EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06346 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr19:13322488-13323436 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PAX6MA0069.1chr19:13322768-13322782TTCATGCTTGATTT+6.2
SOX21MA0866.1chr19:13323174-13323189AACAATGTGATTGTT+6.62
SOX21MA0866.1chr19:13323174-13323189AACAATGTGATTGTT-6
Sox11MA0869.1chr19:13323174-13323189AACAATGTGATTGTT-6.5
Sox1MA0870.1chr19:13323174-13323189AACAATGTGATTGTT+6.16
Sox1MA0870.1chr19:13323174-13323189AACAATGTGATTGTT-6.51
Enhancer Sequence
AAAAGCTAGT CACACTCCAA AGCACTTCAG AACGTTGAAG TACTAAAATA AACAAAAGTC 60
ATTATCAGAA AAATGACTGA AGGAACAGCT CCACTGTTCT TCAACGTCAG AGCCAAAGTG 120
AAGTAATCAA ACGCACTGTC TGCCACAGAG AAACCGGCCT TTTCTGCACC TCTCTCCTTC 180
CATACTGTCC CTCTCTTCCA TCTCTCTCTC TCACTCTCTC TCAGTGGTCT AATCTGTGAG 240
GGACTTAAAG GGACCTTATC TCCGGGCTCT CCTGCTTCAT TTCATGCTTG ATTTACTTTA 300
ATTTGTCTGA TAGGGCAGCA GGATTTGGAG ACGGCCCATC TTTGGCTTGG GTGACGAGTG 360
AAAAAAAAAA GCCACTCTGA TATTTCTCTG GCACATTGTC GCGGGTTTTT GACTTCTCTC 420
CTCTCTCTCT GCCACGAGTT CCTGGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGCGA TGGGAAAAGG 480
CCGAGAGAGA ATGAGAAAGA TCTCAGTGTG GTGTAGCAGG CTGTTTGAGT GTGCTTGAGT 540
CGAGCAGACG GGGAAGAAAA GGACTGTGGG AGTGTGGCGT GATTGTGTGA TGTAGTCCTT 600
CACAGGCTGA GATGTTGGAG GCAAAGGGCA CTACGTGGAT GAGTAGGGTT CAAACCTGGA 660
TGCACAATAG ACATGTTACA CTTATTAACA ATGTGATTGT TTACAATAGT TTGTCTCATT 720
TATGAAATAC AAGCTTAGCT TGTTTTGGTC CCACTTTACA GTAGGTGTCT TCATTGTTCT 780
TATATCCAAA AATATTAATT GTTATAGTGT GAATGTTGTG TAGCAAAACA TGGTAGAGCT 840
TTAATTAACA CTTTAATTTA TCACAATTCA CACTATTAAT AATTATTTGC CTATCATTAA 900
GATATTAACC GTTTATTAGT AGTTATAATG TATGATGTTA TTCTATAT 948