EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06114 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:48053326-48055600 
TF binding sites/motifs
Number: 22             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr18:48054952-48054967TTTGTTTGTTTAGCT-6.13
Foxd3MA0041.1chr18:48054392-48054404GAATATTTGTTT+6.18
Foxd3MA0041.1chr18:48054300-48054312GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr18:48054951-48054963GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr18:48054975-48054987GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr18:48055041-48055053GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr18:48055411-48055423GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr18:48054296-48054308GTATGTTTGTTT+6.37
Foxd3MA0041.1chr18:48054336-48054348GTATGTTTGTTT+6.37
Foxd3MA0041.1chr18:48055037-48055049GTATGTTTGTTT+6.37
Foxj3MA0851.1chr18:48055003-48055020TTGTTTGTTTATTTGTA-6.09
HSF1MA0486.2chr18:48054092-48054105TTCTGGAATGTTC+6.59
HSF2MA0770.1chr18:48054092-48054105TTCTGGAATGTTC+6.57
HSF4MA0771.1chr18:48054092-48054105TTCTGGAATGTTC+6.59
Lhx3MA0135.1chr18:48055284-48055297TATTAATTAATTT-6.37
POU6F1MA0628.1chr18:48055285-48055295ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:48055285-48055295ATTAATTAAT-6.02
TCF7L2MA0523.1chr18:48054210-48054224AAACATGAAAGGAA+6.07
ZNF24MA1124.1chr18:48054726-48054739TGTTCATTCATTC+6.3
ZNF24MA1124.1chr18:48055192-48055205CATTCGTTCATTC+6.41
ZNF24MA1124.1chr18:48055240-48055253CATTCATTTATTC+6.5
ZNF24MA1124.1chr18:48055428-48055441CATTCATTCATTT+7.34
Enhancer Sequence
GATTGAAAAA AACACACATA ATCAAATAAG CAGATGGCAA TCTCCTGAAA TTAGAGTATA 60
GCTGCTTCTT CCCAAATTCT GTCGGCAGCT TTTACTTTCC CAGCGTTAAG CAGCAAGCTG 120
TTCTTTTTCA TGTCAGCAAC GTGTAATCCC TTGAAAAATG CATAATCTGT GCATAAAACT 180
GATTAAGGTT TGCTCTTGGT GAATGATCGA CGCTCTTAAT TAATTGAAAG TGTTTAACAG 240
CCCGATGAGG AATGGGTTTG ATTTGTTTGT TATCCGGATA TGTGTGTGTG TGTGGATGTG 300
TGTATGTAAA TGTGTGCGCT CTTGTCATGT TTCTGTTTGT GTGCGTGTGG GTGTTTACAC 360
GACTGCTGTT GTTTTTTTGC CCTTCTCTGT GTAAATGCCA CTCAATCCCA GCTGAGCAGG 420
CATTAGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 480
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG GATGTGTGTG TGTGGATGTG TGCATGCGTG 540
TCTGTTTTTA GGTGTTGCGC ACAGGTGGCT CTCAGCTTGG GAATTGGGCT AATTAAGCAA 600
CGACGACATG ATACGGATAC GAGGCTTTCC TAGGAGACGT GCCAATGAGC TGGAGCCGTC 660
AGTGAAACTG AATAGTTCCC AGAATTCCAT TTGCTGTGTT TGTTTTGGAG GGAGGGGGCG 720
TCCCAGGACT CTACTATATA GATTGAAAGT GTCTGGTTCG TCACATTTCT GGAATGTTCT 780
GATGGGTTGG AGATATTGTG ATGGTGATGA TGGCAGTGTG TTTTGTCTTC AAATGGATGC 840
ATGCAGTTAT AATGAGGGAA AAGGCCTGTC TCATGAGGAG GGGAAAACAT GAAAGGAATA 900
TAAATGTCAC AAATTTTTGT TTGTATATTC GTTTGTTAGT TCGTTTGTAT GTTCATTTGT 960
AAGTTTGTGT GTATGTTTGT TTGTTTGTAT GTTCATTTGT AAGTTTGTGT GTATGTTTGT 1020
TTGCTTGTAT GTTCATTTGT TCGATCGGAT GTTTGTTTGT TCAATAGAAT ATTTGTTTTT 1080
TTATTCATTA GTATGTTCGT TTGTATATTT GTTTGTTTAT TCCTTTGCAT GTTAATTTGT 1140
TTGTTCATTT GTATATCCGC TTGTTTGTTT ATATGTTTGT ACGTTTGTAT ATTTGTTTGT 1200
TTATTCCTTT GCATGTTAAT TTGTTTGTTC ATTTGTATAT CCGCTTGTTT GTTCGTATGT 1260
TTGTTCGTTT GTATATTTGT TTGTTTATTC CTTTGCATGT TAATTTGTTT GTTCATTTGT 1320
ATATTTGTTT GTTCCTTCCT TTATATGTTA ATTTGTTCGT TCATTTGTAT AGTTGTTTGT 1380
TTGTTCAATT GTATATTTTT TGTTCATTCA TTCGGATGTT CATTCGTATA TTTTGTTTGT 1440
TCGATCCTTT ATATGTTCAT TTGCTTGTTG ATTTGTTTGT TCATTTGTAT ATTCATTTGT 1500
TCGTTTGTTC ATTTGTTCCT TTGTTTAATT GTTCATACAT TTGTATGTTC ATTTGTATAT 1560
TTTTCTCTGT TCTTTCCTTC GAATGATTCT TTTGTTTGTT CATTTGTATA TTTGTTTGTA 1620
TGTTCGTTTG TTTGTTTAGC TGTATATTCG TTTGTTTGTT TGTTCGTTCG CGTTCATTTG 1680
TTTGTTTATT TGTATATTCG TTTGTTCAAT TGTATGTTTG TTTGTTTGTC CATTTGTATA 1740
TCTGTTTCTT TGTTCATTCG CATGTTCCTT TGTTTGTTCA GTTGTATATT TGTTTCTTTG 1800
TTAGTTCGTA TGTTTGTTCA TTTGTGTATT TGTTTGTTTA TACATTATAA GGTTCATTTG 1860
TTCATACATT CGTTCATTCT TTCATTTGTT TGTTTGATTG GTCATGTGGT AGTTCATTCA 1920
TTTATTCGTT CATCCATTCG ATTATCCATT CATTTCTTTA TTAATTAATT TATTTATTTA 1980
TTTACCTCAT ACATTAAGTT AGATATTGTA GTCACACTGA GTTTTTATTA TTATTATTAT 2040
TATTCATGGT GGTAATAGTA ACATGATTGT TATTTAATTT AATAAGTTTG TTTGTTTATT 2100
ATCATTCATT CATTTTCTTG TCAGCTTAGT CCCTTTATTA ATCCAGGGTC GCCACAGCGT 2160
AATGAACCGC CAACTTATCC AGCAAGTTTT TTATGCAGCG GATGTCCTTC CAGCCGCAAC 2220
CAATCTCTGG GAAACATCCA CACACACACA CACACACACA CACACACACT CATA 2274