EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06152 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:49830183-49831675 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr18:49830213-49830225AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:49830955-49830967AAACAAACAAAC-6.32
RREB1MA0073.1chr18:49830187-49830207CACCCAAACACACACACACA+6.36
Enhancer Sequence
AGCACACCCA AACACACACA CACACAATGC AAACAAACAA ACACCACACA CAGCAAATGT 60
CACACACAAA CTGTGCACAC AAATAAACAC ACATCATACA AACACACACA CACACAAACA 120
AACAAAAACA AACACACATT ACAAACAAGC ACTGCACACA TCACATTCAC ATACACAAAC 180
AGCACTCAAA CACACACACA CACACACACA CACACAGTAC AGGCAGAGTA TGTTCGGTCA 240
TCATAGACAG AGAAGATCTG ACGAAATGCT GAATATCTGA CAAACACTAG CAATACACAC 300
AAACCCACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 360
ACACACACAC ACACACACAC ACACACATAT AATCATTAAA CACTTACACA CATACACACA 420
CACACACACA CATATAAACA AACAAAAACA CACACACACA CAAACAAACA CACACACACA 480
CACACACACA CACACACACA CACACAGTAC AGGCAGAGTA TGTTCGGTCA TCATAGACAG 540
AGAAGATCTG ACGAAATGCT GAATATCTGA CAAACACTAG CAATACACAC AAACCCACAC 600
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAA GCTCAGACAA 660
TCAAACACAC ACACACACAC ACACATATAT ACACAAATAC ATCACACTCA AAAACATACA 720
CACATCACAT TCACATACAC AAAGCACACT CAAACACACA CACACACAAT GCAAACAAAC 780
AAACACCACA CACAGCAAAT GTCACACACA AACTGTGCAC ACAAATAAAC ACACATCATA 840
CAAACACACA CACACACAAA CAAACAAAAA CAAACACACA TTACAAACAA GCACTGCACA 900
CAAACCATAC CACACACACA AACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 960
CACGAACACA ACAACAACAA CAACAATAAT AATAACAATA ATAATAATAA TAATAATAAC 1020
AATAATAATA ATAATAATAA TAATAATAAT AATAATAATA ATAATAATAA TAATAACAAT 1080
AATAATAACA ATAATAATAA TAATAATAAT AATAATAATA ATAATAATAA TAATAATAAT 1140
AATAATATCT AAAGATGTTG AATTTTGTCA AACTGATTTT GTCTTAAATG AGCATGAAAA 1200
ATTTGAATGC TTTTTATTAT AATATTAGAG TTTATTTTTA AAGTGATGCC TCTCTCTCTC 1260
ACACACACAC ACACATACTA GTGAAGCCCA TAAGTGTGTT TGGGAAGCTC AGGTCAGGAG 1320
TGTTTGAGCC TGTTTTGGGT CTGGAATCAG TTCATTAGTC CTGCAGTTCC TCCAGCGTTC 1380
AGCAATCATT GTGTTCACAG GCTGTGTTTG CTCATGTGCT CTGGGTCATC ACCTGCACAC 1440
ACACACTTCT CTTTCACACT GAAGCCTGGC ACTTCTCAAA TCCACATTCT GT 1492