EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05735 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:12716900-12718416 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr18:12718319-12718336ATCTGTTAATTAATTGT+6.02
IRF1MA0050.2chr18:12717065-12717086AAATAGAAACTAAAACTATTG-6.11
IRF1MA0050.2chr18:12717059-12717080AAAAGGAAATAGAAACTAAAA-6.53
IRF1MA0050.2chr18:12716919-12716940GAAAAAAAAATGAAACTAATA-7.17
IRF3MA1418.1chr18:12717056-12717077TCAAAAAGGAAATAGAAACTA+7.1
RREB1MA0073.1chr18:12717864-12717884TGTTTGGTGTTGTGTTGGAG-6.03
ZSCAN4MA1155.1chr18:12718300-12718315GGCACACACTGTAAT+6.45
Enhancer Sequence
TAACAAATAT CCTTATTTAG AAAAAAAAAT GAAACTAATA CTAAAACTAA TAAAACTAAA 60
CTAAAACTAA GACATTTTTA AAACGTAGAA ACTAATAAAA ACTAGTAAAT CTGCCTCTAA 120
AACTAATTAA AACTAACTGA ATTTGAAAAC AAAAAGTCAA AAAGGAAATA GAAACTAAAA 180
CTATTGAAAA ATCCAAAACT ATTATAACCT TGATACATAC ATACACACAA ACATGCATAC 240
AGACATACAT ACATACATAC ATACATACAT ACATACATAC ATGCATACAT GCATACATAC 300
ATACATACAT GCATACATAC ATACATACAT ACATACATAC ATACATACAT ACATACATAC 360
ATACATACAC ATACATACAT ACATACATAC ATACATGCAT ACATACATAC ATACATACAT 420
ACATACATAC ATACATACAT ACATACATAC ACATACATTC ATACATACAT ACATACATAC 480
ATGCATACAT ACATACATAC ATACATACAT ACATACATAC ATACATACAC ATACATACAT 540
ACATACACAT ACATACATAC ATACATACAT ACATACATAC ATACATACAT GCATACATAC 600
ATACATACAT ACATACATAC ATACATACAT ACATACACAT ACATACATAC ATACATACAT 660
ACATACATAC ATACATACAT ACACATACAT ACATACATAC ACATACATAC ATACATACAT 720
ACATACATGC ATACATACAT ACATACATGC ATACATACAT ACATACAGAC AGACAGACAC 780
AATGCCCTAG TTGAAGGTGA AGGGCAAATT TGGATTTTGG AGTCAGCTAT CTTTAACATA 840
ACCATAACCA TTAGAACATT AGTTGACAGA CCGTGTGCAC TTTAAACATC ACATTCACGT 900
TTAAACAGAT GTGTATACAT TTGTAAAGGA TGTTTGTTGT TTGCTAGCCT TTGCAGCAGC 960
AGACTGTTTG GTGTTGTGTT GGAGCGTAGA GAGCTTCCTC TTCCACAGCT GATCAATCTC 1020
AGCAGCTCTC TGCTCTCAGA GATAAATGTG CGGTCTGAGC TCCACTACCG CGGCGTGACC 1080
GCCAAGCGTC TGATCCAGGT CTGCGTACTG CACAAAACTC CACAGGGGAG CTCGTCCTCT 1140
GCCCACCACC AGACCGCCTA AGCAGTTCTG GGCATCTCTT TCCCCCCATG CACACGTTTA 1200
GTCTGTAGGC CACCCAGGCC CACAGCACCA TCAGCAGACT ATTGAGCGCA GAGCTGGCAG 1260
ATCACGCTCC ATGTGACTGC AGCTGTACAC TGCGGGGCAT ATGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1320
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGCGCTTGT TTTTGTCACA TATCAGGTCT TGAATGTGTA 1380
TACAGTAACT ACATGGGTAT GGCACACACT GTAATAAATA TCTGTTAATT AATTGTTTCA 1440
GTATTTTGTG ATTCATAAGT GTTTTTTCTG TTTATTTACG ATGTTGAATT GCATTATGGG 1500
GGCTTGATCT CTTCTC 1516