EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05645 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:5454557-5456391 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr18:5456132-5456143TATGTAAATAT-6.62
FOXC1MA0032.2chr18:5456132-5456143TATGTAAATAT-6.62
Foxd3MA0041.1chr18:5455791-5455803GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:5455795-5455807GTTTGTTTGTTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:5455787-5455799GTATGTTTGTTT-6.37
Gfi1bMA0483.1chr18:5455273-5455284GGCTGTGATTT+6.02
Enhancer Sequence
CCCAGATGAG CGTCAGTCAG TCGGTGACGG GCTTCAGAAC CGGAGCAGCA CCGGATCATG 60
AGCGCTATCA CGGCCTCCTG ACAGCTGCAC GGCTCGGTTC CGGTGTCAGG GAGCGAGATG 120
GACGGCGGCG AGAGGAAGGT AATGCGGTTT AATGACATAC AATCGCTGGC GACAACCGCT 180
GGCGTCGCGT TAGCTTTAGC ATTAGCAGCG CTCTCGGGAT TAAAGTCCGT AACGGCGGAA 240
TAACCGATTA ATTCCTCGGT TAAACGCTCG CTCGTGTGTG AGGTGAGCGT TAGGTGTGTT 300
TCAGGGGTGT GTGTAATGGG TTTATTAGCA TTGACGCGAT GTTGAGAGCA TCAAAACAAT 360
GACGCTCCTG TTATGATCAA TTACCGCGAC TCATCGATTA TTAACACGCT CGTCGGTTAT 420
AACGGGTCGC GCAGCGGGTA TAAGCGCTTA TTACAGTATT GTGCTATTAC TCTTATGCTC 480
TAAGTGGTGT TAATCTGTGA TTAATATAGC GTTGAGTTGG GTATCAGCAC ACCTGAGGCT 540
GCAGGATCCA TCAGGAAACA GTATTGATCA TCCACTGCTG ACATATGACG AGAAACAATA 600
ACAGAAGGAT AATCACTCAT AAGAGATGCT CTGAGGTGCT GTTTGGAGTT TATTATTTTA 660
TGACCATCAT CAGAGCTCAG CGGTGATTGA ACACGAGCTC TGCTGTTAAG TCAAACGGCT 720
GTGATTTGAG CTGTTTTGGA CTGTTTACAT TAACAGCGAT GCTAAAACGT CAGTGAACTT 780
GGCTGCTGGA TGGTCTGGAG GTGTGTGTGT GTGTGTGAGA GAGAGTGTGT GTATGTGTTG 840
TGTGTGTGTT TGTATTTTGT GTTTGTGTGG GTAAGAGAGA GTGCGTGTTC GTGTATATTT 900
TGTATGTGTG CTTGTATGTA TGTGAGTGAA TGTGTGTGTT TGTGTGTGTG TTTGTATTTT 960
GTGTTTGTGT ATGTAAGAGA GTGTGTGTTT GTGTATGTTT TGTTTGTGTG CTTGTATGTA 1020
TGTGAGCGTA TGTGTGTAAG AGGTATGTAA ATGTGTGTGT GTATTTGTAT TTTGTGTTTG 1080
TGTATGTAAG AGAGTGCGTG GTTGTGTGCT TTGTTTGTGC CCTTGTATGT ATGTGAGCCA 1140
ATGCGTGTGT GAGAGTGTGT TTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1200
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTATGTAT GTATGTTTGT TTGTTTGTTT GTATGTAAGC 1260
GAGCGAGCGA GTGTGTGTGT GGAAAATAGT GTGTGTTTGT ATTTTGTGTT TGTGTATATA 1320
AGAGAGAGTG TGTTTTTGTG TATGTTTTGT TTGTATGCTT GTATGTATGT GAGCAATTGC 1380
GCGTGTGTGT GTGTGTGAGA GAGTGTGTTT GTTTGGGTAA GAGAAAGTGT GTGTTTGAGT 1440
GTTTTTTTGT GTGCTTGTTT GTATGTGAGC GAATGTGTGT GTGTGTGCGC GTGTGTGTGT 1500
GTGTGTATTT TGTGTTTTTG TGTGTATGAG AGAGTGTGTG TTTGTGTTTG TGCATTTTGT 1560
GTGTGTGTGT GTGAGTATGT AAATATGTAT GTGTGTGTAT GTATGAGCCG GTTTCTGATC 1620
AGACCTGATC CAGCAGGTTT TTCTGCATTG ATCACATCGC TGGCGTGTGT GTGATGTTTC 1680
TGTCTGTCGT CAGATCAGTT TCTGAGTTTC TCCTGCTGTT TCCTGTGCGA TTCTTCTCCT 1740
GTCACTGAAC TACTTCTCCA AAGTGAGTGT GTTTGTGTGT GTTTGTCATC TCTAACAGGT 1800
CTGTTTGTTT TGAAAGTGGG CATTAATTGT ATGT 1834