EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-06021 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:40281594-40282888 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr18:40281910-40281927ACTATTAATTAATGAAT-6.7
Hmx2MA0897.1chr18:40281786-40281803CAAACCAATTAAACAGT+6.03
Hmx2MA0897.1chr18:40282143-40282160TCAATCAATTAATAAAT+6.24
Hmx3MA0898.1chr18:40282143-40282160TCAATCAATTAATAAAT+6.69
PBX1MA0070.1chr18:40282039-40282051CAATCAATCAAA+6.18
PBX1MA0070.1chr18:40282196-40282208CCATCAATCAAT+6.62
POU6F1MA0628.1chr18:40281913-40281923ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:40281913-40281923ATTAATTAAT-6.02
ZSCAN4MA1155.1chr18:40282623-40282638TTTTCAGTGTGTGTG-7.24
Enhancer Sequence
TCTGTTAACT TGGAGAGAAA GTAGAAAGAT CTCAAGTTGG ATGTTGTTAA AATAAGGAAT 60
TAAACTGTCA TTTATTATTT GATATGGAAA AAATCATTGA AAATACAAAC GCCAAATAAA 120
AAGAAGTGTA AAATGAAAAA ATATTGTAAA TATGTGGTAA TCAATTGATC AATCAATCAA 180
TCAACCTACC AACAAACCAA TTAAACAGTC ATGCAGTCAA TCAATTGATC AACCAACCAA 240
CCTACCAACA AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA 300
TCAATCAATC AATTTGACTA TTAATTAATG AATCAATCAA TTGATCAGCC AACCACTCAA 360
TGACACAAAT AATTAATTGC ACACTCAGTC AATCGATCAA CCAACCAACC AATTAGACAA 420
TCAATCACTT AACCAATCAA TCAATCAATC AATCAAAAAA ATTGATCAAC AAACCAAACA 480
ATCAATCAAT CACACAATCA ATTAATCACA CAGTCTATCA ATCGACCAGC CAACCAATTA 540
GATAATCAAT CAATCAATTA ATAAATCGAT CAGCCAACCA ACCAATCAAT CACATTATCA 600
ATCCATCAAT CAATCAATTA ATATATTGTT TTATCAAACA ATCAATTGAT CAATCAATCA 660
ATCAGTTAGC CAATCAAACA ATCAATTGAC TGACCAATCA ATCAATCACA CAATGAATCA 720
AAAAATCACG CAGTCAGTCA AACAACCAAC CAATCAAATA ATCAACCAAT CAATTGACCG 780
ACCAATCAAT CACACATTCA ATCAATCGAT CAACCGACCA ACCAATTAAA GCCAAATGTT 840
TGATCAATCA GTCAAACAAG TAATCAATGA GTACTTACAA GTACACATCA GACTGTCTGG 900
AAAACTATAT GTAAGACAAT AACTGCTGCT GTGCTTAATA AGTTTCCTTT TCAATATATT 960
TTTCTCCCCA TCTATTTTAA ACTTAATTGA GAACATGCAA CATAAGCATT CGAAGGCATC 1020
AGACCAGCAT TTTCAGTGTG TGTGTGTCAT GAAGATGGTG CATTTCCTGT GTGAACATAT 1080
GGCGTGTAAG TGCCTGTTCA AAACTCCAAC TGAGTCATAT AACAGATCCC TCTCTTTCTC 1140
TCTTTCTCTC TCACCTCACG CTGGAAGTCT CTAGTGGACC AGCACATAGT AAAGGCTCCA 1200
CCTACACACA AACTCAAATG AGAATCACTC AGGGATGAGA TTCACCCCTG CGAAAGCGCT 1260
GAGCTTGCAT GAGGCCATGA GCTGGGAAAC ACCA 1294