EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06194 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr19:556664-557336 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF4MA0833.1chr19:556712-556725TGTTGCATCATCT-6.22
JUN(var.2)MA0489.1chr19:556966-556980ATGAGTCATTATTT-6.33
KLF13MA0657.1chr19:557067-557085CTAAAATGGGCGTTTCAT-6.84
KLF5MA0599.1chr19:557158-557168GGGGCGGGGC-6.02
NFYAMA0060.3chr19:557126-557137GACCAATCAGA+6.14
POU1F1MA0784.1chr19:557260-557274CTCATTTGCATAGT-6.41
POU1F1MA0784.1chr19:557026-557040CTAATTTGCATAAT-8.12
POU2F1MA0785.1chr19:557028-557040AATTTGCATAAT-6.92
POU2F2MA0507.1chr19:557026-557039CTAATTTGCATAA+6.13
POU3F1MA0786.1chr19:557027-557039TAATTTGCATAA-7.22
POU3F2MA0787.1chr19:557027-557039TAATTTGCATAA-7.22
POU3F3MA0788.1chr19:557027-557040TAATTTGCATAAT-7.22
POU5F1MA1115.1chr19:557028-557039AATTTGCATAA-6.14
Pou2f3MA0627.1chr19:557025-557041ACTAATTTGCATAATC-6.38
SP1MA0079.4chr19:557156-557171AAGGGGCGGGGCTTA-6.51
SP2MA0516.2chr19:557155-557172AAAGGGGCGGGGCTTAA-7.6
SP4MA0685.1chr19:557154-557171AAAAGGGGCGGGGCTTA-7.36
Enhancer Sequence
TGTTGTGTGT GGTTTGGTGC CACCCGTCTT TCCCATGATG TTTTTTTGTG TTGCATCATC 60
TTGTTTTGCA TTTAAATGCC TCTTTTATTT ATAGTTTTAT TATTTTAGCC ACAATAATGT 120
GATGCGACAC AAATGACAAA ACTCACCAGC TTGAGTTTAA AGAGCAGCTC ATGTGGGCTT 180
ACCACAAACA TCCTGTGAGC AGTTTGTAAC CTAGCTGTTG TTCAGTGTAG CTGTGAGGGA 240
CGTTTAACCA GTAAAGAAAG ATAATGTCTT TCAAAATGAA GAGTCAGCTC TGAATTGCCT 300
TAATGAGTCA TTATTTTAAA TCTTTTGCCT GCTACTGAGT TACATTAACT CGATCAAATG 360
AACTAATTTG CATAATCTCC TCCCCTTATG ACATACAGAC ACTCTAAAAT GGGCGTTTCA 420
TTTCAGACAC ACAAAGACCA ATTAAAACAG ACTTGACCAG CTGACCAATC AGAGCAGAGT 480
TAGCCTATGG AAAAGGGGCG GGGCTTAAAG ATCTGAATTT ATTCAAATTG ATTCAAGCGA 540
ATCATATCTT TGAATATTTT GCCTGCTATT AATTTATATC AACACAATCA AAGTAACTCA 600
TTTGCATAGT TCACATCCCT GTCACATACA AGCACTCTAC AATTGGCGTT TAATTTTAGA 660
TATAGACCAA TC 672