EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06189 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr19:472857-474486 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr19:473051-473062GCCCCGCCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr19:473051-473061GCCCCGCCCC+6.02
PBX3MA1114.1chr19:473895-473912CACACTGTCACTCAAGC-6.14
RARA(var.2)MA0730.1chr19:473087-473104TGACCCTCATCTGACCC-6.25
SP4MA0685.1chr19:473048-473065GGAGCCCCGCCCCCTTC+6.17
ZSCAN4MA1155.1chr19:473891-473906TACACACACTGTCAC+6.13
ZSCAN4MA1155.1chr19:473442-473457CGCACACACTGACAC+6.7
Enhancer Sequence
AAATAATTAC GCTTTTATCT GCGGGAGTCC CTGAACATGG AACGGCTGAA AGTTTTCTGC 60
AGTGCACAGG AGTGTCTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGACGG TTTGCTCATC TGGAGCTAAA 120
CAGCAGAAAG ATTTTAGCCA ATCACAGCTA ATCGTCCCCC AGAGTCCACC AGTGCAAACG 180
GCCTGAGAGA CGGAGCCCCG CCCCCTTCCA AAACATGAAC TTCTGCCCCC TGACCCTCAT 240
CTGACCCCTC TCACACACAC TTACTTATAC ACACGCGCAC TGAGACGCAC ACACATCACA 300
CATATACTTG CTGACACACA CACACACACA TCACACATAT ACACACGTAA TTATACACGC 360
ACACTGACAA ACGCACACAC ATCACACACA CAGACTCACA CACTGAAACA CGCACACAGA 420
CTTATACACA CACTGAGACG TGGGCACATA ACAGACATTT TTATACACAT GCACTGAGAC 480
ACACACACAC ACACACACAC AATTATACAT GCAGACTGAT TAATAAACAC ACACACACAC 540
ACACACAAAC ACACACAGAC TGAGACATGC CCACACAGTT ATGCACGCAC ACACTGACAC 600
ACACACACAC CCACACACAC AATTATACAC ATTTAGACAT GCACACACAC CACAAACATA 660
AATGCGCGCA CACATACATA CACACACACA CACACATATA TATAAATGCA CACTGAGAAA 720
GGTACACATA CACATACATG CTCACACTTG CACACAATTT ACACACCCAC TGAAACGCAC 780
ACACATAAAT GCTCACACAC ACAATTATAC AAGCACACTA AAAACACACA CACTAATGCA 840
TGCACACACA CACAAACTTA TACACACACA CACACACACA TGCTCACACA CACTTATACT 900
TGCAGACACA CACACACACA CACTAATATA CACGAGCACA AACACCCTCA CACACTCATA 960
TGCACACACA CACAAACACA CACACACACA CTCAGAGACA CTAACTCACG CAAACACACA 1020
CAAAAAGAAA AACATACACA CACTGTCACT CAAGCAAACA CAAACTCATA CACACTGTCT 1080
CTGGTATATT ATCGTATGGC TTTGACTGTG TGTGTGCGTG CGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1140
TGTGTGTGCA GATCAAACAC TGAAGCAGCA GCGGGTGAGC GAGTGGACGA TAGAGAGGTG 1200
AGAGAGACAA GATGCATCTC TGTTCAAACA CGCGGAGGTG AAAACCTCAC ACACACACAC 1260
ACTCATATCA CACATCGATC GCTCTGATTG ATCCACACAC ACACACACAC ACACACACAC 1320
ACACACACAC ACACGCACAC ACACTGATCA ATACGGAGGA ATCCGTCTGG ACATGTTGAC 1380
CAGAACAAAA GAAAATCATT TTTCTCTGAG CTGGAGATGG AGAGACGGAG CGCACATGAC 1440
TGCAGCACAT CTACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 1500
ACACACACAC ACACACACAC ACACTTCATC CAGAGCTCCC GTCCTATCTT CATACACATG 1560
CTTATTGTAT TATTATTATT TATTTATGTA TTATTCAATT AAGTTTATTG TTTGTTTTCT 1620
TTTTTCCTT 1629