EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05678 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:7900588-7901293 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr18:7900849-7900864ATTGTTTGTTTAGCT-6.39
RREB1MA0073.1chr18:7900674-7900718CCACCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA+6.41
RREB1MA0073.1chr18:7900672-7900716CCCCACCACACACACACACACACACACACACACACACACACACA+6.46
SOX13MA1120.1chr18:7900845-7900856AGCCATTGTTT-6.14
ZNF384MA1125.1chr18:7900811-7900823TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr18:7900810-7900822TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr18:7900809-7900821TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
GTAGGTCAGA CAGATGGATG AGAACATTAG AAGGAAGGGA GAGCGCTGGA AAAATAAATA 60
TTGCTATAGG AAAAGTGCAC AATTCCCCAC CACACACACA CACACACACA CACACACACA 120
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 180
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACAAACT GTTTAAAAAA AAAAAGATTG 240
ATAAAATGCT TATGATAAGC CATTGTTTGT TTAGCTTCAA GCTCTGACGT GTGTGCACAT 300
GAAGCAGCCG GTAAGGCCAG CACACACACA CACACACACA TATATTATGA ACATCTCAAC 360
ATGCAAAAGT GTTCCTCCAT ATGTTTTTAT CGAAGTTGTT CACAATGCTG ATCCATCCAC 420
AGAAATTTGT AATGCTGTCG AATGTTTATA AATACAAGCG CTGCCTTTTA GAGCTCATTT 480
CTGGTTAATG ATGTCAGAAT TTACTGGTAT TTTGTAATGG ATGTGGGAAT GGTCTTTTCT 540
GGAAATATTC TGTACCATCC TTGCCTGTGT GAACAGCGCC TTTTTAAATT TACCGGTAAA 600
GTCGTTCCGG TAATTATTCG GATATTTACA AGTATCACTG TTTGAAGGGG GCTATTGTCA 660
AGCCAACTTG CAACACAGAA GCGTCCCCCT CAAGAGTTCT TCTGA 705