EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06178 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr19:25284-27826 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr19:26815-26834CAGTGCCACCTGCAGGAGA-6.13
Foxd3MA0041.1chr19:26342-26354AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr19:26346-26358AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr19:26350-26362AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr19:26354-26366AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr19:26358-26370AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr19:26464-26476AAACAAACAAAC-6.32
POU1F1MA0784.1chr19:25307-25321CTCATTAGCATAAT-7.52
POU3F1MA0786.1chr19:25308-25320TCATTAGCATAA-6.22
POU3F2MA0787.1chr19:25308-25320TCATTAGCATAA-6.44
POU3F3MA0788.1chr19:25308-25321TCATTAGCATAAT-6.36
Enhancer Sequence
GCCCTCAATA CCTGTATAAC ACACTCATTA GCATAATGCT GGAGTTAAGA ATTACTGCAC 60
ATCTGATTGG AGGAGAACTG ATGAACTAAT AAATGAACAA CAGATCATCT TCATTACAGA 120
ACAGCACACA TCAGCGGTGT GTGTGTGTGT GTGTTGGAGA ATATTCTCTG TGCTGCAGCG 180
CCACCCAGAG GACAGACAAC TGCACTGTTC ATCAGTATAT CCTACTCTCC CAAACAGAGG 240
AGCTAGAGAA CAACAGGAGC ACACGCACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 300
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 360
ACACACACAC ACACACACAC TAACAAGAAC TCAAACACAA AGGAGCAGAA GGCGATTACA 420
CTCAGAATAA TTGACCTTTT TAATAATTAG AGGATATTTG ATAAAGGAAA TGAGAGAAAT 480
ACAGGAACAC ATGATCAGCC GGTGTGGTCA CACACGCAAA CTAAGCAGAA TATTTCATTA 540
ATTTCAACAA ACAAGAAAAA AAACATGTAC AGAATAACCC TTCATGGGGA CGTCTGTGCA 600
CACACACACA CACACACACA CACACACACA AGCCCAGAAC AGAACCACAC AGCCCGCCTC 660
TGAGGGAGAA TAACACCGCT CACGATGTGC TGATGCTGAC CTGTAGCCAG AAACACTGTG 720
TGTGTGTGTG TGTGCATGGG TGTGTGTGTG CATGGGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 780
TGTGTGTGTA TGGGTGTGTG TGTGTATATG TGTGTGTCCA CAGGTAACCT GCACTGCTCA 840
TCACAGTCCT ACAGTGCTGC AAACAGAGAG GCGAGTGTGA GACGGTCGGG TCCAGAGGGT 900
GAGACGGNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 960
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNCAC ACACACACAC 1020
ACACACACAC ACAAACAAAC ACACACACAC ACACACACAA ACAAACAAAC AAACAAACAA 1080
ACAAACACAC ACACAGACAG ACACACACAA ACACACACAA ACACACACAC ACAAACACAC 1140
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC AAACAAACAA ACACACACAG 1200
ACACACACAC ACAGACACAC ACAAACAAAC ACACACACAA ACAAACACAC ACACACACAC 1260
ACACAAACAA ACACACACAC ACACACAAAC AAACACACAC ACACACACAC CTCGCCAGCA 1320
AAGAACAGTT TCCGCTGGAC GTCCTCTGCC ATGATGTCGT AGGCCTCGCC GCTGCCGCCG 1380
GTCTTCACGA AGCTGTAGGC CATGTGGGAC CATGGGTCAG AGCTCCAGCG TGTCACAAAG 1440
TGCCTAAGTG GATCCGGTAC ATCCTACACA AACACACACA CACACAAACA CACACACACA 1500
CACACACAGA GCAGTGTGAG CGGCTGCAGG ACAGTGCCAC CTGCAGGAGA GTCTGCTGCT 1560
CTTCACCTGT TCTGGAAACA GCTCCCGCAG CACCTGCATG CACAGATCCA CCACCTGTGA 1620
GTCCTGCAGA TCCCGGATCA GCGCCAGAGC CTCACCTGTG ACCACAGTCA TGAGCACACA 1680
CTCCTCACCC TGACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACATCA GTGCCCCTGC 1740
AGTAGCTGCT GCTGATGGTG TCGCTGTGGA GGTCAGTGAG TGTTTGTCTT CTGGGATTCT 1800
GAGATGTTGT CTGATATATA AACACTGTGT GCGTGAGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTGT 1860
GTGAGTGTTG AGTGGGCGAC GCACCTGAGG ACGCATGTCG TAGAACACAC TGAACAGGCC 1920
TCTCTTCTCT GGACACGGAG GAACACGGCC GAAATAATCA GCTCCCTGCA CTTTACTGTC 1980
CCAGAAGCGT CTGGAGAACT GCAGAGCCAC CTGAGGAACA CAGCCTGAGA GTGAGAACAC 2040
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACCC 2100
TCGCCTGGGT AAACACACAC CTTCTCGATG ACTCCTGCAC CCAGGCTGTG GATGGCCTTC 2160
AGCTTGCGCT CTGGCAGAGC AGGAGTGAAG GAGATGCTGT TCTTCTGGAG CAGAGCGAGC 2220
GGCACTGTCA CCAACACCTG ACACACACAC ACGCGCGCAC GCACACGCAC ACACACACAC 2280
GCGCACGCAC GTCAGGGTCA GATGAGTGGG TGGAGGCAAA ACAGCAGCAG CCAATCAGCA 2340
GCATCATCTC AAACCTTGTG TGCCGTCCAG TGTGAGCCGC AGGAGGACCA GACCTTCACT 2400
GCCTCTCCAG AATAATCCAC ACGCTGGACC TGTGCGCACA CACACATGCA TGAGCATGCT 2460
TCCTCTGTGT GTATGTGTGT GCGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTCG TACTGCAGTA 2520
TTGAGCCGGA TGTCGAGTCC CT 2542