EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06438 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr19:20117885-20118721 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr19:20118575-20118585GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr19:20118575-20118585GTCACGTGAC-6.02
CDX1MA0878.2chr19:20118289-20118300TGCCATAAAAC+6.14
Dmbx1MA0883.1chr19:20118137-20118154AAAACAGGATTAATTAA+6.82
MITFMA0620.2chr19:20118571-20118589GTAAGTCACGTGACATGC+6.74
MITFMA0620.2chr19:20118571-20118589GTAAGTCACGTGACATGC-6.74
RREB1MA0073.1chr19:20118356-20118376GCGTGGTGTTTGTTTGGTGG-6.41
ZNF384MA1125.1chr19:20118195-20118207TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr19:20118196-20118208TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr19:20118197-20118209TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
ATAATAACAC GGTTAAAAAT GGGACACACA GGTTTAAATA AAACATTACA TTTAATAGGA 60
AAACATCCAA CTGGATTGTG TGATAATTGT CAGGAGGAGG AATCAGTTGA ACATGTTTTA 120
TGTTACTGCA AGAAATTCAT AATAGAAAGA GAAATATTAA AGAAAGAAAT TATAAAACAA 180
AACTTTTCAG AAATCAGCGT AAAAATTATA CTTGGAAACG ATAACAATGA AAGTTTAGTA 240
AAATATCTAA GGAAAACAGG ATTAATTAAC AGGATTTAAA AGAATAAAGA TGTAGGTAAA 300
TGTTAATGGG TTTTTTTTTT TTTTCTCTCT CCGGGAGGTA GCAAACTCAG GCTCACACTC 360
CAGTACAATA GGTGGCGGTA ATGCACCAAA AGTTGGTTGC CGACTGCCAT AAAACAGCAA 420
AGAAGAAGAA GAAGAAGAAG AAGAAGGGAG AAATGAGCTG TTGTTGTTTT GGCGTGGTGT 480
TTGTTTGGTG GTGTCCGTGT GCGTTGTCGC TGCTACTGAT GTGTACTTTG ATTGAGATTT 540
ATATATGTTG ACATTGAGTG AGATTAACTG ATGACTTTGA GTGAGATTTG TTTGAGAGTT 600
CTGACGAGTG TTTCTACATC TATAGCCCGC TATTGCTCCA TTCAAAAACC TTCTGTGACA 660
TGACAAGGGA GATCTGGAAC AACATAGTAA GTCACGTGAC ATGCATAAAT GCACACAGGA 720
TTATTGATGT ATAGACACAC TAGTTAGCGA AGTGCGCTAA TTTTGTATTT TTATTCATAA 780
GTTAAAGTAA GTTCAGGGCG CTTTGCACTG AAGAGTTTTC TTTTCATATT GTTATT 836