EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06209 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr19:1197496-1199630 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr19:1197537-1197549AAACAAACATAC+6.37
KLF13MA0657.1chr19:1198016-1198034AAACAGTGGGCGTGGCTT+6.67
KLF14MA0740.1chr19:1198019-1198033CAGTGGGCGTGGCT+6.01
KLF14MA0740.1chr19:1198169-1198183TAAGGGGCGTGGCT+6.04
MNX1MA0707.1chr19:1198787-1198797TTTAATTACC+6.02
SP1MA0079.4chr19:1199117-1199132TTAGCCACGCCCAAT-6.1
SP1MA0079.4chr19:1198170-1198185AAGGGGCGTGGCTAG+6.73
SP1MA0079.4chr19:1198020-1198035AGTGGGCGTGGCTTT+7.48
SP3MA0746.2chr19:1198020-1198033AGTGGGCGTGGCT+6.54
SP4MA0685.1chr19:1199117-1199134TTAGCCACGCCCAATTC-6.55
SP4MA0685.1chr19:1198168-1198185TTAAGGGGCGTGGCTAG+6.89
SP4MA0685.1chr19:1198018-1198035ACAGTGGGCGTGGCTTT+7.12
SP8MA0747.1chr19:1198020-1198032AGTGGGCGTGGC+7.22
ZNF24MA1124.1chr19:1199550-1199563CATTCATTCATTT-7.34
ZNF24MA1124.1chr19:1199546-1199559CATTCATTCATTC-7.82
Enhancer Sequence
ATCTGAAAAA GCGTACACAG CGGCCTCTGG TGGAATTGTG AAAACAAACA TACCTCCTGG 60
GACGTATTTG GTGCTCTCCA GATATATAGG GGTACGTATC AATAATGAGC CTAGCTTGGC 120
CAATAGTGTT TAGTTTTATC ACAGCTCTGC CAGTGAGAGT GGCATTAAAT AAAAAGCAAA 180
TGAAAAGGAG GCGGGGCATG TCAGACATCA GCATTTGATT GGTCTGAAGA TTTGATCAGA 240
AACTGAAGTA TGAGGTGAAG TTGAAAAACA CATTGACCCA TTTAGGCGGA AGTAACAAAA 300
TGCAAGCTTT AGATGTATAT ATGAGGTTTC TAAATGTAAA TTTTGGAGCA CACTAGATTA 360
TAGATAATCT TAAAACTAAT ATACTGATGC TAACATCTAG GAAAACTATT TCACAAGACC 420
TGTAAAGTCC AAATAAAATG GGGAGGCAGA GTATTGAGGG CGGCATCCGC GATACAACAC 480
CCCCACTTCA GTTCCTAGAG AAACGCAATT TTAAATGAGA AAACAGTGGG CGTGGCTTTT 540
TTTCTACTGC AAGCTGATTG GATAAAGTAG GGGTTTCATT TCGAAAGATG GGGAAAAGGG 600
TTTGGGGAGA GTAATTACAA CCTAAAAGAC TCCTCCTGCT CACCGTTTCT GTCTGTTGTC 660
AAAAGTGACA GCTTAAGGGG CGTGGCTAGG GTTAGGGTTA GGGTTAGGGT TTGAAAGAAT 720
TACAACAACT CCCCCCATCC TAGCACTAGT CTAGGTAGGT TTGAAGTAGG GAGATTGAGG 780
AAGCGTGCAC GGGCCCGCGC TTGTCTGACT ATATACCATA AGAGCGTTGA TCTTCCCCCT 840
CCTGTGTGGG AGGGTTAGCC TTGCTTGTGG GCTTTGGGCT TGAGACTTGA TGAGGGGAAG 900
TGTTTTTGTG TCATGATTAT TGGCTGTTGC ACGATGTGCC AACATCTTTT GGGATGGTTT 960
TGGTGGGTTC GGATGCTGTA GGGTTCGATG GGTGAGGTTT GGGATTAATT TCTCCTTTTG 1020
TTACTCCCTC AAGACCAGCT GTGAGAGGGA AATGTTTAAG ACACTTCATC AGTAGTGTAC 1080
CTCAGATTCA TCGGGTGTTT CGATTCTTTA AACACTAGTC ACCCTCGTCT GAGGCGATCA 1140
GCGCTGGTTG ATCAATTCCA GGCCAGTGTC TTACTGCCAA TTTGTGGTGG GAAGTCGACC 1200
AGATCCTCAA TCTGTTTGTT TTGGGTTCTG GTGTTTAGTG AGGGTTGTTA GGGGGTTGGT 1260
GTGTTTTTTC GAAGGCTTGG GGTTATGCCC TTTTAATTAC CGAGAGTTAG GGTTTGTTGT 1320
AGGTGAGGGT TGTCCTTTTT GAACTAGAGT TGGGTTTAGG GTTCGGGTTA GATGAGGGCA 1380
GTCGTTTCCC TAAGCTTTTT ACAAGAATTA GGGTTTTGCC CTTTGGTTGG GTTAAGGGTT 1440
TGGTGCGGGT GAGGGCTGTC CTTTGACAAT TAGGGTTACG AGTTTGGGTG AGACGAGCAC 1500
TTTCGTTTTC TCAAATTGCT TAGAATAATT AGGGTTTTGC CCTTTGGTTG GGTTTAGGGT 1560
TTGATGCGGG TGAGGGCTGT CCTTTGACAA TTAGGGTTAC GAGTTTGGGT TAGGGTTAGG 1620
GTTAGCCACG CCCAATTCCT CAAACAGACC TAATCTGAGA TTTAACCTGA AAACAAACAA 1680
GAAGTGCATT TTCACATTTC AATTTTAGAT TAATTTATTT ATTTTTGTTC TTAATGACAT 1740
GCACAAATAA AATGTTCACC ACAAAACTAG CAATGTGCGC TAGCTAAATC AATATGTTAG 1800
TTAGATTTCA TGTGGACTTT AAGTGCGAAT AACGCACACA CACTCAAACT GTTCCCAACA 1860
TAATCTCATC TAAATGTGTG TGCGCTCTCG CATTTCCGCT CCGCAGTTAG AGCAGATAAA 1920
AATATTAAAG CTATCAGCCC TCAGATGAGA TTAAAACACT CGTCCAGGGT TCAATCTCAT 1980
AGACAGAAAG ACATGTTGAG CTGTCTGTGA ATACGGCCTT CAATTTAGAG AAAGCTGGAA 2040
GTGGAGTAAG CATTCATTCA TTCATTTTCC TTTGGCTAAG TCTCTATTTT AGAGGTCGCC 2100
ACAGCGGAAT GAACCACCAA CTATTCCAGC ATAT 2134