EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05656 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:5710872-5712719 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr18:5711070-5711089TGTCCAGCAGAGGGCGACA+7.02
PAX6MA0069.1chr18:5712507-5712521CACTGAAGCGTGAA-6.93
ZSCAN4MA1155.1chr18:5712563-5712578CACACACACTGAAAC+6.59
Enhancer Sequence
GGAAACCAGA GGAGACCCAC ACCAACACAG GGAGAACATG CAAACTCCAC ACAGAAACAC 60
CAACTGACCC AGCCGAGACT CGAACCAGTG ACCTTCTTGC TGTGAGGCCA CAGTGCTGAC 120
CACTGAGACA TTGTGCCTCC CATTCTTACT AGCTCTAATT TGAAAACACA GAGCATGGTT 180
CGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TCCAGCAGAG GGCGACACTG GACCACAGAT GTCAGCTCAG 240
TCCTGTAGAC TTAGTGAACA CCGAACTCCC ACAACCCCAA CAAGCTCAGC CGTGATCTGT 300
TGATGAGGCT CATGCACAAA CACTCACTCA TACACACACA CACACACACA CACACACACA 360
CAACACATAT GCACACATGC ACATGGACAC ACAGACTCAC ATGCACACAC ACACAAATAT 420
GCACACACAC ATCACATAAA TGCACGCAAA CACACACAGA CTTATGCACA CACACACACA 480
CACACACACA CACACACACA CTAATATACG CACACACACA CTCACACAGA CACACACACA 540
CTTGTGCATA AACAAACACA CACTCCATCA CACTCTCAAA CAACTGTGCA TGAACAAACA 600
CACACACGCA CACACACACA CACACATACA CACTTGTGCA TGAATGAACA CACACACAGA 660
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CTTGTGCATG AACACACACA 720
CACATGCACA CACATATGCA CATACACACA TGCACATGGA CACACACAAA TTCATCTGCA 780
CACACTCACT CATACACGCA CACAAACACA TTTGCGCATG GACACGGACA CACACACACA 840
CACACACACA AACACAAAGA CACACATACA CACACACATA AATGCACACA AACACATACA 900
CACATGCACA TATGCACACA TATACATATA CGCACACATG CACACACATA TGCACACACA 960
CATGCACATG AACACAGACT TATGCACACA CACTCACTCA AACACACACA CACAAATATG 1020
CACACACACA CTCACATCAC ATAAATGCAC GCAAACACAC ACACACACAC ATGCATATGG 1080
ACACACACAG ACTCATCTGC ACACACTCAC TCATACACAC ACACACACAC ACACACGCAC 1140
ACACACACGC ACACACACAC ACACACACCT CACATAAATG CATGCAAACA CACACACACA 1200
CACACACACA TGCACATAGA CACACACAGA TTTATGCACA CACACACAAC CACACACACA 1260
TACATGCACA CTCATATGCA CACACACACA CACACACACA TGCACATAGA CGCACACATC 1320
CTCATGCATG CACTCACAAA CACATCACAT AAATGCACGC AAACACATAA GCATATACAC 1380
ACAGACACAC ACACACACAC ACACACACTT AGTCAATCAC TCACGCACAC CCGGTTGATA 1440
AGAGCTTTGC ACGACATTCA TGCAACACAC ATTGTTCTGA TGCATACAAT GACCAAAACA 1500
CACACACACA CACACCCACA CACTCTCACT CTCACACACA CACCCACACA CTGAGGTGTA 1560
TGGATACACA CGCAAGGCTG AACCTGCTCG ACAGGCTGAA GCTCAGCTGT AAAATAAACT 1620
GTGCTGGAAG CAAATCACTG AAGCGTGAAC ATAACAACAC ACACACACAC ACACACACAC 1680
ACACACACAC ACACACACAC TGAAACTAAT ATCATTGATG GAGCTGCGCC ACTACACACA 1740
CACACACACA CACACACACA CCTTACACTT CACTAGTACC GGGTTGGACC CCTTTTGCCT 1800
TCAGATCTGT CTTAATCCTT CATGTCAGAG TTTCATCAAG CTACTGG 1847