EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06120 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:48341769-48343421 
TF binding sites/motifs
Number: 89             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr18:48341823-48341840TGAATTAATTAATTAAT+7.27
Alx1MA0854.1chr18:48342222-48342239AGAATTAATTAATTACC+7.76
Alx4MA0853.1chr18:48342222-48342239AGAATTAATTAATTACC+6.63
ArxMA0874.1chr18:48341822-48341839ATGAATTAATTAATTAA+6.04
ArxMA0874.1chr18:48341858-48341875ATTAATTAATTAATGAA+6.09
ArxMA0874.1chr18:48341859-48341876TTAATTAATTAATGAAT-6.41
ArxMA0874.1chr18:48341823-48341840TGAATTAATTAATTAAT-6.7
Foxd3MA0041.1chr18:48341989-48342001AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:48341993-48342005AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:48342619-48342631AAACAAACATAC-6.37
IRF1MA0050.2chr18:48342085-48342106AAACAAAAAAAGAAAGAAAGA-6.13
Lhx3MA0135.1chr18:48341953-48341966TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr18:48341824-48341837GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr18:48342223-48342236GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr18:48341860-48341873TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr18:48341828-48341841TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341832-48341845TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341836-48341849TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341840-48341853TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341844-48341857TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341848-48341861TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341852-48341865TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341856-48341869TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341825-48341838AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341829-48341842AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341833-48341846AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341837-48341850AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341841-48341854AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341845-48341858AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341849-48341862AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341853-48341866AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341857-48341870AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48342224-48342237AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr18:48341950-48341963ATTTAATTAATTA-6
POU2F2MA0507.1chr18:48341902-48341915ACATGCAAATGAA-6.92
POU6F1MA0628.1chr18:48341826-48341836ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341830-48341840ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341834-48341844ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341838-48341848ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341842-48341852ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341846-48341856ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341850-48341860ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341854-48341864ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341858-48341868ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341862-48341872ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341955-48341965ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48342225-48342235ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341826-48341836ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341830-48341840ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341834-48341844ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341838-48341848ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341842-48341852ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341846-48341856ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341850-48341860ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341854-48341864ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341858-48341868ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341862-48341872ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48341955-48341965ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48342225-48342235ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr18:48342501-48342514GAATGGATGAATG-6.19
ZNF24MA1124.1chr18:48342335-48342348GAAGGAATGAATG-6.34
ZNF24MA1124.1chr18:48342170-48342183GAATGAATGAACA-6.3
ZNF24MA1124.1chr18:48342199-48342212AAATGAATGAATA-6.42
ZNF24MA1124.1chr18:48342497-48342510GAATGAATGGATG-6.44
ZNF24MA1124.1chr18:48342195-48342208GAATAAATGAATG-6.5
ZNF24MA1124.1chr18:48342404-48342417GAATAAATGAATG-6.5
ZNF24MA1124.1chr18:48342049-48342062GATTGAATGAATG-6.64
ZNF24MA1124.1chr18:48342024-48342037GAATGAATGAAAG-6.78
ZNF24MA1124.1chr18:48342339-48342352GAATGAATGAAAG-6.78
ZNF24MA1124.1chr18:48342327-48342340GAATGAATGAAGG-6.82
ZNF24MA1124.1chr18:48342595-48342608GAATGAATGAAGG-6.82
ZNF24MA1124.1chr18:48342591-48342604GAGTGAATGAATG-6.87
ZNF24MA1124.1chr18:48342069-48342082GAATGAATGAACG-6.98
ZNF24MA1124.1chr18:48342130-48342143GAATGAATGAACG-6.98
ZNF24MA1124.1chr18:48342331-48342344GAATGAAGGAATG-6
ZNF24MA1124.1chr18:48341816-48341829GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr18:48342114-48342127GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr18:48342158-48342171AAATGAATGAATG-7.34
ZNF24MA1124.1chr18:48341800-48341813GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:48341804-48341817GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:48341808-48341821GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:48341812-48341825GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:48342020-48342033GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:48342053-48342066GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:48342057-48342070GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:48342061-48342074GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:48342065-48342078GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:48342162-48342175GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:48342166-48342179GAATGAATGAATG-7.82
Enhancer Sequence
AAATATATAA AAGAAGGGAG AAAAAATAAA AGAATGAATG AATGAATGAA TGAATGAATT 60
AATTAATTAA TTAATTAATT AATTAATTAA TTAATTAATT AATGAATAGA GAAGAAGAAT 120
GACAAATTCA CGAACATGCA AATGAACGAA CATACAAATG ATCAAAAGAA AGAAAGAAAT 180
TATTTAATTA ATTAATAGTT AAATTAACAA ATATACGAAT AAACAAACAA ACAAACGATT 240
GAAAGAAAAA AGAATGAATG AATGAAAGAA AGAAACAAAG GATTGAATGA ATGAATGAAT 300
GAATGAATGA ACGAACAAAC AAAAAAAGAA AGAAAGAAAA ATATTGAATG AATGAATTTA 360
TGAATGAATG AACGAACAAG TGAACATACA AATGAATGAA TGAATGAATG AACAATCGAA 420
AATAATGAAT AAATGAATGA ATAGGTGAAT TAAAGAATTA ATTAATTACC GAAAATACAA 480
ATGAACGAAC AAACAAACGA TTGAAAGAAA AAAGAAACAA CAAATGAAAG AAAGAAACAA 540
ACGATAAAAT GAATTAACGA ATGAATGAAG GAATGAATGA AAGAATGAAC GAACGAACGA 600
AAGAAAGAAA GAAAGAAAGA AAGAAAGGAA AAAATGAATA AATGAATGAA CAAACGAAAG 660
AAAAAAATTA ACGATCAAAC GAAAGAAATG AATGATCGAA TGAACGGACG GACGGACGAA 720
TGAAAAAAGA ATGAATGGAT GAATGAACAA ACAAACCAAC CAACCAACAA AAAAAGGAAA 780
AAAAACGAAA GAATTGAAGA AAAAAATTAA GTTTTGAAAA AAGAGTGAAT GAATGAAGGA 840
ATAAATGAAC AAACAAACAT ACGAATGAAC GATCAAACGA TCAAAAGAAA GAAAAAAATA 900
AAGGATTGAA AGAAATAATA ATGAATGAAT CAATTAATCT TTTACAAATA AACTGATAAA 960
CAGTGTGAAA TCAAAATAAG TTATATGCCT TAAAACACAT AAGTTGATGA ATAAACTCTG 1020
AATCACACGT ATCCCTTATA AACTGTGAAT CAAAGTTCCA GCAGACACAC TTCACCACAC 1080
AATCTACTGT ACACCACACT GCAGCACCAG ATAAAGCAAC ACTGGGGAAC TTACTATTGA 1140
CTTTCTCACA GTGATACTGA TCATTAAACA ATGTAGCATT CACACGTCAA TGAGTGTGTG 1200
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGGGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGAG 1260
CCTGTGTGCG CGTCTGAGTT AGTTAAACTG AACCCTAAAA AGCAGATGGG GGTTTACCGA 1320
CGCTTGAACA AAGGCTAAGC TCTTTCTTAT CAATTAGCAC TGCTAAAAGG GACATCTCTC 1380
TCCTCCATTA GCTCCACCAC GTGTCTGCTA TTCACCCCAT TGTGTGGCAA ATTAAATTAC 1440
ATCCCTCCAT CTCGCCTCTC CCCTCCTCCG GTCGCTTTTT CTTTGTTCAC ACACACTCAG 1500
ACACACACAC ACATACACTC CGCTCTGCAG TCCATTGATC TGAGAGGTCA GAGAGCTGCT 1560
GTCGTCCTCC ATCCATCACA AACTGCAGGA ATGCAATGAT ACGCCGGCCA AGAGCCTTCA 1620
AAATACTGAC TTTATTATCT CACACTCGTC TT 1652