EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06170 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:50603230-50604238 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr18:50603659-50603678TGCTGCCCTCTGGTGGACA-7.89
RREB1MA0073.1chr18:50603736-50603756ACACAACACACACACACACA+6.19
RREB1MA0073.1chr18:50603916-50603936ACACAACACACACACACACA+6.19
Enhancer Sequence
TACACACCCT TAACACACAC ACATAACCTG AACATGCACA CGTCATGAAT GTATACATAC 60
CATGGACAAA CACACATCGT AAACATGCAT TATAAGCACA CACACACACA CACAAAGATT 120
AGACATCATG AACACATATA ATGAATACAC AAATAGACAC ACACACCATG AGGATTCAAA 180
CGCACACAGA TTCAAACACA CACACACACA CACAGTGTGT GTGTGTCCGG TGAGGATTAA 240
CTGAAGCACA GAGACTGCTG CACACACACA CACACTGAAG ATATCCAAGA ATTGACAGAA 300
GAATTGAAAA GCGCGCTGTT ACTGTCTGTA AACACTGCAC TGAGATCAGT CTGAGCAGAA 360
AGAGGAGCTC AGTGTGTGTG TGTGTGTGTG CGTGTGTGTG GGAGACTCAC TGTGATGATG 420
CTGATGTGCT GCTGCCCTCT GGTGGACACT GAGCTCCAGC ACAGCAGATT AAACACTGCA 480
GATTCTGCCC TGTCATATCA AATACAACAC AACACACACA CACACACACA CACACACACA 540
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 600
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACAAC 660
ACACACACAA CACACACACA ACACACACAC AACACACACA CACACACACG TCAGCTTGGC 720
AATCTCATAT CAATGTAATT AATGCCTTGA AATAAACATT AGTGTTCACT GTAAAGAATA 780
AGCATAATAC ATCATATTAC ATGATATTAC TGGGGCACCG GCCCACCAGG ACCGAGAATG 840
GTGACCCCTG TCTGAATTTA TAGAATTGGA AAAACAGCAT GCGAGAAGAC TTACCACTTC 900
TGGCCTGATT CTGAAGTGTG CATCTGATGC ACTATCCCAT GATGCCCTGC GAGAGAATTT 960
ATGAATATGG GAGTAAAGCA ATGCAACTGA TGCAGGTAGG TCATGTGA 1008