EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05676 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:7797988-7799390 
TF binding sites/motifs
Number: 34             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
JUN(var.2)MA0489.1chr18:7798186-7798200AAGAGATGAGTCAT+7.19
LMX1BMA0703.2chr18:7798529-7798540AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr18:7798350-7798361TTAATTAAATT-6.32
LMX1BMA0703.2chr18:7798532-7798543TTAATTAAAAT-6.62
Lhx3MA0135.1chr18:7798344-7798357AATTAATTAATTA-6.78
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Lhx3MA0135.1chr18:7798347-7798360TAATTAATTAAAT+6
NFE2MA0841.1chr18:7798190-7798201GATGAGTCATG-6.62
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PHOX2AMA0713.1chr18:7798351-7798362TAATTAAATTA-6.62
POU6F1MA0628.1chr18:7798345-7798355ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:7798345-7798355ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr18:7798351-7798362TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr18:7798528-7798539TAATTTAATTA-6.32
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PROP1MA0715.1chr18:7798351-7798362TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr18:7798528-7798539TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr18:7798351-7798362TAATTAAATTA-6.62
ZNF24MA1124.1chr18:7798750-7798763GAGTGAATGAGTG-6.01
ZNF24MA1124.1chr18:7798782-7798795GAATGAATGAACA-6.3
ZNF24MA1124.1chr18:7798818-7798831GAACGAATGAATG-6.46
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ZNF24MA1124.1chr18:7798746-7798759GAATGAGTGAATG-6.54
ZNF24MA1124.1chr18:7798834-7798847GAATGAATGAAAG-6.78
ZNF24MA1124.1chr18:7798742-7798755GAATGAATGAGTG-6.92
ZNF24MA1124.1chr18:7798646-7798659AAATGAATGAATG-7.34
ZNF24MA1124.1chr18:7798730-7798743AAATGAATGAATG-7.34
ZNF24MA1124.1chr18:7798650-7798663GAATGAATGAATA-7.52
ZNF24MA1124.1chr18:7798734-7798747GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:7798738-7798751GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:7798778-7798791GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:7798822-7798835GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:7798826-7798839GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr18:7798830-7798843GAATGAATGAATG-7.82
Enhancer Sequence
GCTCAGAGGG AATTATGGGA ATTGAAGTTC TAAGGAATGA TTAAAAAAAT TAAATCATTA 60
TTCAGAAAAG AAGAGACAAC AATAGACTTA CTTTGAGATT ATAGATGGGA AGAAATTATG 120
AATTAAGACA AACTGAGGCA AGAGAGATGA AAGGAAATAT ATATGATGAA ATGAAACGAG 180
AGATGAACAT GAAATGAAAA GAGATGAGTC ATGAAGACCA GATGAAAACA GAAAAAGGTA 240
AAAATAAAAA ACAAGTAAGA ATTAAATAAA GAAAAGAGAC ATGAGAAAAA GAAATGAAAT 300
GAGAATGAAG AAATCAGGAA GGGGCAGCGT AAAAATAAAT GATAAATAAA TAAATAAATT 360
AATTAATTAA ATTAAATTAC TAATTTAAAT AAAAGCAGAT GAGGCATAAT ATGAGTATTA 420
ACACATAAGT ATAAGTATTT AGTATAAGTA TTGACACACA GTATAAAAGA CAAGAAGTAA 480
TAAAAGAGAG AAAAAATAAA AATAAAATAA AATAAAATAA AATAAAATAA AAATTAAATT 540
TAATTTAATT AAAATTAAAT AAAATAAAAT TAAATAAAAT TAAAGAAGAT GAGGCATGAT 600
ATGAGAAACA ACCACTAACA GTATAACAGA CATGATAGAA TAAGAGAAAA AAGAAGGAAA 660
ATGAATGAAT GAATAAAAAT AACTTCAGAA AAGGGAGGAG GAAATAAAAC AAAATAAACA 720
GTATAACAGA TGAGAACACA TAAAATGAAT GAATGAATGA ATGAGTGAAT GAGTGAGTGA 780
GTGAATATGT GAATGAATGA ATGAACAAAC GAACGAACGA ACGAACGAAC GAACGAATGA 840
ATGAATGAAT GAATGAAAGA ATGAATAAAT GAAAGAAAAC AGCTAAAGAA AAGAGACAAG 900
AAGATGAAAA ATGGGATATA AATGAACAAA TCAGGAAGGA AGGGGAAAGA ATAAAATAGG 960
TTAATAAATA AATAAAGTTA AATAAAATTA AAATGATGAT ATGAGAAACA GAACTATTAA 1020
CAGTATAAGA GACAAGAAGA AACGAGAGAA AAATGAATTA ATGAAAATAG CTAAATAAAA 1080
TGAAGATAAA TAATATGTAA AATTTCTGTC ATGAAACTCT ATGTGCGCGC AGGCTGATAG 1140
GTTCACCTAA TCTGCTCCTG CGTCTTTAAC TATTTGGCGT ATGAGATTGG TTGCTGTCAC 1200
CCCGGCCACC AATGAGCTTG CTCCTCATCA GTTCAAATGC TCCACATTGT TTTACGGCGT 1260
TAAGCTGCGG CATGTTTTTA GGAAGACCCT CCTCCACCCC AGCTCCACCT GTGTTTAGAT 1320
CTTCTACGGG GCTTACATAT ATATTACGTT TGCAGCAGCA TCGTGTTATT TTCTCAGACG 1380
GCATGTCTGG GTATATACTG GC 1402