EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05914 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:27924849-27925885 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX1MA0889.1chr18:27925236-27925246GCTAATTAGT-6.02
HOXB3MA0903.1chr18:27925236-27925246GCTAATTAGT-6.02
LHX6MA0658.1chr18:27925236-27925246GCTAATTAGT-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr18:27925399-27925412TGAACCACTTAAA+6.33
POU1F1MA0784.1chr18:27925231-27925245TTTATGCTAATTAG+6.98
POU3F1MA0786.1chr18:27925232-27925244TTATGCTAATTA+6.92
POU3F2MA0787.1chr18:27925232-27925244TTATGCTAATTA+6.92
POU3F3MA0788.1chr18:27925231-27925244TTTATGCTAATTA+6.82
Enhancer Sequence
TGGGTTTGTT CATATTTTAC CCAAATATGA GTTGAAAGTA TTTTTATACT TTTCAGATGT 60
TCAAGTATAA ACATTACAGC TGTAAAAGCT AAACAGTTCT TTCAACACTT ACTGTATGTC 120
ATTGTAGCAC TTTTCCACTG AGTAATTTAG AAACCACCTC CCCTACCGCC TGACATCCTC 180
TTACCAGAGA CAATGCAGAA GGGACTAAAA ACCCCAGCTG GTCAAACAGA GCTGACCAAA 240
TTGCTTGAGC GGTGTTTCTT ATGCGCATCC ACAAACAAGT AGCATTCAAC TAAACAAACT 300
GAAGTACCTC ATTGTTAAAG GTTGCCGCTG TTCTGTCTCT TTTCAGCTGC TTTAAACTTA 360
CAAAAAATGT GTCAACGACA GGTTTATGCT AATTAGTATC TTTAGTGAAT GCAGTAAAAC 420
AGTATCCAGT GTAATCCAGC TTACTGTAGG TCAGTAACAA TCAGATAAAC AGCATCTCTT 480
CTGTGGGCGG CTGACATTTG GAGATGACAA AACACAAGCA CTCAGGCAGA CAACTGAGGT 540
TAATTCAGCA TGAACCACTT AAACACAGGT TACGGTGATT TTTAAAGATT ATCATTTTAA 600
AATCTTCATG ATTCAACATG TACTATATTG TATTGACCAC CACTGCTTTT TTATGTCATG 660
TACTAATTTA CATTTTTTAT TTATTATCTG TGTTTAGCCT ACACACATGC ACATCACATT 720
TTCATGCTTC AAGGGAGGTT CTTATAAACA TAATCACATT TATATCGTAA GGACTGTATT 780
TTGTGTGCTA TTCCCAACCC TTTCCATAAA CCCAACCCTC ACAGAAAACA TTCTGCACTT 840
TTACATTTAT CAAAATGGTT CATTCTGGAT TATTTACGAG CCTCTTTCCT CATGGTTGGC 900
CAAAAAAAAT CCCCACAAGC CTACATAATC CTACATTATA ACTATACTTG TGGACATTTT 960
GTATGAACAC CAGTTGAACG CACACACACA CACACACACA CACACACACA CATATATATA 1020
TATATATATA TATATA 1036