTTAAAG 180
CAGTAATCTC ATTGTTATTG GTTTATGAAT GGAGGAATTA TTAAATCATG TATTATTTGT 240
TCATTTATTG GTATTGGTTG ATTGAATGAT TAAGTATTTT TTAAGTTAGC TTTGTTTTAT 300
TTTGATTGGT AGTTTCAATT ATTGAATTTT TAATTTTTAG TTGGATGGTT TTGTTTTAGT 360
AGTTGTTCAG TGGTATTGTT TAGGTTTTTT GAATTTAGTT TTTCATGCTT TTGGGGGAAG 420
GGTCCTTTTA TTTTTTGGTC AGTTTTGTTT TGATTTGTTT TTGTTTTGAT TGTTTGTTTG 480
TTTGATTAGT CTTCATGTTT TTTGTTTGTT TTGTCTGGCT TCTTGGTTTA TTTATGTTTA 540
TGTTTGGTTT GTTTTGGTCT GTTGTTTATA ATTGGTTGCT TGCTTTTTTG TGGATGGCTG 600
TTTGGTTAAC TGCCTAATAG TTTAGTTTAG TTTCTTTTTC TTGTTTTTTG TTGATTTAGT 660
TTTGTTTGGT CTTTTTTGTG GTTGTTCATG CTATGTTTGT TGTGTTTATT TGTTCATTAT 720
TTTTATTGTT TGTTTGTTTG TTTTGCCTGA TTAATGTTTG TTTTGGGTTT TTTGGTTGGT 780
TGGTAATCTT TTGTAGATTA ATTGTTGCTG GATTATTTGT TTGGCTTGTT TTTGTTCGGT 840
TTTGTTTTGG TGTTTGTTGT TTTGTTATTG ACTGCTTACT AGTTTTGATT TTGATTTGAT 900
AGTTATTTGA TTTTCTTTTT CTTGTTTTTT GTTGATTTTA GTTTTGTTTA TTTTTTTTAG 960
TAGCTGGTAG TCATTTTGTG CTGTTTTTAT TTGTTTGTTA ATTTTTATTG TATGTTTTTT 1020
CCCCCTAATT TAATTAATTA ATTAATTAAA TTTTTTTTTT TTTGGTTGGT AATTTTTTTG 1080
TAGAATAATT GTTGCTAGAT TTGTTTGTTT TCCTCTTTTT TGTTCTGTTT AGTTTTTTGT 1140
TTGGGTTGCA GCTTGTTGTG ACTACTTACT AGTTTTGATT GATTTTTCTT TTTTTTGTTG 1200
TTTTTGTTGA TTTTGTTTTG TTTGGTCAGT TTTTTTGTGG ATTGTGTTCA TTTTTGTGTT 1260
TGTTGTTTTT ATTTATTTGT TAATCAATTT ATTTTTATAT ATATATTATT CCCTGATTTC 1320
GTTTTTTGTA TTCCCTGTTT TTCTTTTCTT TTTTTTTTTT TTGGTTGATT TTTGGGTTTT 1380
TCTTGTGTTC AGTTCTGTTG TTTTGTTTTT TGGTTGCTTT GTTTTGGTGG TTGGTTGTTT 1440
TGTTGTGTTT GACTGCTTAC TAGTTTTGTT TTAATTGGGT TTTGTTTAGT TTTATTTGAA 1500
TTTGAATATG TATGTATGTA TGTATGTATG TATGTATGTA TGTATGTATG TATGTATGTA 1560
TGTATGTATG TATGTATGTA TGTATGTATG TATGTATGTA TGTATGTATG TATGTATTTG 1620
TGTGCTTTGT TTTCATAATC TTAATCTTGA AGCTCATTAT TGTCATTGCA CATATCATTG 1680
AGTCATGAAG TATCCACAGG TCTGAAAAAA CAGGCAGATC ACCACTAGCT GACTCTGTTT 1740
CTAAACCCAG ACAAAAGGGG AGAGTCAGGG GACTTGTTTT AGCTTTTGTG TTGCAAACAA 1800
TGTGGCACTG GTGTCCATTG GCGTCCACTG GCGTCCATTT TGAGGCGTCC ATGTTAAGAG 1860
GAAAGAAACA GCCTAATTTG GCCAAAGTGC TTCTTTCATT GTAGACCAAA TATTCT 1916