EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05773 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:17373935-17374668 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG-7.01
RFX1MA0509.2chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG+7.04
RFX2MA0600.2chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG+7.09
RFX2MA0600.2chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG-7.22
RFX3MA0798.1chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG+7.33
RFX3MA0798.1chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG-7.3
RFX4MA0799.1chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG-6.96
RFX4MA0799.1chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG+7.19
RFX5MA0510.2chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG+6.93
RFX5MA0510.2chr18:17374292-17374308GGTCGCCATGGTAACG-7.12
Enhancer Sequence
GTAAAACATT AATGGTATCC ATGCTAGCTC ATGTCATAAA TCAAAGCTAG GCTCGTCTAA 60
GAGTGGCAAG CTAGCACGCT AGGCTGTTTA TCAGCAGTAT TAAGTGCAAT TTGTGAATTA 120
GCTGGGCTAA CGGACATTAC AGAGCGCTGA GGCCTGTCTC ACCCAATGTG TGCCAGGACG 180
AGGTGTGTCT GTGTGTGTAT GTGGATGACT GTAGATAATT TTAATATCAG GCTGGTGTGG 240
ATTGCTGATA GTGTTTTAAG GCAGGGCCCT GTGGACTGAG CACTGGTAGT ACCTATCTGT 300
AATTAGTAAC CATTCTCTAT CGCTGATAAG ATAAACTCAC CCTGACCTTT TCCATTTGGT 360
CGCCATGGTA ACGGGCCCTC TACCCCCCCT CTTGATATTA TTTTAGTGAT TAAACAGCAA 420
ATAGCAGGGA GATGGGAGAA AGCGATAGGG ATGATTAATA ATGGTGTTTG GTTGAAGTGA 480
ATGTATGCGA GCGTTTGTAT GAGGAGGGCC ACCGGTGTCA GAGAGGAGTG TGAATAGGCT 540
TGGCTTGGCT TTTTTTCGCA GTGAATAATG GAAATTTAAG ATGAGGCAAT AGGAAATAAA 600
AGCACGGGGT GAGAGCGATA GATGTCTCGT TTCTTTCTTT TCCCTTTTTT TCTCTTTCTG 660
TGAAACACTT TCACGGGGAA GAGAATATTA ATGCGTCTGT CTCCTTCCTC CCTACCCAGC 720
CAAGCCCTTC ACC 733