EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06035 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:42143292-42144738 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr18:42144034-42144044GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr18:42144034-42144044GTCACGTGAC-6.02
GATA2MA0036.3chr18:42144632-42144643GAAGATAAGAA-6.02
IRF1MA0050.2chr18:42143635-42143656ATAAAGAAAAAGAAAGTAAAG-7.06
MITFMA0620.2chr18:42144030-42144048GTATGTCACGTGACCTTC+7.31
MITFMA0620.2chr18:42144030-42144048GTATGTCACGTGACCTTC-7.31
MNX1MA0707.1chr18:42143512-42143522GGTAATTAAA+6.02
PBX2MA1113.1chr18:42144306-42144318ATGATTGACAGC+6.44
USF1MA0093.2chr18:42144034-42144045GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr18:42144032-42144048ATGTCACGTGACCTTC-6.02
ZNF24MA1124.1chr18:42144432-42144445AAATGAATGAATG-7.34
ZNF24MA1124.1chr18:42144436-42144449GAATGAATGAATG-7.82
Enhancer Sequence
TTGGCGTTTT TGTGTGGAGT TTGCATGCTC TCCCTGTGTT CGTGTGGGTT TCCTCTGGGT 60
GCTCCGGTTT CCCCCACAGT CCAAAGACAT GCGGTACAGG TAAATTGGGT AGGCTAAATT 120
GTCCGTAGTG TATAAGTGTG TGTGTGTGTG TGTGAATGAG TGTGTGTGGA CAACAAACCC 180
CTGATGTTAG TCTAGGGGAT GGTGGGGTTT GACATTTATG GGTAATTAAA ATATATTTAT 240
ACAAACAGTG AATAAGTGCA AAAGACAACC AAAGTAATAC CGAAAATATG TGCTTTTATT 300
TACAATTCCC AAAAGTGAAC AAAAAACAAT GAGTTAATCG AATATAAAGA AAAAGAAAGT 360
AAAGCAAAAA TATACTATTT ACAATACATA CAACAAAATA CAAAATACAA AGACGGAAAG 420
AAACAGGAGA GCTGGCAGAA GGGAGGCGGG CAGCGCTAAA TAAATTAAAA GAACAAAAAC 480
CAAACTAAAT CTAACTTCCC AGATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT 540
CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT 600
CTATCCATCC ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT 660
CTATCTATCC AAAAAGGGGT GGCGCTCGCC CCTAACCTAA TGTACTATAC AGAAGAGTAG 720
TCCTAAGTGT TGCAAAATGT ATGTCACGTG ACCTTCGTAC CTGTCCGCTT CGCCCAAGCC 780
TGGTAAACAA CGTAAACGGA GAAATGGAAT GATATACGAA TAGCGGATGT ATAACGTGCA 840
CACAGAAACA AGCAACAACA AAATAAACGC AACGCATCAC ACGAACACAG AAACAAGCGG 900
AAAAAGACAA GGGATGAGAA GTTAAGGGGC TGGTGAGTGG TCTGGCGGGT GCTTTTATGA 960
CGGGTGGTCT TTGCTTATTG GATGTGACGT AAGAGTGACG TAACCGGGGA GGAAATGATT 1020
GACAGCTGAA TAAACCAATG AACAGAACCT GAGAATAATG AAAGCAGATA TGGGAGAACA 1080
GAGAGAGAGA GATAGACAAA ACAGAGCACA AATAACACAA ATACATAACA GCCGAAAAGA 1140
AAATGAATGA ATGAATGGTC ACACTTTAGA ATAACTATCC ATAATAACTA GTTAATAGAT 1200
CATTAATAAA TGACGGACAT TAGATATCTG CAAAATTGGC AGATATTAAT CCAAATTAAA 1260
AACTTTTTCT TCTCTTTCAG CGTCCCTATG ACTCTCCTGC TAGACAGCCT TGGCTGGAGA 1320
CAAACAACTT CCCCGGAGAG GAAGATAAGA AGACGCACAA CATTGCTGCT CCTTGTTCCA 1380
AGGACACTTG TGAGACTCTA CAGCAGGGGT CTCAAACTGC CGGCCCTCCA TGTTTGTGTG 1440
CTTTAA 1446