EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06246 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr19:3486377-3487505 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Atoh1MA0461.2chr19:3486552-3486562AACATATGTT+6.02
Atoh1MA0461.2chr19:3486552-3486562AACATATGTT-6.02
BHLHE23MA0817.1chr19:3486551-3486563AAACATATGTTT+7.22
BHLHE23MA0817.1chr19:3486551-3486563AAACATATGTTT-7.22
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:3486931-3486949GAAAGGAAGGATGGATGA+6.06
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:3487087-3487105GAATGGATGGAAGGAAGG+6.66
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:3486964-3486982GGAAGGATGGATGGTAGG+6.68
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:3487099-3487117GGAAGGATGGATGGTAGG+6.68
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:3487095-3487113GGAAGGAAGGATGGATGG+7.88
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:3487091-3487109GGATGGAAGGAAGGATGG+7.91
FOXC2MA0846.1chr19:3486626-3486638TAAATAAACAAA+6.18
LMX1BMA0703.2chr19:3487379-3487390TTAATTAAAAC-6.14
LMX1BMA0703.2chr19:3487376-3487387AATTTAATTAA+6.32
OLIG1MA0826.1chr19:3486552-3486562AACATATGTT+6.02
OLIG1MA0826.1chr19:3486552-3486562AACATATGTT-6.02
PHOX2AMA0713.1chr19:3487375-3487386TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr19:3487375-3487386TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr19:3487375-3487386TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr19:3487375-3487386TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
AATTTTACTG TTTTTTGTAT TGCACGAGTG AAATAAGGCC ACATTATAAG TTTACATTAT 60
AAAACTAACA ATGGAAATCA ACACAAACAA TACAGTATCA ATTTATGTTT ATGTTTTTAA 120
TAAAGTATGC TACCTGTCAG TATTGGTCAG ACTATATGTC ATCAATGCAT ATACAAACAT 180
ATGTTTATTT ATATTATATG GACAGTGGAG GCATATTTAA CAACATATTT ATTTATTTAT 240
TTGGATCAAT AAATAAACAA AATAATTGAC GAATGGATGG ATGAGCAAAA CAATTGATGG 300
ATGGATGGAT GAATGGAAGG ATTGAAAGAT AAGCAAAACT GTAATTGGAT GGATGAATGG 360
ATGGATATAT GGATCGATGA ATGGATGAGC AAAACAGTTG ACGGACGGAC GGACGGATAG 420
ATGGATGGGC AAAACAATTG ATGGAAGGGC AGACACATGG TCGGAAGGAT GGATGGATGA 480
ATAGGCAAAA CAATTGACAT CAGGATGGAT GGATGGATGA GCAAAACAGT TGACGGATAG 540
ACAGACAGAC GGTCGAAAGG AAGGATGGAT GAATGGATGG GTTATAAGGA AGGATGGATG 600
GTAGGAAAGT TGGATGGATG GATGAATAGG CAAAACAATT GACATATGGA TGGATGGATG 660
GATGGATAAG CAAAACAGTT GATGGATGGA CGAACGGTGG ACAGGTGGAC GAATGGATGG 720
AAGGAAGGAT GGATGGTAGG AAAGATGGAT AGTAGGACAG ATAGATGGAT GGATGGATGG 780
ATGGATGAAT AGGCAAAACA ACTATCATAT GGATGGATGA ATGGAAGGAT GGATGGGCAA 840
AACATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 900
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCCA 960
TCTATCTGTC CACACATGCA AGCACACTGT ATGTATGTTA ATTTAATTAA AACATGACAA 1020
TTTAGGGATG GGATGTCCTT AAATGAAGAA AATAACACAA ATAAACGATA ATAAAAACAA 1080
ATATTATTTT TTACAGAGAC GTGATGTGCT TAAGTGTTAT AAAAATAC 1128