EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06248 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr19:3514786-3517088 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr19:3516981-3516998GGATTTAATTAATCCGT+6.04
Alx1MA0854.1chr19:3516980-3516997GGGATTTAATTAATCCG-6.05
Alx4MA0853.1chr19:3516980-3516997GGGATTTAATTAATCCG-6.44
LMX1BMA0703.2chr19:3516982-3516993GATTTAATTAA+6.02
RFX2MA0600.2chr19:3515129-3515145GGTTGCCTTAGCAACA+6.06
RFX3MA0798.1chr19:3515129-3515145GGTTGCCTTAGCAACA-6.18
RFX3MA0798.1chr19:3515129-3515145GGTTGCCTTAGCAACA+6.2
RFX5MA0510.2chr19:3515129-3515145GGTTGCCTTAGCAACA-6.64
RFX5MA0510.2chr19:3515129-3515145GGTTGCCTTAGCAACA+6.79
Enhancer Sequence
ATTGGTATTA TTTTTGCAGC TCGACAGCCT CGTCTCATTC TCAACGGCTG ACTTTGCTCT 60
ATTTTCTGCA TTCTGTCTTT CTTCCTCTCC GTCTTTCTCT CTGTATGAAA GTCACTGGGG 120
TTACCCGACT CCCGCTGGGT CCTTGGGCTC CCGTTCAGGA CTGCCTCTCT ATCAAACTAG 180
CCTTGTTTCT CTCTCAATCC TTTCTTGTCC TCTATCGTCA TCCATTGGGG TCTCTCCCAC 240
AGATAATCAA TCGTTCACAG TCAATCCTCC TTATAAAAAA AAGAGAGAGA GAGAAACACT 300
CTCCTTCCAT CTGCAGCAGC AGCACCTGCA CACACACAGC TCTGGTTGCC TTAGCAACAG 360
CTCCATCCAG CCTTGCTTGT AGAAATACAC ACACCCTTAT AAGGGCTTCC GGTGGTCCGC 420
ATTGAGGGTT TGGTTTCTTC AGAGCTTCAT ATTCACAAAA CAAAAGACAC ATTCACAAAA 480
ATGGAGCACA TCACTTTTGC TTTAAAGACA GCAAATCCAT CTATCTATCA ATCCATCTAT 540
CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCATCCATC CATCCATCCA TCTATCTATC 600
TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC 660
TATCTATCTA TCGATTCATA TATCCATCCA TCCATCCATC TATACATTTA TCTATCCATC 720
CATTAATCTA ATATCCATCT ATCCATCAAT TCATCTATCC ATCTGTCCAT CAATTGTTTT 780
GCTCTTCCAC TCATCCATCC ATCCATCCAT CAATCTATCC ATCAATTAAT TTATCCATCC 840
ATCCATCCAT CAATTTAAAA GTACATCCCT CCATCCATCT ATCTATACAT TTATCTATCC 900
ATCTATCCAT CCATCTATCT AATATCTATC CATCCATCCA TCCATCTAGG CATCAATCCA 960
CCTATCCATC TATCCATCCA TCAATTTATA TATCCATCCA TTTATCAATC CATTCATCTA 1020
TCCATCCATC AGTTCATATA TCCATCTATC TATCTATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA 1080
TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA TCAATTCATA TATCCATCTA 1140
TCTATCTATC CATCAATCCA TCAATCCACC CATACATCAA TCCATTCATC TATCCATCCA 1200
TTAGTTCATA TATCCATATA TCCATCCATC CATCCATCTA ATATCTATCC ATCCATCCAT 1260
CCATCAATCC ATCCATCCGT CCATCAATTC ATATATCCAT CCATCCATCC ATCCATCAAT 1320
CCACCCATCC ATCAATCTAT TCATCTATCC ATCCATTAGT TCATATATCC ATCCATCCAT 1380
CAATTTCTCT ATTCATGAAT CCATCCCTTT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT 1440
CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT 1500
CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATTTGTCC GTCCGTCCGT CCGTCCATCC ATCCATCCTA 1560
TATCTATCCA TCTATCCATC AATCCACCCA TCAAATCCAT CCATCTATCT GTCCATCCAT 1620
CCATCAATTC ATCTTTCCAT TGATACATCG GTCCATCTGT CCATCAATTG TTTTGCTTAT 1680
CCATCCAACA ATCCATCCAT CTATCAATTC ATATATCCAT CCATCCAATA TCTATCTATT 1740
ATTCCATCAT ACATCTGTCC CTCCATTCAT CCATCCAGCC ATCCATCCAT CCATCCATCC 1800
ATCCATCTAT TTGTCTGTTA GTCCGTCTAT CTTTCTATCT GTCTATCTAA TATCTATCTA 1860
CACATGTACG CTCACACAAA ACACATTTAT ATACATATCA ATAACTAATG ATCAATACTT 1920
TTAATATCTA AAGAAATACT AAGTCAATAC AAAAGTTCAA CCTGTACTTT AAATGACCTA 1980
ATCAATGCTG CACTCTTAAA ATATGATTTC ACTCTGAAAT ACGTGACACA CAAAAGCAAA 2040
AAATAGGTCG CAAATGGAGT TTTATGACTT GCAACAATCG AAACGCACCA AAAAACCACA 2100
GTCTGCCCCA GAAAGAGCAA ACGCCGCAGG GCTTTACATT TAAGACGGGC AAGAATGTTC 2160
ACCAGATCTG CGAACATTTG AGGGATTTGC TTGAGGGATT TAATTAATCC GTGGCATTCC 2220
ATCAACTTGA AAAAGTGACA TTGTAAAATT TAACCGGCCA ATATTTTTTT ATTTCCCTTT 2280
CTCATTCACA AGCAGCAATT TT 2302